| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第10-26页 |
| 1.1 氯酚类化合物(Chlorophenols,CPs) | 第10-13页 |
| 1.1.1 CPs的基本性质 | 第10-11页 |
| 1.1.2 CPs的用途及来源 | 第11页 |
| 1.1.3 CPs的分布及毒性 | 第11-13页 |
| 1.2 2,4-二氯苯酚(2,4-DCP) | 第13-16页 |
| 1.2.1 2,4-DCP的基本性质 | 第13-14页 |
| 1.2.2 2,4-DCP对动物的毒性研究 | 第14-15页 |
| 1.2.3 2,4-DCP对人体的损伤 | 第15-16页 |
| 1.2.4 2,4-DCP的代谢 | 第16页 |
| 1.3 转录组测序 | 第16-22页 |
| 1.3.1 转录组测序概述 | 第16-17页 |
| 1.3.2 RNA-seq技术简介 | 第17-22页 |
| 1.3.2.1 RNA-seq测序文库制备 | 第19-20页 |
| 1.3.2.2 测序平台数据输出 | 第20-21页 |
| 1.3.2.3 读段定位 | 第21-22页 |
| 1.3.2.4 基因表达水平估计 | 第22页 |
| 1.4 筛选基因介绍 | 第22-24页 |
| 1.4.1 P450酶家族 | 第22-23页 |
| 1.4.2 UGT酶家族 | 第23页 |
| 1.4.3 P型ATP酶 | 第23页 |
| 1.4.4 胆固醇脱氢还原酶 | 第23-24页 |
| 1.4.5 内参基因 | 第24页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第24页 |
| 1.6 实验技术路线 | 第24-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-42页 |
| 2.1 实验材料 | 第26页 |
| 2.2 主要试剂 | 第26-27页 |
| 2.3 主要仪器 | 第27页 |
| 2.4 主要溶液配制 | 第27-28页 |
| 2.5 细胞培养 | 第28-29页 |
| 2.5.1 细胞传代 | 第28页 |
| 2.5.2 细胞冻存 | 第28页 |
| 2.5.3 细胞复苏 | 第28-29页 |
| 2.6 细胞活力测定 | 第29页 |
| 2.7 平板克隆形成实验 | 第29-30页 |
| 2.8 转录组测序流程 | 第30-32页 |
| 2.8.1 RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.8.2 文库的制备及测序 | 第31页 |
| 2.8.3 测序数据处理及分析 | 第31-32页 |
| 2.9 实时定量PCR | 第32-36页 |
| 2.9.1 RNA提取 | 第33页 |
| 2.9.2 反转录 | 第33页 |
| 2.9.3 引物设计 | 第33-34页 |
| 2.9.4 标准曲线制作 | 第34-35页 |
| 2.9.4.1 PCR | 第34页 |
| 2.9.4.2 DNA回收纯化 | 第34-35页 |
| 2.9.5 RT-qPCR | 第35-36页 |
| 2.10 内参选择与评价 | 第36-41页 |
| 2.10.1 备选内参基因引物评价 | 第36-39页 |
| 2.10.2 内参基因的稳定性分析 | 第39-40页 |
| 2.10.3 内参基因的稳定性评价和验证 | 第40-41页 |
| 2.11 数据分析与作图 | 第41-42页 |
| 第三章 实验结果 | 第42-69页 |
| 3.1 2,4-DCP细胞毒性结果 | 第42-45页 |
| 3.1.1 MTT实验结果 | 第42-44页 |
| 3.1.2 平板克隆形成实验结果 | 第44-45页 |
| 3.2 转录组测序结果 | 第45-61页 |
| 3.2.1 样品总RNA质量评价 | 第45-46页 |
| 3.2.2 测序质量评估 | 第46-48页 |
| 3.2.3 测序结果对比统计 | 第48-50页 |
| 3.2.4 基因表达注释 | 第50-51页 |
| 3.2.5 基因差异表达分析 | 第51-52页 |
| 3.2.6 差异基因的GO功能显著性富集分析 | 第52-54页 |
| 3.2.7 差异基因的Pathway显著性富集分析 | 第54-55页 |
| 3.2.8 新转录本预测和注释 | 第55-57页 |
| 3.2.9 可变剪接 | 第57-60页 |
| 3.2.10 SNP分析 | 第60-61页 |
| 3.3 实时定量PCR结果 | 第61-69页 |
| 3.3.1 筛选基因引物评价 | 第61-65页 |
| 3.3.2 筛选基因RT-qPCR结果 | 第65-69页 |
| 第四章 讨论 | 第69-78页 |
| 4.1 2,4-DCP导致HL-7702细胞活力下降 | 第69页 |
| 4.2 2,4-DCP转录组研究讨论 | 第69-76页 |
| 4.2.1 差异基因的GO功能分析讨论 | 第70页 |
| 4.2.2 差异基因的Pathway分析讨论 | 第70-76页 |
| 4.3 2,4-DCP RT-qPCR结果讨论 | 第76-78页 |
| 第五章 结论 | 第78-80页 |
| 5.1 主要结论 | 第78-79页 |
| 5.2 研究展望 | 第79-80页 |
| 缩略词表 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-91页 |
| 在读期间研究成果 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
