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小麦穗发育时期转录组测序及差异表达基因的分析

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
1 文献综述第12-19页
    1.1 小麦穗部性状与产量的关系第12-16页
        1.1.1 小麦幼穗的发育第12-14页
        1.1.2 生态条件对小麦幼穗发育的影响第14-15页
        1.1.3 穗部性状与产量的关系第15页
        1.1.4 小麦穗部性状的定位研究进展第15-16页
    1.2 转录组测序(RNA-seq)应用研究进展第16-18页
        1.2.1 转录组测序(RNA-seq)技术第16页
        1.2.3 转录组测序(RNA-Seq)技术在作物研究中的应用第16-17页
        1.2.4 转录组测序(RNA-Seq)技术在小麦研究中的应用第17-18页
    1.3 本研究的目的和意义第18-19页
2 材料与方法第19-27页
    2.1 供试材料第19页
        2.1.1 转录组测序材料第19页
        2.1.2 RT-qPCR实验验证材料第19页
    2.2 实验方法第19-27页
        2.2.1 转录组测序(RNA-Seq)分析第19-20页
        2.2.2 GO功能富集分析与KEGG代谢途径富集分析第20-21页
        2.2.3 穗特异性表达基因选取第21页
        2.2.4 RT-qPCR验证第21-27页
3 结果与分析第27-61页
    3.1 转录组分析第27-30页
        3.1.1 测序质量参数第27-28页
        3.1.2 测序数据评估统计第28页
        3.1.3 主成分分析第28-30页
    3.2 转录组测序数据分析第30-44页
        3.2.1 差异表达基因分析第30页
        3.2.2 差异上调表达基因第30-31页
        3.2.3 差异上调表达基因的GO功能富集分析第31-35页
        3.2.4 差异上调表达基因的KEGG代谢途径富集分析第35-36页
        3.2.5 差异下调表达基因第36页
        3.2.6 差异下调表达基因的GO功能富集分析第36-43页
        3.2.7 差异下调表达基因的KEGG代谢途径富集分析第43-44页
    3.3 穗特异性表达基因的实时荧光定量PCR验证第44-61页
        3.3.1 穗特异性表达基因的注释信息第45-47页
        3.3.2 穗特异表达基因的RT-qPCR验证第47-53页
        3.3.3 TaPAP27与AtPAP27基因生物信息学分析第53-58页
        3.3.4 TaOSH15与OSH15基因生物信息学分析第58-61页
4 讨论第61-64页
参考文献第64-68页
致谢第68页

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