| 中文摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 人参红皮病概述 | 第11-14页 |
| 1.1.1 人参红皮病的研究进展 | 第11-12页 |
| 1.1.2 人参红皮病的发病原因 | 第12-13页 |
| 1.1.3 人参红皮病的防治措施 | 第13-14页 |
| 1.2 转录组概述 | 第14-15页 |
| 1.3 立题依据与研究思路 | 第15-16页 |
| 第2章 实验研究 | 第16-28页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 实验材料、试剂与仪器 | 第16-17页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第16-17页 |
| 2.2.2 主要试剂与仪器 | 第17页 |
| 2.3 人参总RNA的提取分离纯化 | 第17-18页 |
| 2.3.1 人参总RNA的提取 | 第17-18页 |
| 2.3.2 破碎和纯化mRNA | 第18页 |
| 2.4 cDNA文库的建立 | 第18-21页 |
| 2.4.1 合成一链cDNA | 第18页 |
| 2.4.2 合成二链cDNA | 第18-19页 |
| 2.4.3 腺苷酸3’端终止 | 第19页 |
| 2.4.4 末端修复 | 第19页 |
| 2.4.5 富集DNA片段 | 第19-20页 |
| 2.4.6 产生cDNA文库 | 第20页 |
| 2.4.7 文库质检 | 第20页 |
| 2.4.8 IlluminaHiSeqTM2500测序 | 第20-21页 |
| 2.5 生物信息学分析 | 第21-28页 |
| 2.5.1 测序数据质量评估 | 第21-23页 |
| 2.5.2 Reads污染检测 | 第23页 |
| 2.5.3 Denovo拼接 | 第23页 |
| 2.5.4 Unigene注释 | 第23-25页 |
| 2.5.5 差异表达Unigene分析 | 第25-28页 |
| 第3章 实验结果 | 第28-36页 |
| 3.1 Denovo拼接 | 第28-29页 |
| 3.2 Unigene注释 | 第29-30页 |
| 3.3 Unigene的KOG分类 | 第30-31页 |
| 3.4 Unigene的GO注释 | 第31-32页 |
| 3.5 差异表达Unigene分析 | 第32-36页 |
| 3.5.1 差异表达分析 | 第32-33页 |
| 3.5.2 GO富集分析 | 第33-34页 |
| 3.5.3 KEGG富集分析 | 第34-36页 |
| 第4章 讨论 | 第36-39页 |
| 4.1 病原相关基因的表达 | 第36-37页 |
| 4.2 无机元素吸收 | 第37-38页 |
| 4.3 与AM相关基因的表达 | 第38页 |
| 4.4 其他 | 第38-39页 |
| 第5章 研究总结 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-46页 |
| 致谢 | 第46页 |