| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1 硅藻概况 | 第10-14页 |
| 1.1 微藻现状 | 第10页 |
| 1.2 硅藻多样性 | 第10-12页 |
| 1.3 硅藻应用前景 | 第12页 |
| 1.4 硅藻培养条件 | 第12-14页 |
| 1.4.1 生物因子 | 第12-13页 |
| 1.4.2 环境因子 | 第13页 |
| 1.4.3 营养因子 | 第13-14页 |
| 2 DNA条形码 | 第14-19页 |
| 2.1 DNA条形码的产生及发展 | 第14-15页 |
| 2.2 DNA条形码定义及工作原理 | 第15页 |
| 2.3 DNA条形码技术的操作 | 第15-16页 |
| 2.4 DNA条形码国内外研究进展 | 第16-17页 |
| 2.5 DNA条形码技术应用 | 第17-19页 |
| 2.5.1 DNA条形码在不同生物分类中的应用 | 第17-18页 |
| 2.5.2 DNA条形码在生态学保护方面的应用研究 | 第18-19页 |
| 2.5.3 DNA条形码的优势 | 第19页 |
| 3 本研究的内容和目的意义 | 第19-22页 |
| 第二章 基于DNA条形码的不同生态环境下硅藻多样性研究 | 第22-72页 |
| 1 硅藻采集 | 第22-29页 |
| 1.1 实验样品采集来源 | 第22-23页 |
| 1.2 样品采集与培养 | 第23-28页 |
| 1.3 分离纯化 | 第28-29页 |
| 2 主要试剂和仪器 | 第29-31页 |
| 2.1 试验器材 | 第29-30页 |
| 2.2 试验试剂 | 第30-31页 |
| 3 实验方法 | 第31-35页 |
| 3.1 基因组DNA提取 | 第31-32页 |
| 3.2 DNA浓度和纯度的检验 | 第32页 |
| 3.3 四个位点PCR扩增、测序、比对 | 第32-35页 |
| 4 数据分析 | 第35-37页 |
| 4.1 DNA条形码分析方法 | 第35页 |
| 4.2 系统发育学的常用方法 | 第35-36页 |
| 4.3 K-2p遗传距离和系统进化树的构建 | 第36-37页 |
| 5 研究结果 | 第37-69页 |
| 5.1 四个序列碱基特征 | 第37-40页 |
| 5.2 rbcL条形码分析结果 | 第40-49页 |
| 5.2.1 遗传距离 | 第42-44页 |
| 5.2.2 ABGD软件应用分析 | 第44-45页 |
| 5.2.3 构建系统进化树 | 第45-49页 |
| 5.3 COI条形码分析结果 | 第49-56页 |
| 5.3.1 COI遗传距离 | 第49-51页 |
| 5.3.2 COI位点数据的ABGD软件应用 | 第51-52页 |
| 5.3.3 系统进化树构建 | 第52-56页 |
| 5.4 SSU条形码分析结果 | 第56-62页 |
| 5.4.1 系统进化树构建 | 第56-61页 |
| 5.4.2 SSU基因位点单倍型分析 | 第61-62页 |
| 5.5 LSU条形码分析结果 | 第62-69页 |
| 5.5.1 LSU位点数据的ABGD软件应用 | 第64-65页 |
| 5.5.2 构建系统进化树 | 第65-69页 |
| 6 讨论 | 第69-72页 |
| 6.1 四个基因序列选取优劣势 | 第69页 |
| 6.2 邻接法NJ、最大似然法ML、贝叶斯系统发育法三种方法构建进化树分析优劣势 | 第69页 |
| 6.3 ABGD方法分析 | 第69页 |
| 6.4 距离法与单系法物种鉴定 | 第69-70页 |
| 6.5 DNA条形码在硅藻多样性上的适用 | 第70-72页 |
| 全文总结 | 第72-74页 |
| 展望 | 第74-76页 |
| 创新点 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-84页 |
| 攻读学位期间发表和完成的论文目录 | 第84-86页 |
| 致谢 | 第86页 |
