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路易斯安那鸢尾铅耐性机理及相关基因挖掘研究

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-14页
引言第14-15页
第一章 文献综述第15-41页
    1 重金属铅污染现状和危害第15-16页
    2 植物修复及铅超富集植物第16-22页
        2.1 超富集植物和植物修复的概念与发展第16-17页
        2.2 铅超富集植物第17-22页
    3 植物富集和耐铅机理第22-34页
        3.1 铅胁迫对植物生长发育和生理生化的影响第22-27页
            3.1.1 生长发育第22-23页
            3.1.2 水分代谢第23页
            3.1.3 矿质代谢第23-24页
            3.1.4 光合作用第24页
            3.1.5 呼吸作用第24-25页
            3.1.6 抗氧化系统第25-26页
            3.1.7 植物渗透调节物质和蛋白质、核酸代谢第26-27页
        3.2 铅的吸收、转运和向地上部运输第27-28页
        3.3 铅的区域化隔离第28-30页
            3.3.1 细胞壁固定第29-30页
            3.3.2 液泡的积累作用第30页
        3.4 铅耐受蛋白和基因第30-34页
            3.4.1 铅耐受相关螯合蛋白和基因第31-32页
            3.4.2 铅耐受相关转运蛋白和基因第32-34页
            3.4.3 其它相关蛋白和基因第34页
    4 转录组学相关研究进展第34-37页
        4.1 转录组含义和发展第34-35页
        4.2 转录组测序技术在植物重金属等胁迫研究第35-37页
    5 鸢尾属植物铅等重金属胁迫相关研究进展第37-38页
    6 本研究的目的和主要研究内容第38-41页
第二章 路易斯安那鸢尾铅耐性及富集特性分析第41-55页
    1 材料与方法第42-45页
        1.1 试验材料第42-43页
        1.2 试验方法第43-44页
        1.3 测定指标及方法第44-45页
            1.3.1 株高、根长的测定第44页
            1.3.2 根系、根状茎、叶的鲜重和干重的测定第44页
            1.3.3 铅含量的测定和相关指标计算第44页
            1.3.4 结构观察第44-45页
        1.4 数据分析第45页
    2 结果与分析第45-53页
        2.1 路易斯安那鸢尾铅耐性品种筛选第45页
        2.2 铅胁迫对路易斯安那鸢尾生长的影响第45页
        2.3 铅胁迫对路易斯安那鸢尾生物量的影响第45-48页
        2.4 铅在路易斯安那鸢尾不同器官的富集与分布第48-50页
        2.5 铅在根尖和叶片亚细胞结构中的分布及富集特性第50-53页
    3 讨论第53-55页
第三章 路易斯安那鸢尾对铅胁迫的生理响应第55-67页
    1 材料与方法第56-57页
        1.1 试验材料第56页
        1.2 试验方法第56页
        1.3 测定指标及方法第56-57页
            1.3.1 叶绿素、丙二醛、脯氨酸含量和抗氧化酶活性的测定第56-57页
            1.3.2 谷胱甘肽和半胱氨酸含量的测定第57页
        1.4 数据分析第57页
    2 结果与分析第57-65页
        2.1 铅胁迫对植株叶片叶绿素含量的影响第57-58页
        2.2 铅胁迫对植株根系和叶片的丙二醛含量的影响第58-59页
        2.3 铅胁迫对植株根系和叶片的脯氨酸含量的影响第59-60页
        2.4 铅胁迫对植株根系和叶片的抗氧化酶活性的影响第60-62页
        2.5 铅胁迫对植株根系和叶片O_2~-产生速率的影响第62页
        2.6 铅胁迫对植株根系和叶片中巯基化合物含量的影响第62-65页
    3 讨论第65-67页
第四章 铅胁迫下路易斯安那鸢尾根转录组分析第67-91页
    1 材料与方法第68-71页
        1.1 试验材料第68页
        1.2 试验方法第68-71页
            1.2.1 植物材料培养与Pb处理第68页
            1.2.2 RNA提取第68页
            1.2.3 mRNA的分离、cDNA文库的构建和Illumina测序第68-69页
            1.2.4 转录组测序数据的预处理、de novo拼接和注释第69-70页
            1.2.5 差异基因表达分析第70-71页
            1.2.6 实时荧光定量验证转录水平第71页
    2 结果与分析第71-88页
        2.1 Reads质量预处理第71-72页
        2.2 Reads的污染检测第72页
        2.3 De novo拼接第72-74页
        2.4 Unigene与公共数据库注释第74-75页
        2.5 Unigene的KOG分类第75-76页
        2.6 Unigene的KEGG注释第76-77页
        2.7 Unigene的GO注释第77-79页
        2.8 Transcript的表达丰度第79-80页
        2.9 SNV分析第80页
        2.10 差异表达转录本分析第80-81页
        2.11 差异表达转录本注释和KEGG代谢通路分析第81-86页
        2.12 差异表达基因qPCR验证第86-88页
    3 讨论第88-91页
第五章 路易斯安那鸢尾LiPCS1基因的克隆和表达分析第91-107页
    1 材料与方法第92-96页
        1.1 试验材料第92页
        1.2 试验方法第92-95页
            1.2.1 路易斯安那鸢尾LiPCS1基因克隆第92-94页
            1.2.2 路易斯安那鸢尾LiPCS1编码蛋白和生物信息学分析第94页
            1.2.3 路易斯安那鸢尾LiPCS1实时荧光定量PCR第94-95页
        1.3 数据分析第95-96页
    2 结果与分析第96-104页
        2.1 路易安那鸢尾LiPCS1基因全长及生物学信息分析第96-101页
            2.1.1 基因全长及编码蛋白质第96-97页
            2.1.2 LiPCS1蛋白质二级结构、跨膜结构和三维结构分析第97-98页
            2.1.3 LiPCS1蛋白质保守性及进化树分析第98-101页
        2.2 路易斯安那鸢尾LiPCS1在不同组织的表达特性分析第101-102页
            2.2.1 总RNA的提取、纯化及cDNA的合成第101-102页
            2.2.2 路易斯安那鸢尾LiPCS1在不同组织中的表达模式第102页
        2.3 路易斯安那鸢尾LiPCS1响应Pb胁迫的表达特性分析第102-104页
            2.3.1 总RNA的提取、纯化及cDNA的合成第102页
            2.3.2 路易斯安那鸢尾LiPCS1在不同组织和铅处理时间中的表达模式.第102-104页
    3 讨论第104-107页
第六章 路易斯安那鸢尾LiNramp基因的克隆和表达分析第107-133页
    1 材料与方法第108-110页
        1.1 试验材料第108页
        1.2 试验方法第108-110页
            1.2.1 路易斯安那鸢尾LiNramp家族基因克隆第108-110页
            1.2.2 路易斯安那鸢尾LiNramp家族基因编码蛋白和生物信息学分析第110页
            1.2.3 路易斯安那鸢尾LiNramp家族在不同组织以及响应铅胁迫的表达特性分析第110页
        1.3 数据分析第110页
    2 结果与分析第110-131页
        2.1 路易斯安那鸢尾LiNramp基因生物学信息分析第110-128页
            2.1.1 LiNramp2基因全长及生物学信息分析第110-115页
            2.1.2 LiNramp3基因全长及生物学信息分析第115-119页
            2.1.3 LiNramp5基因全长及生物学信息分析第119-123页
            2.1.4 LiNramp6基因全长及生物学信息分析第123-127页
            2.1.5 路易斯安那鸢尾LiNramp基因家族内关系分析第127-128页
        2.3 路易斯安那鸢尾LiNramp家族在不同组织的表达特性分析第128页
        2.4 路易斯安那鸢尾LiNramp家族响应铅胁迫的表达特性分析第128-131页
    3 讨论第131-133页
全文结论第133-135页
论文创新点第135-137页
参考文献第137-167页
附录第167-175页
    附录一 用于鸢尾属植物水培的改良1/2Hoagland营养液配制方法第167-168页
    附录二 试剂盒提取RNA操作过程第168-169页
    附录三 消化基因组DNA与第一链cDNA合成第169-170页
    附录四 RNA-Seq测序实验流程第170-172页
    附录五 DNA凝胶回收试剂盒第172-173页
    附录六 3'RACE第173-174页
    附录七 5'RACE第174-175页
攻读学位期间发表论文、审定新品种及参与科研项目情况第175-177页
致谢第177页

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