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猪流行性腹泻病毒AJ1102株的分离、鉴定及其分子进化特征

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略语表第12-14页
第1章 文献综述第14-29页
    1.1 猪流行性腹泻第14-15页
    1.2 PEDV的流行病学特点第15-16页
        1.2.1 宿主因素第15页
        1.2.2 病毒因素第15-16页
        1.2.3 疫苗因素第16页
        1.2.4 饲养管理与环境因素第16页
    1.3 PEDV的流行病学第16-17页
    1.4 PEDV的分子结构和遗传特征第17-24页
        1.4.0 PEDV的分子结构第17-18页
        1.4.1 5’UTR第18-19页
        1.4.2 ORF1第19页
        1.4.3 S蛋白第19-20页
        1.4.4 ORF3第20-21页
        1.4.5 M蛋白第21-22页
        1.4.6 E蛋白第22页
        1.4.7 N蛋白第22-23页
        1.4.8 3’UTR第23页
        1.4.9 PEDV的分子流行病学研究进展第23-24页
    1.5 PEDV的检测方法第24-25页
    1.6 PEDV疫苗的研究第25-27页
        1.6.1 灭活疫苗第25-26页
        1.6.2 弱毒疫苗第26页
        1.6.3 基因工程疫苗第26页
        1.6.4 核酸疫苗第26-27页
        1.6.5 转基因植物疫苗第27页
    1.7 PEDV的临床治疗第27页
    1.8 姜黄素与抗病毒第27-29页
第2章 研究目的与意义第29-30页
第3章 材料与方法第30-42页
    3.1 试验材料第30-34页
        3.1.1 病料及实验动物第30页
        3.1.2 细胞与菌株第30页
        3.1.3 载体与质粒第30-31页
        3.1.4 工具酶及主要试剂第31页
        3.1.5 培养基与抗生素及其配制第31-32页
        3.1.6 主要缓冲液与相关试剂及其配制第32-34页
        3.1.7 分子生物学分析软件第34页
    3.2 试验方法第34-42页
        3.2.1 病料采集与处理第34-35页
        3.2.2 病毒的分离第35页
        3.2.3 PEDV的增殖第35页
        3.2.4 限制性内切酶酶切反应第35页
        3.2.5 PCR产物或酶切产物的电泳检测第35-36页
        3.2.6 PCR产物或酶切产物回收与纯化第36页
        3.2.7 外源DNA片段与质粒载体的连接反应第36-37页
        3.2.8 大肠杆菌感受态细胞的制备(氯化钙法)第37页
        3.2.9 连接产物的转化第37页
        3.2.10 质粒的制备与鉴定第37-39页
        3.2.11 病毒粒子的电镜观察第39-40页
        3.2.12 病毒滴度的测定第40页
        3.2.13 样品总RNA的提取及cDNA的合成第40-41页
        3.2.14 统计学方法第41-42页
第4章 结果与分析第42-92页
    4.1 猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法的建立及流行病学调查第42-43页
        4.1.1 猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法的建立第42页
        4.1.2 猪流行性腹泻病毒流行病学调查第42-43页
    4.2 猪流行性腹泻病毒的分离与鉴定第43-47页
        4.2.1 病毒的分离第43-44页
        4.2.2 PEDV AJ1102株病毒毒价的测定第44页
        4.2.3 PEDV AJ1102株病毒形态的电镜观察结果第44-45页
        4.2.4 间接免疫荧光实验(IFA)第45-46页
        4.2.5 病毒的RT-PCR检测第46-47页
    4.3 PEDV AJ1102株的全基因组序列的测定与进化分析第47-86页
        4.3.1 PEDV AJ1102株基因片段的RT-PCR扩增第47-48页
        4.3.2 PEDV AJ1102株各扩增片段的测序及序列拼接第48-49页
        4.3.3 PEDV AJ1102株全基因组序列的遗传进化分析第49-52页
        4.3.4 PEDV AJ1102株5’UTR的结构分析第52-54页
        4.3.6 PEDV AJ1102株3’UTR的结构分析第54-56页
        4.3.7 PEDV AJ1102株S蛋白的遗传进化分析第56-67页
        4.3.8 PEDV AJ1102株M蛋白的遗传进化分析第67-72页
        4.3.9 PEDV AJ1102株N蛋白的遗传进化分析第72-75页
        4.3.10 PEDV AJ1102株ORF3的遗传进化分析第75-80页
        4.3.11 PEDV AJ1102株E蛋白的遗传进化分析第80-85页
        4.3.12 PEDV AJ1102株全基因组的同源重组分析第85-86页
    4.4 PEDV流行毒株的遗传标志分析第86-90页
    4.5 中药姜黄素抗PEDV增殖的分析第90-92页
        4.5.1 姜黄素对Vero细胞的毒性试验第90-91页
        4.5.2 姜黄素抗PEDV增殖的分析第91-92页
第5章 讨论与结论第92-98页
    5.1 讨论第92-97页
        5.1.1 PEDV RT-PCR检测方法的建立第92页
        5.1.2 PEDV的流行病学调查及AJ1102株的分离鉴定第92-93页
        5.1.3 PEDV AJ102株全基因组序列和S、M、N、ORF3基因序列分析第93-95页
        5.1.4 PEDV AJ1102株的致病性分析第95-96页
        5.1.5 PEDV的毒力相关基因第96页
        5.1.6 中药姜黄素抗PEDV增殖的分析第96-97页
    5.2 结论第97-98页
参考文献第98-107页
致谢第107-108页
附录第108页

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