| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-36页 |
| 1.1 白背飞虱概述 | 第12-13页 |
| 1.2 昆虫基因组研究进展 | 第13-15页 |
| 1.3 测序技术概述 | 第15-26页 |
| 1.3.1 文库构建 | 第15-19页 |
| 1.3.2 第一代测序技术 | 第19-20页 |
| 1.3.3 第二代测序技术 | 第20-25页 |
| 1.3.4 第三代测序技术 | 第25-26页 |
| 1.4 昆虫免疫系统和南方水稻黑条矮缩病毒研究进展 | 第26-33页 |
| 1.4.1 昆虫免疫系统概述 | 第26页 |
| 1.4.2 昆虫中几种重要的免疫信号通路概述 | 第26-28页 |
| 1.4.3 南方水稻黑条矮缩病毒研究进展 | 第28-29页 |
| 1.4.4 植物病毒与介体昆虫互作研究进展 | 第29-33页 |
| 1.5 总结 | 第33-36页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第36-66页 |
| 2.1 实验材料 | 第36-45页 |
| 2.1.1 实验所用白背飞虱和水稻 | 第36页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第36-37页 |
| 2.1.3 实验常规试剂 | 第37-40页 |
| 2.1.4 试剂配制 | 第40-45页 |
| 2.2 实验方法 | 第45-66页 |
| 2.2.1 白背飞虱饲养 | 第45页 |
| 2.2.2 流式细胞仪估算基因组大小 | 第45-46页 |
| 2.2.3 昆虫基因组DNA提取 | 第46-47页 |
| 2.2.4 DNA琼脂糖电泳回收 | 第47页 |
| 2.2.5 常规Pair-end DNA文库构建 | 第47-49页 |
| 2.2.6 Mate pair文库构建 | 第49-53页 |
| 2.2.7 白背飞虱基因组组装与蛋白编码基因预测 | 第53-54页 |
| 2.2.8 遗传图谱构建 | 第54-55页 |
| 2.2.9 白背飞虱核糖体RNA去除 | 第55-57页 |
| 2.2.10 转录组文库构建 | 第57-59页 |
| 2.2.11 总RNA提取与反转录 | 第59-60页 |
| 2.2.12 实时荧光定量PCR技术 | 第60页 |
| 2.2.13 CaCl_2法大肠杆菌感受态细胞制备 | 第60-61页 |
| 2.2.14 白背飞虱传毒实验 | 第61-63页 |
| 2.2.15 白背飞虱细胞系建立、病毒侵染和检测 | 第63-66页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第66-106页 |
| 3.1 白背飞虱基因组测序 | 第66-77页 |
| 3.1.1 白背飞虱基因组大小估计 | 第66-67页 |
| 3.1.2 低杂合度白背飞虱群体获得以及基因组文库构建与测序 | 第67-71页 |
| 3.1.3 白背飞虱基因组组装 | 第71-73页 |
| 3.1.4 构建白背飞虱遗传连锁图谱 | 第73-77页 |
| 3.2 白背飞虱免疫系统以及相关基因鉴定 | 第77-90页 |
| 3.2.1 白背飞虱免疫基因鉴定 | 第77-78页 |
| 3.2.2 免疫识别家族 | 第78-82页 |
| 3.2.3 Toll和IMD信号通路 | 第82-84页 |
| 3.2.4 JAK-STAT信号通路和RNA干扰信号通路 | 第84-87页 |
| 3.2.5 黑化反应 | 第87-88页 |
| 3.2.6 抗菌肽等 | 第88-90页 |
| 3.3 白背飞虱与南方水稻黑条矮缩病毒互作分析 | 第90-102页 |
| 3.3.1 南方水稻黑条矮缩病毒侵染的白背飞虱病毒滴度存在个体差异 | 第90-92页 |
| 3.3.2 南方水稻黑条矮缩病毒侵染白背飞虱后转录本变化 | 第92-95页 |
| 3.3.3 南方水稻黑条矮缩病毒侵染的白背飞虱细胞免疫和体液免疫受抑制 | 第95-96页 |
| 3.3.4 南方水稻黑条矮缩病毒滴度依赖的白背飞虱差异基因表达分析 | 第96-98页 |
| 3.3.5 RNAi信号通路参与白背飞虱抗病毒免疫反应 | 第98-102页 |
| 3.4 讨论 | 第102-106页 |
| 参考文献 | 第106-120页 |
| 附录 | 第120-146页 |
| 致谢 | 第146-148页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第148页 |
