| 附件 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| List of Abbreviation | 第15-16页 |
| CHAPTER 1 General Introduction | 第16-26页 |
| 1.1 Drought tolerance | 第17-18页 |
| 1.2 Bacterial leaf blight resistance and yield loss | 第18页 |
| 1.3 Cold tolerance | 第18-20页 |
| 1.4 Genetic overlaps | 第20-21页 |
| 1.5 Methodology | 第21-24页 |
| 1.5.1 Technical route | 第21页 |
| 1.5.2 Study Material | 第21-23页 |
| 1.5.3 SNP genotyping | 第23-24页 |
| 1.5.4 Linkage map construction and QTL mapping | 第24页 |
| 1.6 Objective,scope and outline of the thesis | 第24-26页 |
| CHAPTER 2 Breeding Accomplishments and Challenges | 第26-41页 |
| 2.1 Rice botany | 第26-27页 |
| 2.2 Origin and classification | 第27-28页 |
| 2.2.1 Rice origin | 第27-28页 |
| 2.2.2 Scientific classification | 第28页 |
| 2.3 Rice Domestication Land marks | 第28-31页 |
| 2.3.1 Elimination of seed shattering | 第29-30页 |
| 2.3.2 Seed coat color | 第30-31页 |
| 2.4 Rice production trends | 第31-34页 |
| 2.5 Rice breeding Advances | 第34-41页 |
| 2.5.1 Selection | 第34-35页 |
| 2.5.2 Hybridization Breeding | 第35-36页 |
| 2.5.3 Tissue culture | 第36-37页 |
| 2.5.4 Molecular breeding | 第37-38页 |
| 2.5.6 Genetic engineering | 第38-41页 |
| CHAPTER 3 Genetic Variation,Heritability and QTL analysis under Drought Stress andIrrigation Conditions in extreme lines | 第41-79页 |
| 3.1 Summary | 第41-42页 |
| 3.2 Introduction | 第42-45页 |
| 3.3 Study Material | 第45页 |
| 3.4 Methods | 第45-47页 |
| 3.4.1 Field management and drought stress application | 第45-46页 |
| 3.4.2 Phenotyping | 第46页 |
| 3.4.3 Analysis | 第46-47页 |
| 3.5 Results and Discussion | 第47-72页 |
| 3.5.1 Drought Resistant Genotypes | 第47-48页 |
| 3.5.2 Phenotypic characterization of the populations | 第48-49页 |
| 3.5.3 Genetic Variation under Drought Stress and Normal Irrigation Conditions | 第49页 |
| 3.5.4 Heritability and Performance of BILs under Different Water Regimes | 第49-55页 |
| 3.5.5 Pearson's Linear Correlation | 第55-56页 |
| 3.5.6 Path Analyses for Direct and Indirect Effects | 第56-61页 |
| 3.5.7 Quantitative trait locus(QTL)analysis | 第61-68页 |
| 3.5.8 Overlapping QTLs | 第68-70页 |
| 3.5.9 EPISTATIC Interactions(QE) | 第70-71页 |
| 5.5.10 Epistatic interactions | 第71-72页 |
| 3.6 Discussion | 第72-77页 |
| 3.6.1 Co-localization of QTLs of different traits | 第72-76页 |
| 3.6.2 Effects of Genetic Background(GB) on the expressions of QTLs | 第76-77页 |
| 3.7 Conclusion | 第77-79页 |
| CHAPTER 4 Associations between yield related traits and bacterial leaf blight(BB)resistances | 第79-104页 |
| 4.1 Summary | 第79-80页 |
| 4.2 Introduction | 第80-81页 |
| 4.3 Methodology | 第81-83页 |
| 4.3.1 Inoculums preparation | 第81-82页 |
| 4.3.2 BB inoculation and assessment | 第82页 |
| 4.3.3 3 Flag leaf size measurements | 第82-83页 |
| 4.3.4 Statistical analysis | 第83页 |
| 4.4 Results | 第83-94页 |
| 4.4.1 BB resistance genotypes | 第83-84页 |
| 4.4.2 Lesion length distribution | 第84-85页 |
| 4.4.3 Performances of yield related traits under BB stress and control conditions | 第85页 |
| 4.4.4 Combining multiple BB resistance and grain yield | 第85-87页 |
| 4.4.5 Correlation Analysis | 第87-88页 |
| 4.4.6 Marker trait associations | 第88-90页 |
| 4.4.7 QTL mapping results | 第90-94页 |
| 4.5 Discussion | 第94-102页 |
| 4.5.1 Bacterial leaf blight resistance | 第94-98页 |
| 4.5.2 Epistasis QTLs in BB resistance | 第98-99页 |
| 4.5.3 Overlapping QTLs for both BB resistance and yield related traits | 第99-102页 |
| 4.6 Conclusion | 第102-104页 |
| CHAPTER 5 QTL mapping for low-temperature tolerance at reproduction stage in rice | 第104-118页 |
| 5.1 Summary | 第104页 |
| 5.2 Introduction | 第104-106页 |
| 5.3 Methods | 第106-107页 |
| 5.3.1 Identification of cold tolerance(CT)in rice at the reproductive stage | 第106-107页 |
| 5.4 Result and Discussion | 第107-116页 |
| 5.4.1 phenotype variations | 第107-108页 |
| 5.4.2 Correlations among yield related traits in low-temperature conditions | 第108-109页 |
| 5.4.3 Heritability and Performance of BILs under Low-temperature | 第109-110页 |
| 5.4.4 Selected cold tolerant lines | 第110-111页 |
| 5.4.5 QTL tolerant at reproductive stage | 第111-112页 |
| 5.4.6 Overlapping Cold tolerance QTLs | 第112-116页 |
| 5.6 Conclusion | 第116-118页 |
| Chapter 6 Genetic overlap between Bacterial blight,drought and low temperature stressesin rice | 第118-135页 |
| 6.1 Summary | 第118页 |
| 6.2 Introduction | 第118-121页 |
| 6.3 Results | 第121-128页 |
| 6.3.1 BILs and parents performance | 第121页 |
| 6.3.2 Correlations between Drought Tolerance and BB resistant related Traits | 第121-125页 |
| 6.3.3 Introgression patterns of multiple tolerant lines | 第125-128页 |
| 6.4 Discussion | 第128-133页 |
| 6.4.1 Overlap of drought tolerance BB resistance and low-temperature QTLs | 第128-133页 |
| 6.5 Conclusion | 第133-135页 |
| CHAPTER 7 General Discussion | 第135-144页 |
| 7.1 Introduction | 第135-136页 |
| 7.2 Genetic variation,heritability and performance of BILs under DS,BB,LT andnormal irrigation | 第136-137页 |
| 7.3 Genetic inheritance of physiological and productivity traits | 第137-139页 |
| 7.4 QTL Co-localization and genetic overlaps between drought,BB and LT stresses | 第139-142页 |
| 7.5 Conclusions and implications for improving drought tolerance,BB resistance,andlow-temperature tolerances in rice | 第142-144页 |
| Reference | 第144-163页 |
| Acknowledgements | 第163-164页 |
| Bibliography | 第164-165页 |
| 9.1 Publications | 第165页 |
| 9.1.1 Articles submitted and published | 第165页 |
| 9.1.2 Articles submitted | 第165页 |
| 9.1.3 Articles in preparation | 第165页 |
