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翻译中mRNA与蛋白质的定量关系及其生物学意义研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 前言第7-14页
    1.1 选题意义第7-8页
    1.2 研究现状第8-14页
2 研究策略第14-17页
    2.1 总体技术路线第14页
    2.2 总mRNA和RNC-mRNA测序第14-15页
    2.3 SILAC相对定量蛋白质组第15-17页
3 材料与方法第17-28页
    3.1 实验材料第17-19页
    3.2 实验方法第19-28页
4 结果第28-65页
    4.1 STR和支原体检测表明本研究所用细胞株为纯培养第28-30页
    4.2 真核细胞RNC提取技术优化第30-32页
    4.3 高质量RNA和RNC-RNA提取第32-33页
    4.4 NGS数据匹配结果汇总第33-34页
    4.5 基于SILAC技术的相对定量蛋白质组结果第34-36页
    4.6 总mRNA、RNC-mRNA和蛋白质组数据比较第36-38页
    4.7 RNC-mRNA鉴定可靠性检验第38-39页
    4.8 RNC-mRNA丰度与蛋白质鉴定率具相关性第39-40页
    4.9 RNA与蛋白质丰度的关系中存在另外的关键变量第40-41页
    4.10 RNC-mRNA、蛋白质相对丰度与mRNA长度间存在紧密的相关关系第41-43页
    4.11 mRNA长度与翻译起始效率负相关第43-46页
    4.12 恶性肿瘤中TR全局性上调且TR下调基因集中分布于特定染色体第46-49页
    4.13 翻译调控与表型密切相关第49-55页
    4.14 同一基因不同剪接变体的翻译存在偏好性第55-57页
    4.15 翻译过程定量关系在稳态细胞中广泛存在第57-60页
    4.16 翻译过程定量关系同样存在于非稳态细胞模型第60-65页
5 讨论第65-76页
    5.1 RNC-mRNA测序可获得翻译中mRNA的全长信息用于TR分析第65-67页
    5.2 RNC-mRNA、蛋白质丰度和mRNA长度存在紧密的三元线性相关关系第67-69页
    5.3 mRNA长度通过翻译起始效率对蛋白质丰度造成影响第69-71页
    5.4 TR具表型特异性第71-72页
    5.5 细胞中同一基因的不同AST存在非等比翻译第72-73页
    5.6 RNC-mRNA测序可为新蛋白质发现提供关键信息第73-74页
    5.7 非稳态细胞中RNC-mRNA与蛋白质丰度的定量关系第74-75页
    5.8 展望第75-76页
全文总结及创新性说明第76-77页
参考文献第77-85页
附录第85-94页
在学期间成果第94-96页
致谢第96页

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