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基于小RNA组的绵羊脂肪代谢关键microRNAs的鉴别

摘要第9-11页
第一章 文献综述第11-21页
    1 动物的脂肪代谢第11-12页
        1.1 脂质的消化吸收和运转第11页
        1.2 三酰甘油的降解与合成第11-12页
            1.2.1 三酰甘油的降解第11-12页
            1.2.2 三酰甘油的合成第12页
        1.3 磷脂的降解与合成第12页
        1.4 胆固醇的降解与合成第12页
    2 生物microRNAs的研究进展第12-14页
        2.1 MicroRNA的特征及功能第12页
        2.2 MiRNA的产生与作用机制第12-13页
        2.3 MiRNA的命名第13-14页
        2.4 MiRNA的研究进展第14页
    3 MiRNA在脂肪代谢中的作用第14-15页
    4 基于高通量测序的miRNA研究第15-16页
    5 脂类代谢的相关基因第16-17页
        5.1 CXCL16基因第16页
        5.2 VLDLR基因第16页
        5.3 ABCA1基因第16页
        5.4 APOA基因第16页
        5.5 APOB基因第16-17页
    6 供试绵羊品种第17页
    7 本研究的目的和意义第17-18页
    参考文献第18-21页
第二章 肾周脂肪组织microRNA的差异表达特征第21-41页
    1 材料与方法第21-30页
        1.1 试验样本第21-22页
        1.2 试验试剂、耗材、仪器及溶液配制第22页
        1.3 试验方法第22-25页
            1.3.1 总RNA提取及质量鉴定第22-23页
            1.3.2 小RNA的分离第23页
            1.3.3 小RNA文库的构建第23-25页
            1.3.4 小RNA建库的引物设计第25页
        1.4 生物信息学分析第25-27页
            1.4.1 测序原始数据处理和小RNA长度统计第25页
            1.4.2 小RNA的序列比对分析第25-26页
            1.4.3 新miRNAs的预测第26页
            1.4.4 已知miRNAs的差异分析第26-27页
        1.5 Stem-loop RT-PCR验证第27-29页
            1.5.1 MiRNA特异性反转录茎环引物的设计第27页
            1.5.2 荧光定量PCR引物设计第27-28页
            1.5.3 反转录第28页
            1.5.4 荧光定量PCR反应条件的优化第28-29页
        1.6 荧光定量PCR的数据处理与分析第29-30页
    2 结果与分析第30-37页
        2.1 总RNA的提取结果第30-31页
        2.2 小RNA测序原始数据的序列信息第31-32页
        2.3 小RNA测序数据的分类注释情况第32-34页
            2.3.1 小RNA的序列比对结果第32-33页
            2.3.2 分类注释的小RNA序列第33-34页
            2.3.3 预测的新miRNAs第34页
        2.4 鉴定与分析的已知miRNAs第34-35页
        2.5 已知miRNAs的表达差异第35-36页
        2.6 Stem-loop RT-PCR验证结果第36-37页
    3 讨论第37-39页
    参考文献第39-41页
第三章 调节绵羊脂肪代谢关键microRNA的筛选与靶基因预测第41-53页
    1 材料与方法第41-43页
        1.1 试验动物和样品采集第41-42页
            1.1.1 试验动物第41页
            1.1.2 样本采集及指标测定第41-42页
        1.2 试验试剂、耗材及仪器第42页
        1.3 试验方法第42页
            1.3.1 总RNA的提取及质量检测第42页
            1.3.2 miRNA反转录茎环引物及荧光定量PCR的引物设计第42页
            1.3.3 实时荧光定量PCR反应第42页
        1.4 荧光定量PCR的数据处理与分析第42页
        1.5 MiR-376e-3p的靶基因预测第42-43页
            1.5.1 利用MicroCosm Targets的靶基因预测第43页
            1.5.2 利用miRDB的靶基因预测第43页
            1.5.3 利用miRGator的靶基因预测第43页
        1.6 MiRNA靶基因的生物学功能分析第43页
    2 结果与分析第43-48页
        2.1 总RNA提取质量及引物特异性第43-44页
        2.2 品种、性别和月龄及二因素互作对miRNA表达的影响第44-45页
        2.3 预测的miRNAs靶基因第45-46页
        2.4 分析miRNAs靶基因的生物学功能第46-48页
    3 讨论第48-51页
        3.1 品种对miRNA表达的影响第48页
        3.2 性别对miRNA表达的影响第48-49页
        3.3 MiRNA表达的异时性第49页
        3.4 不同预测方法对miRNA的靶基因预测的影响第49-50页
        3.5 MiR-376e-3p的靶基因的生物学功能分析第50-51页
    参考文献第51-53页
全文结论第53-54页
特色与创新第54-55页
附录一 试验试剂仪器及溶液配置第55-56页
附录二 文库间存在差异表达的miRNAs第56-65页
附录三 文库间差异表达miRNAs聚类分析第65-66页
附录四 在读期间发表论文及获奖情况第66-67页
Abstract第67-68页
致谢第69页

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