| 中文摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 缩略词表 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 1.1 引言 | 第16页 |
| 1.2 水稻功能基因研究 | 第16-21页 |
| 1.2.1 植物功能基因组研究 | 第16-18页 |
| 1.2.2 中国水稻功能基因组研究 | 第18-21页 |
| 1.3 水稻蛋白质组学研究进展 | 第21-27页 |
| 1.3.1 水稻组织器官的蛋白质组研究 | 第22-24页 |
| 1.3.2 水稻亚细胞水平蛋白质组研究 | 第24页 |
| 1.3.3 逆境胁迫下的水稻蛋白质组 | 第24-25页 |
| 1.3.4 激素诱导下的水稻蛋白质组 | 第25-26页 |
| 1.3.5 水稻突变体的蛋白质组 | 第26-27页 |
| 1.4 水稻卷叶性状的研究进展 | 第27-30页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第30-32页 |
| 第二章 水稻卷叶突变体叶片形态特征及生理生化差异 | 第32-46页 |
| 2.1 研究材料 | 第32页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第32页 |
| 2.1.2 主要研究仪器与试剂 | 第32页 |
| 2.2 研究方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 水稻叶片形态观察及石腊切片组织观察 | 第32-33页 |
| 2.2.2 叶绿素含量测定及光合速率测定 | 第33页 |
| 2.2.3 农艺性状统计及分析 | 第33页 |
| 2.2.4 水稻籽粒氨基酸含量分析 | 第33-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-43页 |
| 2.3.1 水稻叶片形态观察 | 第34-36页 |
| 2.3.2 水稻叶片横截面结构差异分析 | 第36-37页 |
| 2.3.3 叶绿素含量和光合效率差异分析 | 第37-39页 |
| 2.3.4 农艺性状统计与分析 | 第39-40页 |
| 2.3.5 水稻籽粒氨基酸含量分析 | 第40-43页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第43-46页 |
| 第三章 水稻卷叶性状遗传分析 | 第46-60页 |
| 3.1 研究材料 | 第46页 |
| 3.1.1 材料 | 第46页 |
| 3.1.2 主要研究仪器与试剂 | 第46页 |
| 3.2 研究方法 | 第46-48页 |
| 3.2.1 DNA提取 | 第46页 |
| 3.2.2 实时荧光定量PCR法分析外源基因拷贝数 | 第46-47页 |
| 3.2.3 T-DNA侧翼序列扩增 | 第47-48页 |
| 3.3 结果与分析 | 第48-57页 |
| 3.3.1 卷叶性状的遗传分析 | 第48-49页 |
| 3.3.2 外源基因拷贝数确定 | 第49-51页 |
| 3.3.3 T-DNA与卷叶性状的共分离检测 | 第51-52页 |
| 3.3.4 TAIL-PCR确定外源基因插入位点 | 第52-57页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第57-60页 |
| 第四章 水稻卷叶突变体蛋白质组差异分析 | 第60-78页 |
| 4.1 研究材料 | 第60页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第60页 |
| 4.1.2 主要研究仪器与试剂 | 第60页 |
| 4.2 研究方法 | 第60-61页 |
| 4.2.1 蛋白质双向电泳分析 | 第60页 |
| 4.2.2 图像分析 | 第60-61页 |
| 4.2.3 胶内原位酶解 | 第61页 |
| 4.2.4 质谱分析 | 第61页 |
| 4.3 结果与分析 | 第61-75页 |
| 4.3.1 双向电泳图谱 | 第61-67页 |
| 4.3.2 蛋白质差异分析 | 第67-70页 |
| 4.3.3 差异表达蛋白质鉴定 | 第70-72页 |
| 4.3.4 差异表达蛋白质功能分类 | 第72-75页 |
| 4.4 小结与讨论 | 第75-78页 |
| 第五章 水稻卷叶突变体表达谱分析 | 第78-116页 |
| 5.1 研究材料 | 第78页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第78页 |
| 5.2 研究方法 | 第78-80页 |
| 5.2.1 RNA样品制备 | 第78-79页 |
| 5.2.2 DGE测序 | 第79页 |
| 5.2.3 对应软件开发 | 第79页 |
| 5.2.4 生物信息学分析 | 第79-80页 |
| 5.2.5 DGE技术方法和路线 | 第80页 |
| 5.3 结果与分析 | 第80-113页 |
| 5.3.1 Total RNA样品检测 | 第80-82页 |
| 5.3.2 原始序列数据 | 第82-83页 |
| 5.3.3 测序数据质量评估 | 第83-88页 |
| 5.3.4 参考序列比对分析 | 第88-92页 |
| 5.3.5 基因表达水平分析 | 第92-100页 |
| 5.3.6 差异基因GO富集分析 | 第100-108页 |
| 5.3.7 差异基因KEGG富集分析 | 第108-113页 |
| 5.4 小结与讨论 | 第113-116页 |
| 第六章 全文结论与展望 | 第116-118页 |
| 6.1 全文结论 | 第116-117页 |
| 6.2 创新之处 | 第117页 |
| 6.3 研究展望 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-130页 |
| 附录 | 第130-150页 |
| 附录1：石蜡切片制作方法 | 第130-131页 |
| 附录2 SDS小量法提取水稻DNA | 第131页 |
| 附录3 CTAB大量法提取水稻DNA | 第131-132页 |
| 附录4 水稻叶片双向电泳分析 | 第132-133页 |
| 附录5 蛋白点胶内原位酶解 | 第133-134页 |
| 附录6 质谱检测 | 第134-135页 |
| 附录7 差异基因GO富集DAG图 | 第135-139页 |
| 附录8 富集KEGG通路图(Rolled vs WT) | 第139-150页 |
| 致谢 | 第150页 |