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基于复杂网络的人类视网膜色素变性的位点基因型相互作用网络构建及相关性分析

摘要第2-3页
Abstract第3页
第1章 引言第6-12页
    1.1 选题目的和意义第6页
    1.2 国内外研究现状第6-10页
        1.2.1 网络生物学第6-8页
        1.2.2 生物信息学第8-9页
        1.2.3 网络模体检测第9-10页
    1.3 论文研究的主要内容第10-12页
第2章 基础理论及数据第12-21页
    2.1 关联规则算法第12-16页
        2.1.1 关联规则算法的度量第12-13页
        2.1.2 Apriori算法及其改进算法第13-16页
    2.2 复杂网络拓扑性质第16-18页
        2.2.1 度中心性第16页
        2.2.2 介数中心性第16-17页
        2.2.3 聚类系数第17页
        2.2.4 模体第17-18页
    2.3 数据介绍第18-20页
    2.4 小结第20-21页
第3章 表型与位点基因型间关联规则高效挖掘算法研究第21-30页
    3.1 问题引出第21页
    3.2 基于Apriori算法的关联规则高效挖掘算法第21-26页
        3.2.1 匹配度指标第21-22页
        3.2.2 并行化改进第22-25页
        3.2.3 算法性能分析第25-26页
    3.3 仿真结果与分析第26-28页
    3.4 小结第28-30页
第4章 基于位点基因型相互作用网络的人类视网膜色素变性研究第30-37页
    4.1 问题引出第30页
    4.2 位点基因型相互作用发现及相互作用网络构建第30-32页
        4.2.1 位点基因型相互作用关系发现第30-31页
        4.2.2 位点基因型间相互作用网络构建第31-32页
    4.3 数据预处理第32-34页
    4.4 病例与对照组位点基因型相互作用网络对比分析第34-36页
        4.4.1 节点统计差异分析第34-35页
        4.4.2 节点网络拓扑性质统计差异分析第35-36页
    4.5 小结第36-37页
第5章 基于位点基因型相互作用网络的发病机理提取第37-44页
    5.1 问题引出第37页
    5.2 发病机理提取第37-42页
        5.2.1 网络模体提取第37-39页
        5.2.2 开关连接和保守连接提取第39-42页
    5.3 结果分析第42-43页
    5.4 小结第43-44页
第6章 总结与展望第44-45页
参考文献第45-49页
攻读学位期间的研究成果第49-50页
致谢第50-51页

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