| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第15-32页 |
| 1 引言 | 第15-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第15页 |
| 1.2 研究意义 | 第15-16页 |
| 2 国内外研究进展 | 第16-28页 |
| 2.1 植物响应盐胁迫的生理生化指标及形态结构变化的研究 | 第16-22页 |
| 2.1.1 盐胁迫对植物光合作用的影响 | 第16-18页 |
| 2.1.2 盐胁迫下植物的解毒抗氧化作用 | 第18-20页 |
| 2.1.3 盐胁迫下植物渗透调节物质积累 | 第20-22页 |
| 2.2 植物响应盐胁迫的转录组研究 | 第22-23页 |
| 2.3 植物响应盐胁迫的蛋白质组研究 | 第23-25页 |
| 2.4 红树植物耐盐机制研究进展 | 第25-28页 |
| 2.4.1 生理生态学研究 | 第26-27页 |
| 2.4.2 分子生物学研究 | 第27-28页 |
| 3 存在的问题 | 第28-29页 |
| 4 本论文研究内容及技术路线 | 第29-32页 |
| 4.1 研究内容 | 第29-31页 |
| 4.2 技术路线 | 第31-32页 |
| 第二章 秋茄响应盐胁迫的叶绿体蛋白质组研究 | 第32-57页 |
| 1 试验材料和方法 | 第32-38页 |
| 1.1 试验材料 | 第32页 |
| 1.2 试验方法 | 第32-38页 |
| 1.2.1 光合作用与荧光参数测定 | 第32页 |
| 1.2.2 透射电镜(TEM)样品制备及叶绿体超微结构观察 | 第32页 |
| 1.2.3 完整叶绿体分离 | 第32-33页 |
| 1.2.4 叶绿体纯度检测 | 第33-34页 |
| 1.2.5 叶绿体总蛋白质的提取 | 第34页 |
| 1.2.6 SDS-PAGE电泳检测样品平行度 | 第34页 |
| 1.2.7 FASP酶解及iTRAQ标记 | 第34-35页 |
| 1.2.8 强阳离子交换(Strong cation exchange, SCX)分级 | 第35页 |
| 1.2.9 毛细管高效液相色谱 | 第35-36页 |
| 1.2.10 Q-Exactive质谱仪进行LC-ESI-MS/MS质谱分析 | 第36页 |
| 1.2.11 数据库查询及蛋白质鉴定和定量 | 第36-37页 |
| 1.2.12 叶绿体差异表达蛋白聚类分析 | 第37页 |
| 1.2.13 Western blot验证 | 第37-38页 |
| 1.2.14 统计分析 | 第38页 |
| 2 试验结果 | 第38-52页 |
| 2.1 秋茄响应盐胁迫的光合作用及荧光参数的变化 | 第38-39页 |
| 2.2 秋茄响应盐胁迫的叶绿体超微结构变化 | 第39-40页 |
| 2.3 叶绿体纯度分析 | 第40-41页 |
| 2.4 样品平行度 | 第41-42页 |
| 2.5 蛋白质鉴定 | 第42-43页 |
| 2.5.1 鉴定基本信息 | 第42页 |
| 2.5.2 蛋白质相对分子质量分布情况统计 | 第42-43页 |
| 2.6 差异蛋白功能分析 | 第43-50页 |
| 2.7 差异蛋白表达模式聚类分析 | 第50-51页 |
| 2.8 Western blot验证分析 | 第51-52页 |
| 3 讨论 | 第52-55页 |
| 3.1 光合作用的光反应相关蛋白 | 第52-54页 |
| 3.2 光合作用的碳反应相关蛋白 | 第54-55页 |
| 3.3 光合作用光反应和碳反应的平衡 | 第55页 |
| 4 小结 | 第55-57页 |
| 第三章 秋茄响应盐胁迫的叶片转录组和蛋白质组研究 | 第57-89页 |
| 1 试验材料与方法 | 第57-65页 |
| 1.1 试验材料 | 第57页 |
| 1.2 试验方法 | 第57-65页 |
| 1.2.1 秋茄叶片总RNA提取 | 第57页 |
| 1.2.2 RNA质量检测 | 第57-58页 |
| 1.2.3 cDNA文库构建及Illumina HiSeq~(TM) 2000测序 | 第58页 |
| 1.2.4 Clean reads数据处理 | 第58页 |
| 1.2.5 组装结果分析 | 第58页 |
| 1.2.6 Unigene功能注释 | 第58页 |
| 1.2.7 Unigene的GO功能分析和KEGG pathway分析 | 第58-59页 |
| 1.2.8 差异基因分析 | 第59页 |
| 1.2.9 秋茄叶片总蛋白质的提取 | 第59页 |
| 1.2.10 蛋白浓度测定 | 第59页 |
| 1.2.11 蛋白酶解及iTRAQ标记 | 第59-60页 |
| 1.2.13 LC-ESI-MS/MS质谱分析 | 第60页 |
| 1.2.14 数据库选择与Mascot搜索 | 第60-61页 |
| 1.2.15 RT-PCR和qRT-PCR验证分析 | 第61-65页 |
| 2 试验结果 | 第65-80页 |
| 2.1 总RNA质量检测 | 第65-66页 |
| 2.2 测序评估 | 第66-67页 |
| 2.2.1 产量统计 | 第66页 |
| 2.2.2 组装结果统计 | 第66-67页 |
| 2.3 Unigene功能注释 | 第67页 |
| 2.4 差异表达基因 | 第67-68页 |
| 2.5 差异表达基因的GO分类 | 第68-69页 |
| 2.6 差异表达基因的Pathway富集分析 | 第69-73页 |
| 2.7 蛋白质鉴定 | 第73-75页 |
| 2.7.1 鉴定基本信息 | 第73页 |
| 2.7.2 蛋白质相对分子质量分布情况统计 | 第73页 |
| 2.7.3 肽段序列长度分布情况 | 第73页 |
| 2.7.4 肽段序列覆盖度 | 第73-74页 |
| 2.7.5 Unique肽段数量分布 | 第74-75页 |
| 2.8 差异蛋白筛选 | 第75-76页 |
| 2.9 RT-PCR和qRT-PCR验证 | 第76-80页 |
| 3 讨论 | 第80-88页 |
| 3.1 秋茄耐盐性与苯丙烷代谢 | 第81-82页 |
| 3.2 秋茄耐盐性与氨基酸代谢 | 第82-85页 |
| 3.3 秋茄耐盐性与DNA复制和修复 | 第85页 |
| 3.4 IP_3-Ca~(2+)信号转导通路介导GABA含量积累 | 第85-86页 |
| 3.5 蛋白组与转录组的关联分析 | 第86-88页 |
| 4 小结 | 第88-89页 |
| 第四章 秋茄响应盐胁迫的叶片生理生化指标研究 | 第89-107页 |
| 1 试验材料与方法 | 第89-95页 |
| 1.1 试验材料 | 第89页 |
| 1.2 试验方法 | 第89-94页 |
| 1.2.1 秋茄叶片离子含量测定 | 第89页 |
| 1.2.2 秋茄叶片H_2O_2和O_2~-测定 | 第89-90页 |
| 1.2.3 秋茄叶片抗氧化酶活性测定 | 第90页 |
| 1.2.4 秋茄叶片GSH含量测定 | 第90-91页 |
| 1.2.5 秋茄叶片谷氨酸脱羧酶(GAD)活性测定 | 第91页 |
| 1.2.6 秋茄叶片游离氨基酸含量测定 | 第91页 |
| 1.2.7 秋茄叶片苯丙烷代谢途径关键酶活性测定 | 第91-92页 |
| 1.2.8 秋茄叶片苯丙烷代谢途径相关物质含量测定 | 第92-94页 |
| 1.2.9 秋茄叶片碳水化合物含量测定 | 第94页 |
| 1.3 统计分析 | 第94-95页 |
| 2 试验结果 | 第95-102页 |
| 2.1 秋茄响应盐胁迫的叶片离子含量变化 | 第95页 |
| 2.2 秋茄响应盐胁迫的叶片H_2O_2和O_2~-含量变化 | 第95-96页 |
| 2.3 秋茄响应盐胁迫的叶片抗氧化酶活性变化 | 第96-97页 |
| 2.4 秋茄响应盐胁迫的GSH含量变化 | 第97页 |
| 2.5 秋茄响应盐胁迫的GAD活性的变化 | 第97-98页 |
| 2.6 秋茄响应盐胁迫的叶片氨基酸含量变化 | 第98-99页 |
| 2.7 秋茄响应盐胁迫的叶片苯丙烷代谢途径关键酶活性变化 | 第99-100页 |
| 2.8 秋茄响应盐胁迫的叶片苯丙烷代谢途径相关代谢产物含量变化 | 第100-101页 |
| 2.9 秋茄响应盐胁迫的叶片碳水化合物含量变化 | 第101-102页 |
| 3 讨论 | 第102-105页 |
| 4 小结 | 第105-107页 |
| 第五章 结论与展望 | 第107-109页 |
| 1 结论 | 第107-108页 |
| 2 展望 | 第108-109页 |
| 本论文的创新点 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-127页 |
| 附录 | 第127-136页 |
| 致谢 | 第136-137页 |
| 博士期间发表的相关论文 | 第137页 |
