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内含子保留型可变剪接预测及可变剪接与蛋白质结构多样性分析

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
1 引言第8-21页
    1.1 可变剪接位点预测现状第8-13页
        1.1.1 实验方法识别剪接位点第8-10页
        1.1.2 理论预测方法介绍第10-12页
        1.1.3 可变剪接的类型第12-13页
    1.2 可变剪接和蛋白质结构多样性的研究现状第13-16页
        1.2.1 可变剪接机制第13-15页
        1.2.2 蛋白质结构第15页
        1.2.3 可变剪接和蛋白质结构多样性之间的关系第15-16页
    1.3 数据库介绍第16-18页
        1.3.1 可变剪接数据库第16-17页
        1.3.2 蛋白质三维结构数据库(PDB 数据库)第17-18页
    1.4 本文的研究内容及意义第18-19页
    1.5 技术路线第19-21页
2 基于序列信息的内含子保留可变剪接位点预测第21-30页
    2.1 材料和方法第21-23页
        2.1.1 数据集的构建第21页
        2.1.2 选取特征参数第21-22页
        2.1.3 多样性指标(ID)第22页
        2.1.4 贝叶斯二次判别函数第22-23页
        2.1.5 评价指标第23页
    2.2 结果与讨论第23-27页
        2.2.1 内含子保留的长度统计分析结果第23-24页
        2.2.2 序列特征的初步分析第24-27页
        2.2.3 预测结果分析第27页
    2.3 本章小结第27-30页
3 可变剪接和蛋白质结构多样性的相关性分析第30-40页
    3.1 材料和方法第31-35页
        3.1.1 数据库的构建第31-33页
        3.1.2 均方根偏差(RMSD)分析第33页
        3.1.3 蛋白质的结构稳定性分析第33-34页
        3.1.4 蛋白质序列的多样性增量(ID)第34页
        3.1.5 疏水非均一性分析(HI)第34-35页
    3.2 结果与讨论第35-38页
        3.2.1 疾病与非疾病蛋白质结构差异的分析第35页
        3.2.2 疾病与非疾病蛋白质的稳定性分析第35-37页
        3.2.3 可变剪接偏好性分析第37-38页
    3.3 本章小结第38-40页
结论第40-42页
参考文献第42-50页
在学研究成果第50-51页
致谢第51页

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