摘要 | 第9-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-21页 |
1 动物的脂肪代谢 | 第11-12页 |
1.1 脂质的消化吸收和运转 | 第11页 |
1.2 三酰甘油的降解与合成 | 第11-12页 |
1.2.1 三酰甘油的降解 | 第11-12页 |
1.2.2 三酰甘油的合成 | 第12页 |
1.3 磷脂的降解与合成 | 第12页 |
1.4 胆固醇的降解与合成 | 第12页 |
2 生物microRNAs的研究进展 | 第12-14页 |
2.1 MicroRNA的特征及功能 | 第12页 |
2.2 MiRNA的产生与作用机制 | 第12-13页 |
2.3 MiRNA的命名 | 第13-14页 |
2.4 MiRNA的研究进展 | 第14页 |
3 MiRNA在脂肪代谢中的作用 | 第14-15页 |
4 基于高通量测序的miRNA研究 | 第15-16页 |
5 脂类代谢的相关基因 | 第16-17页 |
5.1 CXCL16基因 | 第16页 |
5.2 VLDLR基因 | 第16页 |
5.3 ABCA1基因 | 第16页 |
5.4 APOA基因 | 第16页 |
5.5 APOB基因 | 第16-17页 |
6 供试绵羊品种 | 第17页 |
7 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
参考文献 | 第18-21页 |
第二章 肾周脂肪组织microRNA的差异表达特征 | 第21-41页 |
1 材料与方法 | 第21-30页 |
1.1 试验样本 | 第21-22页 |
1.2 试验试剂、耗材、仪器及溶液配制 | 第22页 |
1.3 试验方法 | 第22-25页 |
1.3.1 总RNA提取及质量鉴定 | 第22-23页 |
1.3.2 小RNA的分离 | 第23页 |
1.3.3 小RNA文库的构建 | 第23-25页 |
1.3.4 小RNA建库的引物设计 | 第25页 |
1.4 生物信息学分析 | 第25-27页 |
1.4.1 测序原始数据处理和小RNA长度统计 | 第25页 |
1.4.2 小RNA的序列比对分析 | 第25-26页 |
1.4.3 新miRNAs的预测 | 第26页 |
1.4.4 已知miRNAs的差异分析 | 第26-27页 |
1.5 Stem-loop RT-PCR验证 | 第27-29页 |
1.5.1 MiRNA特异性反转录茎环引物的设计 | 第27页 |
1.5.2 荧光定量PCR引物设计 | 第27-28页 |
1.5.3 反转录 | 第28页 |
1.5.4 荧光定量PCR反应条件的优化 | 第28-29页 |
1.6 荧光定量PCR的数据处理与分析 | 第29-30页 |
2 结果与分析 | 第30-37页 |
2.1 总RNA的提取结果 | 第30-31页 |
2.2 小RNA测序原始数据的序列信息 | 第31-32页 |
2.3 小RNA测序数据的分类注释情况 | 第32-34页 |
2.3.1 小RNA的序列比对结果 | 第32-33页 |
2.3.2 分类注释的小RNA序列 | 第33-34页 |
2.3.3 预测的新miRNAs | 第34页 |
2.4 鉴定与分析的已知miRNAs | 第34-35页 |
2.5 已知miRNAs的表达差异 | 第35-36页 |
2.6 Stem-loop RT-PCR验证结果 | 第36-37页 |
3 讨论 | 第37-39页 |
参考文献 | 第39-41页 |
第三章 调节绵羊脂肪代谢关键microRNA的筛选与靶基因预测 | 第41-53页 |
1 材料与方法 | 第41-43页 |
1.1 试验动物和样品采集 | 第41-42页 |
1.1.1 试验动物 | 第41页 |
1.1.2 样本采集及指标测定 | 第41-42页 |
1.2 试验试剂、耗材及仪器 | 第42页 |
1.3 试验方法 | 第42页 |
1.3.1 总RNA的提取及质量检测 | 第42页 |
1.3.2 miRNA反转录茎环引物及荧光定量PCR的引物设计 | 第42页 |
1.3.3 实时荧光定量PCR反应 | 第42页 |
1.4 荧光定量PCR的数据处理与分析 | 第42页 |
1.5 MiR-376e-3p的靶基因预测 | 第42-43页 |
1.5.1 利用MicroCosm Targets的靶基因预测 | 第43页 |
1.5.2 利用miRDB的靶基因预测 | 第43页 |
1.5.3 利用miRGator的靶基因预测 | 第43页 |
1.6 MiRNA靶基因的生物学功能分析 | 第43页 |
2 结果与分析 | 第43-48页 |
2.1 总RNA提取质量及引物特异性 | 第43-44页 |
2.2 品种、性别和月龄及二因素互作对miRNA表达的影响 | 第44-45页 |
2.3 预测的miRNAs靶基因 | 第45-46页 |
2.4 分析miRNAs靶基因的生物学功能 | 第46-48页 |
3 讨论 | 第48-51页 |
3.1 品种对miRNA表达的影响 | 第48页 |
3.2 性别对miRNA表达的影响 | 第48-49页 |
3.3 MiRNA表达的异时性 | 第49页 |
3.4 不同预测方法对miRNA的靶基因预测的影响 | 第49-50页 |
3.5 MiR-376e-3p的靶基因的生物学功能分析 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-53页 |
全文结论 | 第53-54页 |
特色与创新 | 第54-55页 |
附录一 试验试剂仪器及溶液配置 | 第55-56页 |
附录二 文库间存在差异表达的miRNAs | 第56-65页 |
附录三 文库间差异表达miRNAs聚类分析 | 第65-66页 |
附录四 在读期间发表论文及获奖情况 | 第66-67页 |
Abstract | 第67-68页 |
致谢 | 第69页 |