Abbreviations | 第4-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
1 INTRODUCTION | 第9-23页 |
1.1 Introduction and literature review | 第9页 |
1.2 Origin, Structure and Function of chloroplasts | 第9-11页 |
1.3 General structure of chloroplast DNA | 第11-12页 |
1.4 Recent advancement in use of chloroplast genome | 第12-15页 |
1.5 Next Generation Sequencing Technology | 第15-16页 |
1.5.1 Illumina genome analyzer | 第16页 |
1.5.2 454 prosequencing | 第16页 |
1.5.3 SOLiD sequencing | 第16页 |
1.6 Introduction to Asteraceae family | 第16-22页 |
1.6.1 The genus Dendrosenecio | 第18-21页 |
1.6.2 Dendrosenecio brassiciformis | 第21-22页 |
1.7 Research objectives | 第22-23页 |
2 MATERIALS AND METHODS | 第23-31页 |
2.1 Study site | 第23-25页 |
2.1.1 Plant material | 第24-25页 |
2.2 DNA extraction and sequencing | 第25-26页 |
2.3 Chloroplast genome assembly and annotation | 第26-27页 |
2.4 Chloroplasts comparisons | 第27页 |
2.5 Phylogenetic analysis using whole chloroplast, LSC, SSC and IR regions | 第27-28页 |
2.6 Data analysis | 第28-31页 |
3 Results | 第31-41页 |
3.1 Features of D. brassiciformis | 第31-33页 |
3.2 Genome content and organization | 第33-35页 |
3.3 Genome size | 第35-36页 |
3.4 Phylogenetic analysis | 第36-41页 |
4 Discussion | 第41-45页 |
5 Conclusion | 第45-47页 |
REFERENCES | 第47-57页 |
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第57-59页 |
ACKNOWLEDGEMENT | 第59页 |