摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
1 前言 | 第7-14页 |
1.1 选题意义 | 第7-8页 |
1.2 研究现状 | 第8-14页 |
2 研究策略 | 第14-17页 |
2.1 总体技术路线 | 第14页 |
2.2 总mRNA和RNC-mRNA测序 | 第14-15页 |
2.3 SILAC相对定量蛋白质组 | 第15-17页 |
3 材料与方法 | 第17-28页 |
3.1 实验材料 | 第17-19页 |
3.2 实验方法 | 第19-28页 |
4 结果 | 第28-65页 |
4.1 STR和支原体检测表明本研究所用细胞株为纯培养 | 第28-30页 |
4.2 真核细胞RNC提取技术优化 | 第30-32页 |
4.3 高质量RNA和RNC-RNA提取 | 第32-33页 |
4.4 NGS数据匹配结果汇总 | 第33-34页 |
4.5 基于SILAC技术的相对定量蛋白质组结果 | 第34-36页 |
4.6 总mRNA、RNC-mRNA和蛋白质组数据比较 | 第36-38页 |
4.7 RNC-mRNA鉴定可靠性检验 | 第38-39页 |
4.8 RNC-mRNA丰度与蛋白质鉴定率具相关性 | 第39-40页 |
4.9 RNA与蛋白质丰度的关系中存在另外的关键变量 | 第40-41页 |
4.10 RNC-mRNA、蛋白质相对丰度与mRNA长度间存在紧密的相关关系 | 第41-43页 |
4.11 mRNA长度与翻译起始效率负相关 | 第43-46页 |
4.12 恶性肿瘤中TR全局性上调且TR下调基因集中分布于特定染色体 | 第46-49页 |
4.13 翻译调控与表型密切相关 | 第49-55页 |
4.14 同一基因不同剪接变体的翻译存在偏好性 | 第55-57页 |
4.15 翻译过程定量关系在稳态细胞中广泛存在 | 第57-60页 |
4.16 翻译过程定量关系同样存在于非稳态细胞模型 | 第60-65页 |
5 讨论 | 第65-76页 |
5.1 RNC-mRNA测序可获得翻译中mRNA的全长信息用于TR分析 | 第65-67页 |
5.2 RNC-mRNA、蛋白质丰度和mRNA长度存在紧密的三元线性相关关系 | 第67-69页 |
5.3 mRNA长度通过翻译起始效率对蛋白质丰度造成影响 | 第69-71页 |
5.4 TR具表型特异性 | 第71-72页 |
5.5 细胞中同一基因的不同AST存在非等比翻译 | 第72-73页 |
5.6 RNC-mRNA测序可为新蛋白质发现提供关键信息 | 第73-74页 |
5.7 非稳态细胞中RNC-mRNA与蛋白质丰度的定量关系 | 第74-75页 |
5.8 展望 | 第75-76页 |
全文总结及创新性说明 | 第76-77页 |
参考文献 | 第77-85页 |
附录 | 第85-94页 |
在学期间成果 | 第94-96页 |
致谢 | 第96页 |