摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
1 引言 | 第8-21页 |
1.1 可变剪接位点预测现状 | 第8-13页 |
1.1.1 实验方法识别剪接位点 | 第8-10页 |
1.1.2 理论预测方法介绍 | 第10-12页 |
1.1.3 可变剪接的类型 | 第12-13页 |
1.2 可变剪接和蛋白质结构多样性的研究现状 | 第13-16页 |
1.2.1 可变剪接机制 | 第13-15页 |
1.2.2 蛋白质结构 | 第15页 |
1.2.3 可变剪接和蛋白质结构多样性之间的关系 | 第15-16页 |
1.3 数据库介绍 | 第16-18页 |
1.3.1 可变剪接数据库 | 第16-17页 |
1.3.2 蛋白质三维结构数据库(PDB 数据库) | 第17-18页 |
1.4 本文的研究内容及意义 | 第18-19页 |
1.5 技术路线 | 第19-21页 |
2 基于序列信息的内含子保留可变剪接位点预测 | 第21-30页 |
2.1 材料和方法 | 第21-23页 |
2.1.1 数据集的构建 | 第21页 |
2.1.2 选取特征参数 | 第21-22页 |
2.1.3 多样性指标(ID) | 第22页 |
2.1.4 贝叶斯二次判别函数 | 第22-23页 |
2.1.5 评价指标 | 第23页 |
2.2 结果与讨论 | 第23-27页 |
2.2.1 内含子保留的长度统计分析结果 | 第23-24页 |
2.2.2 序列特征的初步分析 | 第24-27页 |
2.2.3 预测结果分析 | 第27页 |
2.3 本章小结 | 第27-30页 |
3 可变剪接和蛋白质结构多样性的相关性分析 | 第30-40页 |
3.1 材料和方法 | 第31-35页 |
3.1.1 数据库的构建 | 第31-33页 |
3.1.2 均方根偏差(RMSD)分析 | 第33页 |
3.1.3 蛋白质的结构稳定性分析 | 第33-34页 |
3.1.4 蛋白质序列的多样性增量(ID) | 第34页 |
3.1.5 疏水非均一性分析(HI) | 第34-35页 |
3.2 结果与讨论 | 第35-38页 |
3.2.1 疾病与非疾病蛋白质结构差异的分析 | 第35页 |
3.2.2 疾病与非疾病蛋白质的稳定性分析 | 第35-37页 |
3.2.3 可变剪接偏好性分析 | 第37-38页 |
3.3 本章小结 | 第38-40页 |
结论 | 第40-42页 |
参考文献 | 第42-50页 |
在学研究成果 | 第50-51页 |
致谢 | 第51页 |