| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| 1.1 引言 | 第11页 |
| 1.2 我国烟草病毒病的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3 常见烟草病毒病 | 第12-15页 |
| 1.3.1 普通烟草花叶病毒病（Tobacco mosaic virus，TMV） | 第12页 |
| 1.3.2 烟草黄瓜花叶病毒病(Cucumber mosaic virus，CMV) | 第12-13页 |
| 1.3.3 烟草马铃薯Y病毒病（Potato virus Y, PVY） | 第13-14页 |
| 1.3.4 烟草环斑病毒（Tobacco ring spot virus, TRSV） | 第14页 |
| 1.3.5 烟草脉带花叶病毒（Tobacco vein banding mosaic virus, TVBMV） | 第14-15页 |
| 1.4 植物病毒检测技术研究进展 | 第15-16页 |
| 1.5 高通量测序在病毒检测上的应用 | 第16-18页 |
| 1.5.1 第二代测序技术（Next generation sequencing,NGS） | 第16页 |
| 1.5.2 sRNA深度测序技术 | 第16-18页 |
| 1.6 研究内容及意义 | 第18-19页 |
| 第2章 我国不同生态区烟草病毒病small RNA深度测序与分析 | 第19-39页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-27页 |
| 2.1.1 样品的采集与处理 | 第19-20页 |
| 2.1.2 实验试剂与仪器 | 第20-21页 |
| 2.1.3 常规分子生物学技术 | 第21-24页 |
| 2.1.4 RNA质量验证 | 第24-25页 |
| 2.1.5 小RNA测序样品统计与编号 | 第25页 |
| 2.1.6 文库构建与Hi Seq/Mi Seq测序 | 第25页 |
| 2.1.7 测序结果分析流程 | 第25-27页 |
| 2.2 small RNA深度测序结果分析 | 第27-39页 |
| 2.2.1 滇川高原生态区small RNA深度测序结果 | 第27-30页 |
| 2.2.2 武陵秦巴与贵州山地生态区small RNA深度测序结果 | 第30-33页 |
| 2.2.3 山东生态区small RNA深度测序结果 | 第33-36页 |
| 2.2.4 结论与分析 | 第36-39页 |
| 第3章 我国不同生态区部分病毒分离与鉴定 | 第39-50页 |
| 3.1 材料与方法 | 第39页 |
| 3.2 引物 | 第39-40页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第40-50页 |
| 3.3.1 混合样品病毒粒子电镜观察 | 第40-42页 |
| 3.3.2 小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus，ZYMV） | 第42-43页 |
| 3.3.3 紫云英矮缩病毒（Milk vetch dwarf virus，MDV） | 第43-45页 |
| 3.3.4 番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leaf curl virus，TYLCV） | 第45-48页 |
| 3.3.5 地黄花叶病毒（Rehmannia mosaic virus，Re MV） | 第48-50页 |
| 第4章 我国烟草上部分病毒LAMP/RT-LAMP检测体系研究与应用 | 第50-64页 |
| 4.1 环介导等温扩增技术（LAMP）检测植物病毒的研究 | 第50-52页 |
| 4.2 PVY、CMV、TMV逆转录环介导等温扩增检测体系建立 | 第52-55页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.2.2 总RNA提取 | 第52页 |
| 4.2.3 引物设计 | 第52-53页 |
| 4.2.4 RT-LAMP反应条件的优化 | 第53页 |
| 4.2.5 结果与分析 | 第53-55页 |
| 4.3 紫云英矮缩病毒（Milk vetch dwarf virus，MDV）环介导等温扩增（LAMP）检测体系建立 | 第55-64页 |
| 4.3.1 实验材料 | 第56页 |
| 4.3.2 引物设计 | 第56页 |
| 4.3.3 总DNA提取 | 第56页 |
| 4.3.4 反应条件的优化 | 第56-57页 |
| 4.3.5 LAMP特异性检测 | 第57页 |
| 4.3.6 LAMP与PCR检测方法灵敏度的比较 | 第57页 |
| 4.3.7 LAMP可视化检测体系建立 | 第57页 |
| 4.3.8 结论与讨论 | 第57-64页 |
| 第5章 结论与创新点 | 第64-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 个人简介 | 第74页 |
