基于遗传算法的多序列比对算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1 引言 | 第8-14页 |
| ·研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-11页 |
| ·两条序列比对的国内外研究现状 | 第9-10页 |
| ·多序列比对的国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·存在问题 | 第11页 |
| ·研究思路和内容 | 第11-12页 |
| ·研究思路 | 第11-12页 |
| ·研究内容 | 第12页 |
| ·可能的创新点 | 第12页 |
| ·论文结构 | 第12-13页 |
| ·小结 | 第13-14页 |
| 2 多序列比对概述 | 第14-21页 |
| ·多序列比对相关概念 | 第14-15页 |
| ·多序列比对问题描述 | 第15-17页 |
| ·多序列比对基本原理 | 第17-18页 |
| ·多序列比对算法 | 第18-20页 |
| ·MSA 算法 | 第19页 |
| ·Clustal W 算法 | 第19-20页 |
| ·MultAlin 算法 | 第20页 |
| ·小结 | 第20-21页 |
| 3 遗传算法概述 | 第21-29页 |
| ·遗传算法中的术语 | 第21-22页 |
| ·遗传算法的基本思想 | 第22页 |
| ·遗传算法的流程 | 第22-23页 |
| ·遗传算法的关键步骤 | 第23-26页 |
| ·确定编码方案 | 第23-24页 |
| ·产生初始种群 | 第24页 |
| ·确定适应度函数 | 第24页 |
| ·遗传操作 | 第24-25页 |
| ·终止条件及参数设定 | 第25-26页 |
| ·遗传算法的特点 | 第26页 |
| ·遗传算法的应用现状 | 第26-27页 |
| ·小结 | 第27-29页 |
| 4 基于遗传算法的多序列比对算法设计与实现 | 第29-46页 |
| ·遗传算法的改进思想 | 第29-30页 |
| ·改进遗传算法的操作设计 | 第30-41页 |
| ·编码方案 | 第30-31页 |
| ·初始种群 | 第31-34页 |
| ·适应度函数 | 第34页 |
| ·遗传操作 | 第34-41页 |
| ·终止条件及参数设定 | 第41页 |
| ·改进遗传算法的描述 | 第41-43页 |
| ·改进遗传算法的实现 | 第43-44页 |
| ·开发工具与环境 | 第43页 |
| ·文件格式 | 第43-44页 |
| ·小结 | 第44-46页 |
| 5 实验与结论分析 | 第46-55页 |
| ·分层思想有效性实验 | 第46-48页 |
| ·变异算子比对实验 | 第48-50页 |
| ·终止条件实验 | 第50-51页 |
| ·初始化方法实验 | 第51-52页 |
| ·结果有效性实验 | 第52-53页 |
| ·小结 | 第53-55页 |
| 6 总结与展望 | 第55-56页 |
| ·总结 | 第55页 |
| ·展望 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 作者简介 | 第60页 |
