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PGK1及其赖氨酸琥珀酰化修饰在肾细胞癌中的作用及其相关机制研究

中文摘要第4-9页
Abstract第9-15页
英文缩略语第16-20页
第一部分 :肾细胞癌组织中全蛋白质组及其赖氨酸琥珀酰化修饰组的定量分析第20-42页
    1 前言第20-21页
    2 材料方法第21-28页
        2.1 样品准备第21-24页
            2.1.1 材料和试剂第22页
            2.1.2 蛋白质提取第22-23页
            2.1.3 胰蛋白酶消化样品第23页
            2.1.4 TMT标记第23页
            2.1.5 高效液相色谱法分离第23-24页
            2.1.6 亲和力富集第24页
        2.2 LC-MS/MS定量蛋白质组分析第24-25页
            2.2.1 材料与试剂第24页
            2.2.2 LC-MS/MS分析第24-25页
        2.3 生物信息学分析第25-28页
            2.3.1 注释方法第25-27页
            2.3.2 功能富集第27-28页
            2.3.3 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析第28页
    3 结果第28-40页
        3.1 蛋白质组和赖氨酸琥珀酰组在RCC中的定量研究流程及策略第28-29页
        3.2 RCC及癌旁组织中全蛋白质组的鉴定与功能分析第29-33页
            3.2.1 RCC及癌旁组织中全蛋白质组的鉴定第29-31页
            3.2.3 KEGGpathway分析糖酵解/氧化磷酸化通路相关的差异蛋白第31-33页
            3.2.4 RCC及癌旁组织中差异表达蛋白的相互作用关系第33页
        3.3 RCC及癌旁组织中赖氨酸琥珀酰化修饰组的鉴定及功能分析第33-38页
            3.3.1 RCC及癌旁组织中琥珀酰化修饰组的鉴定第33-34页
            3.3.2 琥珀酰化修饰位点的motif量化分析第34-38页
        3.4 RCC及其癌旁组织的蛋白质组和琥珀酰化修饰组的关系第38-40页
    4 讨论第40-41页
    5 结论第41-42页
第二部分 :PGK1及其赖氨酸琥珀酰化修饰在肾细胞癌中高表达的临床意义及其对肾癌细胞的生物学功能研究第42-67页
    1 前言第42-44页
    2 材料与方法第44-54页
        2.1 材料第44-46页
            2.1.1 组织标本收集第44页
            2.1.2 细胞系第44页
            2.1.3 主要试剂第44-46页
            2.1.4 主要仪器第46页
        2.2 方法第46-54页
            2.2.1 Oncomine数据库提取数据第47页
            2.2.2 Westernblot免疫印迹检测蛋白表达第47-49页
            2.2.3 免疫沉淀富集PGK1蛋白第49页
            2.2.4 免疫组化第49-51页
            2.2.5 细胞培养方法第51-53页
            2.2.6 CCK8细胞增值检测第53页
            2.2.7 Transwell细胞迁移能力检测第53页
            2.2.8 统计方法第53-54页
    3 结果第54-65页
        3.1 RCC及其癌旁组织PGK1和PKM2的表达情况第54-59页
            3.1.1 Oncomine数据库提取RCC及正常组织中PGK1和PKM2的mRNA表达情况第54-56页
            3.1.2 PGK1和PKM2蛋白在RCC组织中呈现高表达状态第56-58页
            3.1.3 PGK1的赖氨酸琥珀酰化修饰水平在肾细胞癌组织中呈现上调状态第58-59页
        3.2 PGK1蛋白对肾癌细胞增殖和迁移能力的影响第59-62页
            3.2.1 肾癌细胞系PGK1内源性表达检测及RNAi对肾癌细胞系PGK1的抑制作用第59-60页
            3.2.2 抑制PGK1表达对肾癌细胞的增殖能力的影响第60-61页
            3.2.3 抑制PGK1表达对肾癌细胞的迁移能力的影响第61-62页
        3.3 肾癌细胞系中SIRT5对PGK1蛋白赖氨酸琥珀酰化修饰的影响第62-65页
            3.3.1 去琥珀酰化酶SIRT5对PGK1赖氨酸琥珀酰化修饰的影响第62-63页
            3.3.2 过表达SIRT5对肾癌细胞增殖能力的影响第63页
            3.3.3 过表达SIRT5对肾癌细胞迁移能力的影响第63-65页
    4 讨论第65-66页
    5 结论第66-67页
参考文献第67-71页
综述第71-84页
    参考文献第78-84页
创新性自我评价第84-85页
博士在读期间科研业绩第85-87页
致谢第87-88页
个人简介第88页

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