摘要 | 第2-3页 |
Abstract | 第3页 |
第1章 引言 | 第6-12页 |
1.1 选题目的和意义 | 第6页 |
1.2 国内外研究现状 | 第6-10页 |
1.2.1 网络生物学 | 第6-8页 |
1.2.2 生物信息学 | 第8-9页 |
1.2.3 网络模体检测 | 第9-10页 |
1.3 论文研究的主要内容 | 第10-12页 |
第2章 基础理论及数据 | 第12-21页 |
2.1 关联规则算法 | 第12-16页 |
2.1.1 关联规则算法的度量 | 第12-13页 |
2.1.2 Apriori算法及其改进算法 | 第13-16页 |
2.2 复杂网络拓扑性质 | 第16-18页 |
2.2.1 度中心性 | 第16页 |
2.2.2 介数中心性 | 第16-17页 |
2.2.3 聚类系数 | 第17页 |
2.2.4 模体 | 第17-18页 |
2.3 数据介绍 | 第18-20页 |
2.4 小结 | 第20-21页 |
第3章 表型与位点基因型间关联规则高效挖掘算法研究 | 第21-30页 |
3.1 问题引出 | 第21页 |
3.2 基于Apriori算法的关联规则高效挖掘算法 | 第21-26页 |
3.2.1 匹配度指标 | 第21-22页 |
3.2.2 并行化改进 | 第22-25页 |
3.2.3 算法性能分析 | 第25-26页 |
3.3 仿真结果与分析 | 第26-28页 |
3.4 小结 | 第28-30页 |
第4章 基于位点基因型相互作用网络的人类视网膜色素变性研究 | 第30-37页 |
4.1 问题引出 | 第30页 |
4.2 位点基因型相互作用发现及相互作用网络构建 | 第30-32页 |
4.2.1 位点基因型相互作用关系发现 | 第30-31页 |
4.2.2 位点基因型间相互作用网络构建 | 第31-32页 |
4.3 数据预处理 | 第32-34页 |
4.4 病例与对照组位点基因型相互作用网络对比分析 | 第34-36页 |
4.4.1 节点统计差异分析 | 第34-35页 |
4.4.2 节点网络拓扑性质统计差异分析 | 第35-36页 |
4.5 小结 | 第36-37页 |
第5章 基于位点基因型相互作用网络的发病机理提取 | 第37-44页 |
5.1 问题引出 | 第37页 |
5.2 发病机理提取 | 第37-42页 |
5.2.1 网络模体提取 | 第37-39页 |
5.2.2 开关连接和保守连接提取 | 第39-42页 |
5.3 结果分析 | 第42-43页 |
5.4 小结 | 第43-44页 |
第6章 总结与展望 | 第44-45页 |
参考文献 | 第45-49页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第49-50页 |
致谢 | 第50-51页 |