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园艺植物几种病毒病的分子检测与鉴定

符号说明第5-10页
中文摘要第10-11页
Abstract第11-12页
1 前言第13-26页
    1.1 两种常见蔬菜病毒病害简介第14-20页
        1.1.1 番茄黄化曲叶病毒第14-16页
            1.1.1.1 番茄黄化曲叶病毒的分类及特征第14页
            1.1.1.2 番茄黄化曲叶病毒的传播媒介及方式第14-15页
            1.1.1.3 番茄黄化曲叶病毒的生物学特性第15页
            1.1.1.4 番茄黄化曲叶病毒病发生情况及田间寄主范围第15-16页
            1.1.1.5 番茄黄化曲叶病毒的检测技术第16页
        1.1.2 黄瓜绿斑驳花叶病毒第16-20页
            1.1.2.1 黄瓜绿斑驳花叶病毒特征第16-17页
            1.1.2.2 黄瓜绿斑驳花叶病毒分类第17-18页
            1.1.2.3 黄瓜绿斑驳花叶病毒症状特征及寄主范围第18-19页
            1.1.2.4 黄瓜绿斑驳花叶病毒的生物学特性第19页
            1.1.2.5 黄瓜绿斑驳花叶病毒的接种及检测技术第19-20页
    1.2 桃树病毒病简介第20-23页
        1.2.1 桃树病毒病种类第20页
        1.2.2 桃树病毒病发生情况第20-21页
        1.2.3 类病毒概述第21页
        1.2.4 类病毒的传播第21页
        1.2.5 类病毒的检测第21-23页
            1.2.5.1 生物学鉴定第21-22页
            1.2.5.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第22页
            1.2.5.3 核酸杂交第22-23页
            1.2.5.4 RT-PCR检测第23页
    1.3 本研究的目的与意义第23-26页
2 材料与方法第26-40页
    2.1 实脸材料与仪器第26-28页
        2.1.1 病毒样品的采集和供试植株第26页
        2.1.2 试剂与耗材第26-27页
        2.1.3 主要实验仪器第27页
        2.1.4 实验所需试剂及配制第27-28页
    2.2 番茄黄化曲叶病毒的鉴定及检测第28-33页
        2.2.1 样品DNA提取第28页
        2.2.2 引物的设计与合成第28-29页
        2.2.3 PCR扩增第29-30页
            2.2.3.1 外壳蛋白的PCR扩增第29页
            2.2.3.2 全基因组DNA的PCR扩增第29-30页
        2.2.4 PCR产物的克隆及测序第30-33页
            2.2.4.1 琼脂糖凝胶电泳及DNA片段回收第30-31页
            2.2.4.2 连接载体第31页
            2.2.4.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第31页
            2.2.4.4 连接产物转化大肠杆菌第31-32页
            2.2.4.5 碱裂解法提取质粒DNA第32页
            2.2.4.6 重组克隆的PCR鉴定第32-33页
        2.2.5 序列分析第33页
    2.3 黄瓜绿斑驳花叶病毒的鉴定与检测第33-36页
        2.3.1 引物的设计与合成第33页
        2.3.2 样品RNA提取第33-34页
        2.3.3 反转录cDNA的合成第34-35页
        2.3.4 RT-PCR扩增第35-36页
            2.3.4.1 外壳蛋白的PCR扩增第35页
            2.3.4.2 CGMMV全基因组克隆第35-36页
        2.3.5 PCR产物的克隆及测序第36页
            2.3.5.1 琼脂糖凝胶电泳及DNA片段回收第36页
            2.3.5.2 连接载体第36页
            2.3.5.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第36页
            2.3.5.4 连接产物转化大肠杆菌第36页
            2.3.5.5 碱裂解法提取质粒DNA第36页
            2.3.5.6 重组克隆的PCR鉴定第36页
            2.3.5.7 序列分析第36页
    2.4 山东省肥城桃病毒病的鉴定与检测第36-40页
        2.4.1 引物设计与合成第36-37页
        2.4.2 样品RNA提取第37页
        2.4.3 二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D-PAGE)第37-38页
        2.4.4 反转录cDNA的合成第38页
        2.4.5 RT-PCR扩增第38-39页
        2.4.6 PCR产物的克隆及测序第39-40页
            2.4.6.1 琼脂糖凝胶电泳及DNA片段回收第39页
            2.4.6.2 连接载体第39页
            2.4.6.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第39页
            2.4.6.4 连接产物转化大肠杆菌第39页
            2.4.6.5 碱裂解法提取质粒DNA第39页
            2.4.6.6 重组克隆的PCR鉴定第39页
            2.4.6.7 序列分析第39-40页
3 结果与分析第40-58页
    3.1 番茄黄化曲叶病毒结果与分析第40-46页
        3.1.1 山东省番茄种苗TYLCV带毒率检测结果第40页
        3.1.2 三省TYLCV发病情况检测结果第40页
        3.1.3 TYLCV寄主范围的测定第40-42页
        3.1.4 TYLCV新寄主全序列测定和分析第42-46页
            3.1.4.1 TYLCV新寄主的PCR检测第42-43页
            3.1.4.2 TYLCV新寄主全长的扩增及序列测定第43页
            3.1.4.3 TYLCV新寄主全长序列分析第43页
            3.1.4.4 TYLCV新寄主序列核苷酸同源性比较第43-45页
            3.1.4.5 系统进化树分析第45-46页
    3.2 黄瓜绿斑驳花叶病毒病病原的鉴定第46-53页
        3.2.1 CGMMV在山东省发生情况检测结果第46-47页
        3.2.2 CP基因的RT-PCR检测结果第47-48页
        3.2.3 CGMMV全序列测定和分析第48-49页
            3.2.3.1 CGMMV全序列扩增策略第48页
            3.2.3.2 CGMMV全序列扩增结果第48-49页
        3.2.4 CGMMV重组质粒的电泳鉴定及PCR鉴定第49页
        3.2.5 CGMMV黄瓜、甜瓜和丝瓜全基因组测序和结构分析第49-51页
        3.2.6 CGMMV黄瓜、甜瓜和丝瓜分离物全基因系统进化树构建第51-53页
    3.3 山东省肥城桃病毒病的检测结果第53-58页
        3.3.1 二维聚丙烯凝胶电泳检测第53-54页
        3.3.2 样品检测结果第54页
        3.3.3 啤酒矮化类病毒RT-PCR扩增第54-55页
            3.3.3.1 桃树样品携带HSVd的RT-PCR分析第54-55页
            3.3.3.2 HSVd-SDH1序列测定及比较分析第55页
        3.3.4 桃潜隐花叶类病毒RT-PCR扩增第55-56页
            3.3.4.1 桃树样品携带PLMVd的RT-PCR分析第55-56页
            3.3.4.2 PLMVd-SDP2序列测定及比较分析第56页
        3.3.5 苹果褪绿叶斑病毒RT-PCR扩增第56-58页
            3.3.5.1 桃树样品携带ACLSV的RT-PCR分析第56-57页
            3.3.5.2 ACLSV-SDA3序列测定及比较分析第57-58页
4 讨论第58-61页
    4.1 番茄黄化曲叶病毒第58-59页
        4.1.1 山东省番茄种苗TYLCV带毒率检测结果第58页
        4.1.2 山东省、吉林省和辽宁省TYLCV发生情况第58页
        4.1.3 TYLCV寄主范围的初步确定第58-59页
        4.1.4 本研究中TYLCV新寄主序列分析第59页
    4.2 黄瓜绿斑驳花叶病毒第59-60页
        4.2.1 山东省CGMMV发生情况第59页
        4.2.2 黄瓜、甜瓜和丝瓜分离物序列分析第59-60页
    4.3 桃树病毒病第60-61页
        4.3.1 桃树类病毒检测情况第60页
        4.3.2 桃树病毒病检测情况第60-61页
5 结论第61-62页
参考文献第62-66页
攻读硕士学位期间发表论文第66-67页
致谢第67页

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