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石刁柏核基因组NUPTs组成和染色体定位研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
缩略语表(Abbreviation)第10-11页
1 前言第11-15页
    1.1 植物基因组中NUPTs的起源第11页
    1.2 NUPTs在植物染色体上的分布特征第11-13页
    1.3 NUPTs插入对植物染色体结构的影响第13-14页
    1.4 研究的目的及意义第14-15页
2 材料与方法第15-23页
    2.1 材料第15-16页
        2.1.1 植物材料第15页
        2.1.2 主要仪器设备第15页
        2.1.3 主要实验试剂第15页
        2.1.4 常用溶液配方第15-16页
    2.2 方法第16-23页
        2.2.1 石刁柏基因组NUPTs生物信息学分析第16-17页
        2.2.2 石刁柏总DNA的提取及检测第17页
        2.2.3 石刁柏叶绿体基因组探针序列的扩增和纯化第17-20页
        2.2.4 石刁柏叶绿体DNA荧光原位杂交探针制备第20页
        2.2.5 石刁柏中期染色体标本的制备第20-21页
        2.2.6 石刁柏NUPTs的中期染色体FISH杂交及分析第21-23页
3 结果与分析第23-41页
    3.1 石刁柏基因组中NUPTs序列及分布的生物信息学分析第23-27页
        3.1.1 石刁柏基因组NUPTs在染色体上的长度分布模式第23-24页
        3.1.2 石刁柏基因组NUPTs、基因及转座子的染色体分布分析第24-27页
        3.1.3 石刁柏核基因组NUPTs来源分析第27页
    3.2 石刁柏基因组总DNA提取及检测质量第27-28页
    3.3 石刁柏叶绿体探针序列的PCR扩增第28-29页
    3.4 石刁柏叶绿体序列来源的探针中期染色体FISH定位分析第29-37页
        3.4.1 在全部染色体上有弥散分布的NUPTs中期染色体FISH第30-31页
        3.4.2 在染色体着丝粒及其侧翼区分布的NUPTs中期染色体FISH第31-34页
        3.4.3 在特异染色体上分布的NUPTs中期染色体FISH第34-37页
    3.5 石刁柏叶绿体序列来源的探针细胞间期FISH定位分析第37-41页
        3.5.1 在全部染色体上有弥散分布的NUPTs细胞间期FISH第37页
        3.5.2 着丝粒及其侧翼区分布的NUPTs间期FISH分析第37-38页
        3.5.3 在特异染色体上分布的NUPTs细胞间期FISH第38-41页
4 讨论第41-45页
    4.1 NUPTs更易插入和累积在染色体的着丝粒位置第42页
    4.2 叶绿体基因组中IR区更易向核基因组转移形成NUPTs第42-45页
参考文献第45-51页
附录 实验中主要试剂配方第51-52页
攻读学位期间发表的学术论文目录第52-53页
致谢第53-55页

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