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团头鲂铁蛋白和转铁蛋白基因在嗜水气单胞菌感染过程中的免疫功能研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
缩略语表第15-16页
第一章 前言第16-29页
    1 研究问题由来第16-17页
    2 铁代谢通路研究进展第17-20页
        2.1 铁代谢:吸收、循环与贮存第17-18页
        2.2 铁代谢通路的调控第18-19页
        2.3 铁代谢与先天性免疫第19-20页
    3 铁蛋白研究进展第20-25页
        3.1 铁蛋白的分类第20-21页
        3.2 铁蛋白的结构与功能第21-22页
        3.3 铁蛋白的细胞定位第22页
        3.4 铁蛋白的表达调控第22-23页
            3.4.1 铁对铁蛋白的表达调控第22-23页
            3.4.2 低氧胁迫和氧化剂对铁蛋白的表达调控第23页
        3.5 铁蛋白与先天性免疫第23-24页
        3.6 铁蛋白在鱼类中的研究进展第24-25页
    4 转铁蛋白研究进展第25-27页
        4.1 转铁蛋白的结构、分类与功能第25-26页
        4.2 转铁蛋白-受体复合体第26页
        4.3 转铁蛋白与先天性免疫第26-27页
        4.4 鱼类转铁蛋白的研究进展第27页
    5 选题目的与意义第27-29页
第二章 材料与方法第29-46页
    1 实验材料第29-32页
        1.1 样品采集第29页
        1.2 所用载体第29-30页
        1.3 所用细胞第30页
        1.4 实验试剂第30-31页
        1.5 常用溶液配方第31页
        1.6 主要仪器设备第31-32页
    2 实验方法第32-46页
        2.1 总RNA抽提第32-33页
        2.2 总RNA反转录第33-34页
        2.3 RACE PCR克隆基因cDNA全长第34页
        2.4 荧光定量PCR第34-35页
        2.5 Western Blot第35-36页
        2.6 序列及进化分析第36页
        2.7 质粒构建第36-37页
            2.7.1 原核表达质粒构建第36-37页
            2.7.2 真核表达质粒构建第37页
        2.8 重组蛋白的诱导表达及检测第37-38页
        2.9 可溶性重组蛋白纯化第38页
        2.10 可溶性重组蛋白活性检测第38-39页
        2.11 活性重组蛋白免疫保护作用检测第39页
        2.12 多克隆抗体制备第39-40页
        2.13 免疫组化第40页
        2.14 免疫荧光第40-41页
        2.15 嗜水气单胞菌侵袭实验第41页
        2.16 L8824细胞实验第41-44页
            2.16.1 细胞传代培养第41页
            2.16.2 细胞冻存保藏及冻存细胞的复苏第41-42页
            2.16.3 细胞转染及RNA/蛋白抽提第42-43页
            2.16.4 过表达质粒(DNA)转染后下游免疫通路抑制剂刺激第43页
            2.16.5 细胞转染及荧光素酶活性分析第43-44页
        2.17 数字表达谱测序及分析第44-45页
            2.17.1 L8824细胞样品及RNA提取第44页
            2.17.2 文库构建及测序第44页
            2.17.3 测序数据质量评估第44页
            2.17.4 参考基因组比对分析第44页
            2.17.5 基因表达水平分析第44-45页
            2.17.6 差异表达分析第45页
            2.17.7 差异基因GO富集分析第45页
            2.17.8 差异基因KEGG富集分析第45页
        2.18 数据分析第45-46页
第三章 结果与分析第46-93页
    1 MamFers基因克隆、表达及重组蛋白活性检测第46-61页
        1.1 MamFers基因克隆及生物信息学分析第46-51页
        1.2 MamFerH和MamFerM组织和发育期表达分析第51-53页
        1.3 细菌感染后MamFerH和MamFerM的表达分析第53-54页
        1.4 MamFerH和MamFerM的免疫组化及亚细胞定位分析第54-57页
        1.5 MamFerH和MamFerM在Fe2+刺激后的表达分析第57页
        1.6 MamFerH和MamFerM重组蛋白表达、活性检测及抗体制备第57-59页
        1.7 rMam FerH和rMam FerM抑菌及免疫保护作用检测第59-61页
    2 MamTf基因克隆、表达及重组蛋白活性检测第61-71页
        2.1 MamTf基因克隆及生物信息学分析第61-65页
        2.2 MamTf组织和发育期表达分析第65-66页
        2.3 细菌感染后MamTf/Mam TfR1的表达分析第66-67页
        2.4 MamTf/Mam TfR1免疫组化及普鲁士蓝染色分析第67-69页
        2.5 MamTf重组蛋白表达、活性检测、抗体制备第69-70页
        2.6 rMam Tf蛋白抑菌作用检测第70-71页
    3 L8824细胞基因过表达后数字表达谱及差异基因筛选第71-79页
        3.1 RNA质量分析第71-73页
        3.2 测序结果及质量分析第73-74页
        3.3 差异表达分析第74-79页
            3.3.1 差异表达基因筛选第74-75页
            3.3.2 差异表达基因通路分析第75页
            3.3.3 qRT-PCR验证差异表达基因第75-79页
    4 MamFers和MamTf对免疫和铁代谢的调控作用研究第79-93页
        4.1 MamFers和MamTf对细菌粘附的调控作用研究第79-84页
            4.1.1 MamFers和MamTf调控嗜水气单胞菌粘附过程第79-81页
            4.1.2 FN介导MamFers和MamTf对嗜水气单胞菌的粘附调控第81-82页
            4.1.3 Intgβ1 介导MamFers和MamTf对嗜水气单胞菌的粘附调控第82-84页
        4.2 MamFers和MamTf对细胞因子的调控作用第84-89页
            4.2.1 MamFers和MamTf对细胞因子的表达调控第84-85页
            4.2.2 NFκB介导MamFers和MamTf对细胞因子的表达调控第85-87页
            4.2.3 MAPK介导MamFers和MamTf对细胞因子的表达调控第87-89页
        4.3 β2M介导MamFers和MamTf对hepcidin的调控作用第89-93页
            4.3.1 MamFers和MamTf对β2M的表达调控第89-91页
                4.3.1.1 MamFers和MamTf对β2M/MHC I轴的表达调控第89页
                4.3.1.2 NLRC5介导MamFers和MamTf对β2M/MHC I的表达调控第89-91页
            4.3.2 β2M介导MamFers和MamTf对hepcidin的调控作用第91-93页
                4.3.2.1 MamFers和MamTf对hepcidin的表达调控第91-92页
                4.3.2.2 β2M介导MamFers和MamTf对hepcidin的表达调控第92-93页
第四章 讨论第93-102页
    1 MamFers基因序列分析、表达及重组蛋白活性检测第93-95页
    2 MamTf基因序列分析、表达及重组蛋白活性检测第95-97页
    3 MamFers和MamTf过表达后的数字表达谱分析第97-98页
    4 MamFers和MamTf对免疫和铁代谢的调控作用研究第98-102页
结论第102-104页
    1 本文小结第102页
    2 创新之处第102-103页
    3 不足之处第103-104页
参考文献第104-122页
附录第122-131页
研究生期间发表论文及获奖情况第131-132页
致谢第132-133页

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