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迟钝爱德华氏菌类核蛋白H-NS调控T6SS效应子EvpP的分子机制

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 文献综述第10-19页
    1.1 迟钝爱德华氏菌第10-12页
        1.1.1 迟钝爱德华氏菌第10-11页
        1.1.2 迟钝爱德华氏菌的毒力调控网络第11页
        1.1.3 迟钝爱德华氏菌T6SS效应子EvpP第11-12页
    1.2 组蛋白样类核结构蛋白H-NS第12-18页
        1.2.1 类核蛋白H-NS的结构与主要功能第12-14页
        1.2.2 H-NS对DNA序列的识别第14-15页
        1.2.3 H-NS沉默转录的作用机制第15页
        1.2.4 H-NS与其它类核蛋白的相互作用第15-16页
        1.2.5 H-NS异源基因沉默作用的解除途径第16-18页
    1.3 本论文的主要内容和意义第18-19页
第2章 hns突变株、回补株和过表达株构建及表型分析第19-33页
    2.1 前言第19页
    2.2 实验材料第19-22页
        2.2.1 菌种、质粒、引物和培养基第19页
        2.2.2 分析材料和软件第19页
        2.2.3 主要试剂及仪器设备第19-22页
    2.3 实验方法第22-27页
        2.3.1 △1505和△2968框内缺失突变株的构建及筛选第22-25页
        2.3.2 hns过表达菌株15050E和29680E及hns回补株2968~+的构建第25-26页
        2.3.3 野生株E.tarda EIB202和hns各突变株生长曲线的测定第26-27页
        2.3.4 半致死剂量(Lethy Dosage 50,LD_50)的测定第27页
    2.4 实验结果第27-32页
        2.4.1 hns基因分析第27页
        2.4.2 插入失活突变株1505IM和框内缺失突变株△2968的构建第27页
        2.4.3 hns过表达菌株1505OE和2968OE及,△2968的回补株2968~+的构建第27-28页
        2.4.4 野生毒株E.tarda EIB202和hns各突变株及过表达株生长曲线的测定第28-30页
        2.4.5 对模式动物斑马鱼的LD_(50)第30-32页
    2.5 讨论第32页
    2.6 本章小结第32-33页
第3章 H-NS蛋白的异源表达及纯化第33-41页
    3.1 前言第33页
    3.2 实验材料第33-34页
        3.2.1 菌株、质粒、引物和培养基第33-34页
        3.2.2 分析材料及分析软件第34页
        3.2.3 主要试剂及仪器设备第34页
    3.3 实验方法第34-37页
        3.3.1 H-NS蛋白异源表达株的构建第34-35页
        3.3.2 重组蛋白的异源可溶性诱导表达第35页
        3.3.3 可溶性蛋白粗提物的制备第35页
        3.3.4 SDS-PAGE 电泳第35页
        3.3.5 Western blot分析第35-36页
        3.3.6 H-NS蛋白的分离纯化第36页
        3.3.7 Bradford蛋白浓度定量法第36-37页
    3.4 实验结果第37-39页
        3.4.1 H-NS-1505和H-NS-2968蛋白序列及结构域分析第37页
        3.4.2 H-NS蛋白异源表达株的构建第37页
        3.4.3 H-NS蛋白的诱导表达及Western blot鉴定第37-38页
        3.4.4 H-NS蛋白的纯化及鉴定第38-39页
    3.5 讨论第39-40页
    3.6 本章小结第40-41页
第4章 H-NS对T6SS效应子EvpP的调控作用第41-54页
    4.1 前言第41页
    4.2 实验材料第41-42页
        4.2.1 菌种、质粒、引物和培养基第41页
        4.2.2 分析材料及分析软件第41页
        4.2.3 主要试剂及仪器设备第41-42页
    4.3 实验方法第42-43页
        4.3.1 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第42页
        4.3.2 evpP启动子与ORF区域DNA片段的分区及扩增第42-43页
        4.3.3 电泳迁移率变动分析实验(EMSA)第43页
        4.3.4 DNase I footprinting实验第43页
        4.3.5 DNA弯曲度分析第43页
    4.4 实验结果第43-48页
        4.4.1 E.tarda EIB202中evpP基因启动子序列分析第43-44页
        4.4.2 E.tarda EIB202中H-NS对evpP转录水平的调控第44-45页
        4.4.3 EMSA实验检测H-NS与evpP基因区域的结合作用第45-47页
        4.4.4 H-NS-1505与evpP结合位点序列分析第47-48页
    4.5 讨论第48-53页
    4.6 本章小结第53-54页
第5章 H-NS与EsrB对T6SS效应子EvpP的共调控关系第54-63页
    5.1 前言第54页
    5.2 实验材料第54-57页
        5.2.1 菌种、质粒、引物和培养基第54页
        5.2.2 主要试剂及仪器设备第54-57页
    5.3 实验方法第57页
        5.3.1 使用Octet Qke检测分子相互作用第57页
        5.3.2 细菌双杂交实验第57页
    5.4 实验结果第57-60页
        5.4.1 EsrB蛋白异源表达株的构建、诱导表达及鉴定第57-58页
        5.4.2 Octet分子相互作用仪检测H-NS与EsrB对evpP基因区域结合作用第58-59页
        5.4.3 EMSA实验检测EsrB对evpP基因区域分区片段的结合情况第59页
        5.4.4 细菌双杂交实验考察H-NS与EsrB的相互作用第59-60页
    5.5 讨论第60-62页
    5.6 本章小结第62-63页
第6章 结论与展望第63-65页
    6.1 结论第63页
    6.2 创新点第63-64页
    6.3 展望第64-65页
参考文献第65-70页
攻读硕士学位期间研究成果第70-71页
致谢第71页

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