中文摘要 | 第4-9页 |
Abstract | 第9-15页 |
英文缩略语 | 第16-20页 |
第一部分 :肾细胞癌组织中全蛋白质组及其赖氨酸琥珀酰化修饰组的定量分析 | 第20-42页 |
1 前言 | 第20-21页 |
2 材料方法 | 第21-28页 |
2.1 样品准备 | 第21-24页 |
2.1.1 材料和试剂 | 第22页 |
2.1.2 蛋白质提取 | 第22-23页 |
2.1.3 胰蛋白酶消化样品 | 第23页 |
2.1.4 TMT标记 | 第23页 |
2.1.5 高效液相色谱法分离 | 第23-24页 |
2.1.6 亲和力富集 | 第24页 |
2.2 LC-MS/MS定量蛋白质组分析 | 第24-25页 |
2.2.1 材料与试剂 | 第24页 |
2.2.2 LC-MS/MS分析 | 第24-25页 |
2.3 生物信息学分析 | 第25-28页 |
2.3.1 注释方法 | 第25-27页 |
2.3.2 功能富集 | 第27-28页 |
2.3.3 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 第28页 |
3 结果 | 第28-40页 |
3.1 蛋白质组和赖氨酸琥珀酰组在RCC中的定量研究流程及策略 | 第28-29页 |
3.2 RCC及癌旁组织中全蛋白质组的鉴定与功能分析 | 第29-33页 |
3.2.1 RCC及癌旁组织中全蛋白质组的鉴定 | 第29-31页 |
3.2.3 KEGGpathway分析糖酵解/氧化磷酸化通路相关的差异蛋白 | 第31-33页 |
3.2.4 RCC及癌旁组织中差异表达蛋白的相互作用关系 | 第33页 |
3.3 RCC及癌旁组织中赖氨酸琥珀酰化修饰组的鉴定及功能分析 | 第33-38页 |
3.3.1 RCC及癌旁组织中琥珀酰化修饰组的鉴定 | 第33-34页 |
3.3.2 琥珀酰化修饰位点的motif量化分析 | 第34-38页 |
3.4 RCC及其癌旁组织的蛋白质组和琥珀酰化修饰组的关系 | 第38-40页 |
4 讨论 | 第40-41页 |
5 结论 | 第41-42页 |
第二部分 :PGK1及其赖氨酸琥珀酰化修饰在肾细胞癌中高表达的临床意义及其对肾癌细胞的生物学功能研究 | 第42-67页 |
1 前言 | 第42-44页 |
2 材料与方法 | 第44-54页 |
2.1 材料 | 第44-46页 |
2.1.1 组织标本收集 | 第44页 |
2.1.2 细胞系 | 第44页 |
2.1.3 主要试剂 | 第44-46页 |
2.1.4 主要仪器 | 第46页 |
2.2 方法 | 第46-54页 |
2.2.1 Oncomine数据库提取数据 | 第47页 |
2.2.2 Westernblot免疫印迹检测蛋白表达 | 第47-49页 |
2.2.3 免疫沉淀富集PGK1蛋白 | 第49页 |
2.2.4 免疫组化 | 第49-51页 |
2.2.5 细胞培养方法 | 第51-53页 |
2.2.6 CCK8细胞增值检测 | 第53页 |
2.2.7 Transwell细胞迁移能力检测 | 第53页 |
2.2.8 统计方法 | 第53-54页 |
3 结果 | 第54-65页 |
3.1 RCC及其癌旁组织PGK1和PKM2的表达情况 | 第54-59页 |
3.1.1 Oncomine数据库提取RCC及正常组织中PGK1和PKM2的mRNA表达情况 | 第54-56页 |
3.1.2 PGK1和PKM2蛋白在RCC组织中呈现高表达状态 | 第56-58页 |
3.1.3 PGK1的赖氨酸琥珀酰化修饰水平在肾细胞癌组织中呈现上调状态 | 第58-59页 |
3.2 PGK1蛋白对肾癌细胞增殖和迁移能力的影响 | 第59-62页 |
3.2.1 肾癌细胞系PGK1内源性表达检测及RNAi对肾癌细胞系PGK1的抑制作用 | 第59-60页 |
3.2.2 抑制PGK1表达对肾癌细胞的增殖能力的影响 | 第60-61页 |
3.2.3 抑制PGK1表达对肾癌细胞的迁移能力的影响 | 第61-62页 |
3.3 肾癌细胞系中SIRT5对PGK1蛋白赖氨酸琥珀酰化修饰的影响 | 第62-65页 |
3.3.1 去琥珀酰化酶SIRT5对PGK1赖氨酸琥珀酰化修饰的影响 | 第62-63页 |
3.3.2 过表达SIRT5对肾癌细胞增殖能力的影响 | 第63页 |
3.3.3 过表达SIRT5对肾癌细胞迁移能力的影响 | 第63-65页 |
4 讨论 | 第65-66页 |
5 结论 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-71页 |
综述 | 第71-84页 |
参考文献 | 第78-84页 |
创新性自我评价 | 第84-85页 |
博士在读期间科研业绩 | 第85-87页 |
致谢 | 第87-88页 |
个人简介 | 第88页 |