| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩写表及中英文对照 | 第13-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-19页 |
| 0 引言 | 第14页 |
| 1 鸟类核基因和线粒体基因联合进化分析的优势 | 第14页 |
| 2 鸟类性染色体连锁基因的研究 | 第14-16页 |
| 3 鸟类系统发育及分歧时间的研究进展 | 第16页 |
| 4 雀形目系统发育及分歧时间的研究进展 | 第16-17页 |
| 5 本研究的目的及意义 | 第17-19页 |
| 5.1 雀形目鹎科三个物种线粒体全基因组的测定与进化分析 | 第17-18页 |
| 5.2 开发鸟类性别鉴定的新分子标记 | 第18-19页 |
| 第二部分 研究论文 | 第19-72页 |
| 第一章 雀形目鹎类三种鸟类的线粒体基因组全序列的测定及系统发育分析 | 第19-43页 |
| 1 实验材料与方法 | 第19-25页 |
| 1.1 实验材料 | 第19-21页 |
| 1.2 实验方法 | 第21-25页 |
| 2 实验数据的处理与分析 | 第25-26页 |
| 2.1 序列校正与拼接 | 第25页 |
| 2.2 线粒体全基因组的分区 | 第25页 |
| 2.3 线粒体基因组的结构与特征分析 | 第25-26页 |
| 2.4 雀形目鸟类科间的进化速率异质性分析 | 第26页 |
| 2.5 碱基替代模型的分析 | 第26页 |
| 2.6 系统发育分析 | 第26页 |
| 3 结果与讨论 | 第26-43页 |
| 3.1 总DNA的提取结果 | 第26-27页 |
| 3.2 雀形目鹎科三种鸟类基因组的结构特征 | 第27-37页 |
| 3.3 雀形目科间的进化速率异质性分析 | 第37-38页 |
| 3.4 雀形目主要谱系系统进化分析 | 第38-43页 |
| 第二章 基于核基因和线粒体基因的雀形目分歧时间估算 | 第43-72页 |
| 1 实验材料与方法 | 第44-46页 |
| 1.1 实验材料 | 第44-45页 |
| 1.2 实验方法 | 第45-46页 |
| 2 实验数据分析 | 第46-53页 |
| 2.1 序列的校正 | 第46-47页 |
| 2.2 序列的比对 | 第47页 |
| 2.3 基因进化速率分析 | 第47页 |
| 2.4 碱基替代模型的分析 | 第47页 |
| 2.5 系统发育分析 | 第47-48页 |
| 2.6 分歧时间的估算 | 第48-53页 |
| 3 实验结果 | 第53-69页 |
| 3.1 总DNA的提取结果 | 第53页 |
| 3.2 鸟类性别鉴定基因内含子序列的结构特征 | 第53-60页 |
| 3.3 基因的进化速率分析 | 第60-62页 |
| 3.4 系统发育分析结果 | 第62-69页 |
| 4 讨论 | 第69-72页 |
| 4.1 性别鉴定基因及进化特征分析 | 第69-70页 |
| 4.2 系统进化及分歧时间分析 | 第70-72页 |
| 参考文献 (References ) | 第72-81页 |
| 附件 | 第81-101页 |
| 致谢 (Acknowledgement) | 第101-102页 |
| 硕士期间发表论文及获奖情况 | 第102-103页 |
