| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-21页 |
| 1.1 植物内生菌的研究进展 | 第12-16页 |
| 1.1.1 植物内生菌的生物多样性 | 第13-14页 |
| 1.1.2 植物内生菌的功能 | 第14-15页 |
| 1.1.3 植物内生菌的传播途径 | 第15-16页 |
| 1.2 植物基因型与其相关微生物的作用关系 | 第16页 |
| 1.3 种子内生菌的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3.1 种子内生菌的生物多样性 | 第16-17页 |
| 1.3.2 种子内生菌的研究方法 | 第17-18页 |
| 1.3.3 种子内生菌的典型特征 | 第18页 |
| 1.4 植物核心微生物组的研究现状 | 第18-19页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 1.6 技术路线 | 第20-21页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第21-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 实验样品采集及处理 | 第21-22页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第22-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-29页 |
| 2.2.1 水稻各组织的表面灭菌方法 | 第23-24页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取与检测 | 第24-25页 |
| 2.2.3 SSR分子标记技术 | 第25页 |
| 2.2.4 16S rDNA PCR扩增（Polymerase Chain Reaction）及纯化 | 第25-26页 |
| 2.2.5 Illumina高通量测序样品准备 | 第26页 |
| 2.2.6 高通量测序数据的处理 | 第26-29页 |
| 第三章 不同水稻基因型种子的内生菌群落结构分析 | 第29-38页 |
| 3.1 水稻品种DNA指纹图谱的构建 | 第29-30页 |
| 3.2 不同水稻基因型的表型特征聚类分析 | 第30页 |
| 3.3 不同水稻基因型对其种子内生菌群落的影响 | 第30-34页 |
| 3.3.1 不同水稻基因型种子内生菌多样性分析 | 第30-33页 |
| 3.3.2 不同水稻基因型种子内生菌的群落组成与结构分析 | 第33-34页 |
| 3.4 讨论 | 第34-38页 |
| 3.4.1 水稻基因型、表型特征及种子内生菌群落结构之间的相关性 | 第34-36页 |
| 3.4.2 不同基因型的水稻种子内生菌多样性和丰富度 | 第36页 |
| 3.4.3 不同基因型的水稻种子内生菌群落组成与结构 | 第36-38页 |
| 第四章 不同水稻基因型各组织的内生菌群落结构分析 | 第38-48页 |
| 4.1 不同水稻基因型各组织的内生菌多样性分析 | 第38-40页 |
| 4.2 不同水稻基因型各组织的内生菌群落组成与结构分析 | 第40-43页 |
| 4.3 水稻内生菌的垂直传播 | 第43-44页 |
| 4.4 水稻各组织内生菌的核心内生菌群 | 第44-45页 |
| 4.5 讨论 | 第45-48页 |
| 第五章 全文结论 | 第48-50页 |
| 5.1 结论 | 第48页 |
| 5.2 创新点 | 第48-49页 |
| 5.3 下一步计划及展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 附录 | 第57-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简历 | 第78页 |
