| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 1 前言 | 第11-23页 |
| 1.1 砷的概述 | 第11页 |
| 1.2 微生物的砷抗性 | 第11-13页 |
| 1.3 微生物的调控 | 第13-14页 |
| 1.4 微生物的砷氧化及调控 | 第14-16页 |
| 1.5 砷氧化与能量代谢 | 第16-17页 |
| 1.6 砷与磷的相关性 | 第17-19页 |
| 1.7 细菌的趋化 | 第19-20页 |
| 1.8 差异蛋白质组学检测细菌对砷的响应 | 第20-21页 |
| 1.9 本研究的主要内容、拟解决的科学问题和技术路线 | 第21-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-42页 |
| 2.1 实验菌株及培养条件 | 第23-30页 |
| 2.2 AioR结合位点的预测 | 第30页 |
| 2.3 突变株及互补株的构建 | 第30-32页 |
| 2.4 趋化实验 | 第32-33页 |
| 2.5 蛋白质的诱导表达与纯化 | 第33-34页 |
| 2.6 色氨酸荧光光谱法 | 第34-35页 |
| 2.7 生长和砷氧化曲线的测定 | 第35页 |
| 2.8 报告基因实验 | 第35-36页 |
| 2.9 荧光定量qRT-PCR | 第36-37页 |
| 2.10 细菌单杂交实验 | 第37-38页 |
| 2.11 凝胶迁移率实验(EMSA) | 第38-39页 |
| 2.12 DNA足迹实验 | 第39页 |
| 2.13 iTRAQ蛋白质组学实验 | 第39-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-75页 |
| 3.1 mcp基因的分析及AioR结合位点的预测 | 第42-44页 |
| 3.2 As(III)趋化受体蛋白的功能鉴定 | 第44-49页 |
| 3.2.1 mcp及aioR基因突变株及互补株的构建 | 第44-46页 |
| 3.2.2 mcp与aioR突变株及互补株的趋化表型 | 第46-47页 |
| 3.2.3 Mcp与As(III)的特异性结合 | 第47-49页 |
| 3.3 砷趋化、砷氧化及砷抗性的相关性 | 第49-52页 |
| 3.4 细菌砷趋化的调控 | 第52-58页 |
| 3.4.1 mcp与趋化基因的诱导表达 | 第52-53页 |
| 3.4.2 细菌单杂交验证AioR与mcp启动子的互作 | 第53-54页 |
| 3.4.3 凝胶迁移率实验验证AioR与mcp启动子互作 | 第54-56页 |
| 3.4.4 DNA足迹法确定AioR的结合位点 | 第56-58页 |
| 3.5 iTRAQ差异蛋白质组学分析 | 第58-61页 |
| 3.6 全基因组筛选AioR的结合位点 | 第61-65页 |
| 3.7 相关基因的共转录及表达 | 第65页 |
| 3.8 AioR的调控功能 | 第65-75页 |
| 3.8.1 砷氧化 | 第65-67页 |
| 3.8.2 砷趋化 | 第67页 |
| 3.8.3 砷抗性 | 第67-69页 |
| 3.8.3.1 砷的外排 | 第67-68页 |
| 3.8.3.2 细胞壁的合成 | 第68-69页 |
| 3.8.3.3 脯氨酸合成及PIMT修复蛋白 | 第69页 |
| 3.8.4 磷酸盐转运系统 | 第69-70页 |
| 3.8.5 碳代谢与能量代谢 | 第70-73页 |
| 3.8.5.1 碳代谢 | 第70-71页 |
| 3.8.5.2 能量代谢 | 第71-73页 |
| 3.8.6 其他代谢路径 | 第73-75页 |
| 4 讨论 | 第75-82页 |
| 4.1 砷氧化调控蛋白AioR调控细菌对As(III)的趋化 | 第75-76页 |
| 4.2 砷氧化与砷趋化具有紧密的相关性 | 第76-77页 |
| 4.3 AioR调控多重砷抗性机制 | 第77页 |
| 4.4 砷磷共调控机制 | 第77-79页 |
| 4.5 异养砷氧化细菌的能量代谢 | 第79-80页 |
| 4.6 AioR在细菌GW4适应砷环境的重要意义 | 第80-81页 |
| 4.7 结论 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 附录 | 第92-108页 |
| 发表及待发表相关论文 | 第108-109页 |
| 作者简介 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
