| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第10-15页 |
| 1.1 研究的目的和意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3 论文的主要工作及组织结构 | 第13-15页 |
| 第二章 基本概念和相关技术 | 第15-25页 |
| 2.1 生物学相关知识 | 第15-18页 |
| 2.1.1 核酸、DNA和蛋白质 | 第15-16页 |
| 2.1.2 中心法则 | 第16-17页 |
| 2.1.3 系统发育树 | 第17-18页 |
| 2.2 序列相似性分析 | 第18-19页 |
| 2.3 复杂网络 | 第19-21页 |
| 2.3.1 图的基本概念 | 第19-20页 |
| 2.3.2 复杂网络 | 第20-21页 |
| 2.4 复杂网络的特征 | 第21-24页 |
| 2.4.1 复杂网络的全局特征 | 第22-23页 |
| 2.4.2 复杂网络的局部特征 | 第23-24页 |
| 2.5 matlab的相关函数 | 第24页 |
| 2.6 本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 基于复杂网络特征的DNA序列分析 | 第25-49页 |
| 3.1 构建DNA序列的复杂网络 | 第25-28页 |
| 3.2 利用复杂网络特征构建向量 | 第28-29页 |
| 3.3 物种选择和向量的距离度量 | 第29-30页 |
| 3.3.1 物种选择 | 第29页 |
| 3.3.2 向量的距离度量 | 第29-30页 |
| 3.4 相似性分析 | 第30-48页 |
| 3.4.1 全局特征的相似性分析 | 第30-32页 |
| 3.4.2 部分核苷酸顺式序列网络全局特征的相似性分析 | 第32-46页 |
| 3.4.3 局部特征的相似性分析 | 第46-48页 |
| 3.5 本章小结 | 第48-49页 |
| 第四章 基于复杂网络特征的蛋白质序列分析 | 第49-59页 |
| 4.1 构建蛋白质序列网络 | 第49-51页 |
| 4.2 利用网络特征构建向量 | 第51-52页 |
| 4.3 物种选择和向量的距离度量 | 第52-53页 |
| 4.3.1 物种选择 | 第52-53页 |
| 4.3.2 向量的距离度量 | 第53页 |
| 4.4 相似性分析 | 第53-58页 |
| 4.4.1 二和三氨基酸顺式序列网络全局特征的相似性分析 | 第53-54页 |
| 4.4.2 三氨基酸顺式序列网络全局特征的相似性分析 | 第54-56页 |
| 4.4.3 局部特征的相似性分析 | 第56-58页 |
| 4.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 总结 | 第59-61页 |
| 5.1 总结 | 第59-60页 |
| 5.2 展望 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 附录 | 第67页 |
