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哈克尼西棉细胞质雄性不育三系材料microRNA及转录组联合分析

摘要第5-6页
abstract第6页
英文缩略表第9-10页
第一章 引言第10-22页
    1.1 棉花细胞质雄性不育及育性恢复的研究第10-12页
        1.1.1 棉花恢复基因及不育基因的研究第10-11页
        1.1.2 三系材料间差异基因的研究第11页
        1.1.3 花粉发育相关的物质第11-12页
    1.2 棉花中MIRNA研究进展第12-15页
        1.2.1 miRNAs的产生第12页
        1.2.2 棉花中miRNAs的鉴定第12-15页
    1.3 植物花药发育过程中MIRNA的研究第15-20页
        1.3.1 miR156/7第15-16页
        1.3.2 miR159第16-17页
        1.3.3 miR167第17-18页
        1.3.4 miR172第18-19页
        1.3.5 miR319第19-20页
        1.3.6 miR396第20页
    1.4 研究目标及内容第20-22页
第二章 材料与方法第22-28页
    2.1 材料与方法第22-23页
        2.1.1 试验材料第22页
        2.1.2 实验试剂和主要仪器第22页
        2.1.3 总RNA的 取第22-23页
        2.1.4 小RNA的 取第23页
    2.2 试验方法第23-28页
        2.2.1 小RNA及转录组文库构建及测序第23-24页
        2.2.2 已知和新miRNA的鉴定第24页
        2.2.3 三系材料间miRNA和转录本差异表达分析第24页
        2.2.4 靶基因预测及功能注释第24-25页
        2.2.5 差异miRNAs和差异靶基因的实时荧光定量验证第25-27页
        2.2.6 PPR蛋白结构分析第27-28页
第三章 结果与分析第28-47页
    3.1 总RNA质量鉴定第28页
    3.2 转录组及小RNA测序数据分析第28-31页
    3.3 已知miRNAs的鉴定第31-33页
    3.4 新的miRNAs预测第33-35页
    3.5 三系材料间差异表达miRNAs分析第35页
    3.6 已知和新miRNAs的靶基因预测及注释第35-42页
    3.7 RT-qPCR验证miRNA-target pair的调控模式第42-43页
    3.8 PPR家族基因结构分析第43-47页
第四章 讨论第47-49页
    4.1 测序数据分析第47页
    4.2 调控网络构建第47-49页
        4.2.1 细胞质雄性不育调控网络第47-48页
        4.2.2 育性恢复调控网络第48-49页
第五章 结论第49-50页
参考文献第50-58页
附录第58-66页
致谢第66-67页
作者简历第67页

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