| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 第一章 生菜中叶裂多样性的遗传分析 | 第10-35页 |
| 1 前言 | 第10-16页 |
| 1.1 生菜概述 | 第10页 |
| 1.2 叶片形成机制 | 第10-13页 |
| 1.2.1 叶原基的分化 | 第10-11页 |
| 1.2.2 叶片的形成 | 第11页 |
| 1.2.3 叶型的调控 | 第11-12页 |
| 1.2.4 叶裂形成基因的克隆 | 第12-13页 |
| 1.3 基因的定位与克隆方法 | 第13-15页 |
| 1.3.1 基因芯片法 | 第13页 |
| 1.3.2 转座子标签法 | 第13-14页 |
| 1.3.3 同源序列分析法 | 第14页 |
| 1.3.4 图位克隆法 | 第14-15页 |
| 1.3.5 BSR-seq分析法 | 第15页 |
| 1.4 课题的由来及研究意义 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-20页 |
| 2.1 植物材料 | 第16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-20页 |
| 2.2.1 叶裂性状F_2代分离群体的构建 | 第16-17页 |
| 2.2.2 叶裂性状RNA-seq测序 | 第17页 |
| 2.2.3 叶裂性状RNA-seq数据分析 | 第17页 |
| 2.2.4 分子标记开发 | 第17-18页 |
| 2.2.5 叶裂亲本重测序 | 第18页 |
| 2.2.6 不同叶裂类型群体构建 | 第18-19页 |
| 2.2.7 叶裂性状研究路线 | 第19-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-31页 |
| 3.1 生菜叶裂性状调查 | 第20页 |
| 3.2 叶裂F_2代分离群体分析 | 第20-21页 |
| 3.3 叶裂F_2代分离群体RNA-seq数据分析 | 第21-22页 |
| 3.4 叶裂与叶完整池中RNA-seq测序数据差异表达基因分析 | 第22-23页 |
| 3.5 叶裂部位与叶完整部位差异表达基因分析 | 第23页 |
| 3.6 叶裂性状基因初定位 | 第23-25页 |
| 3.7 叶裂性状基因精细定位 | 第25-27页 |
| 3.8 叶裂候选基因分析 | 第27-29页 |
| 3.9 不同叶裂类型群体构建分析 | 第29-31页 |
| 4 讨论 | 第31-33页 |
| 4.1 BSR-seq方法实现植物目标性状的遗传定位 | 第31页 |
| 4.2 基因组存在gap的基因定位策略 | 第31-32页 |
| 4.3 精细定位的影响因素 | 第32页 |
| 4.4 工作展望 | 第32-33页 |
| 5 小结 | 第33-35页 |
| 第二章 生菜中茎刺性状的遗传定位 | 第35-57页 |
| 1 前言 | 第35-39页 |
| 1.1 刺的形成机制 | 第35-37页 |
| 1.1.1 刺的种类 | 第35-36页 |
| 1.1.2 刺的功能 | 第36-37页 |
| 1.1.3 刺的形成 | 第37页 |
| 1.2 刺形成的调控 | 第37-38页 |
| 1.3 刺形成基因的克隆 | 第38页 |
| 1.4 课题的由来及研究意义 | 第38-39页 |
| 2 材料与方法 | 第39-42页 |
| 2.1 植物材料 | 第39页 |
| 2.2 实验方法 | 第39-42页 |
| 2.2.1 生菜中刺的调查 | 第39页 |
| 2.2.2 茎刺结构的观察 | 第39页 |
| 2.2.3 茎刺F_2代分离群体的构建 | 第39-40页 |
| 2.2.4 茎刺性状RNA-seq测序 | 第40页 |
| 2.2.5 茎刺RNA-seq数据分析 | 第40-41页 |
| 2.2.6 分子标记开发 | 第41-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-54页 |
| 3.1 生菜中刺的调查分析 | 第42页 |
| 3.2 生菜中刺结构的观察分析 | 第42-43页 |
| 3.3 茎刺F_2代分离群体遗传分析 | 第43页 |
| 3.4 茎刺F_2代分离群体RNA-seq数据分析 | 第43-44页 |
| 3.5 生菜中MAGIC群体RNA-seq数据分析 | 第44页 |
| 3.6 茎刺性状基因初定位 | 第44-46页 |
| 3.7 茎刺性状基因精细定位 | 第46-48页 |
| 3.8 茎刺候选基因分析 | 第48-49页 |
| 3.9 茎刺定位区段不同时期基因表达分析 | 第49-54页 |
| 4 讨论 | 第54-56页 |
| 4.1 野生型基因组和栽培型基因组在定位区段的组装比较 | 第54-55页 |
| 4.2 植物共线性与基因克隆 | 第55页 |
| 4.3 工作展望 | 第55-56页 |
| 5 小结 | 第56-57页 |
| 全文结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 附录A | 第65-67页 |
| 附录B | 第67-69页 |
| 附录C | 第69-71页 |
| 附录D | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
