| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| 1.1 研究目的与意义 | 第12-13页 |
| 1.1.1 生物多样性 | 第12-13页 |
| 1.1.2 土壤微生物多样性 | 第13页 |
| 1.1.3 土壤真菌多样性 | 第13页 |
| 1.1.4 研究若尔盖湿地土壤真菌多样性的意义 | 第13页 |
| 1.2 国内外关于该课题的现状及趋势 | 第13-20页 |
| 1.2.1 土壤真菌研究进展 | 第13-17页 |
| 1.2.1.1 土壤真菌研究简史 | 第13-14页 |
| 1.2.1.2 十壤真菌研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2.1.3 土壤真菌多样性 | 第15-16页 |
| 1.2.1.3 土壤真菌生态位 | 第16-17页 |
| 1.2.2 土壤真菌多样性和生态位的指标 | 第17-18页 |
| 1.2.3 关于土壤微生物生态的研究方法 | 第18-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-28页 |
| 2.1 稀释平板分离法 | 第20-23页 |
| 2.1.1 样品的采集 | 第20-22页 |
| 2.1.2 真菌的分离 | 第22-23页 |
| 2.1.3 计数 | 第23页 |
| 2.1.4 菌株的获得、纯化与保存 | 第23页 |
| 2.1.5 形态鉴定 | 第23页 |
| 2.2 分子鉴定 | 第23-26页 |
| 2.2.1 CTAB法提取菌丝DNA | 第23-24页 |
| 2.2.2 ITS、β-tublin、GAPDH的PCR扩增 | 第24-26页 |
| 2.2.3 测序及分析 | 第26页 |
| 2.3 高通量测序 | 第26-28页 |
| 2.3.1 土壤DNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.3.2 测序 | 第27页 |
| 2.3.3 测序数据分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3.1 测序数据质量分析及优化 | 第27页 |
| 2.3.3.2 OTU(Operational Taxonomic Units)分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3.3 Rank-Abundance曲线 | 第28页 |
| 2.3.3.4 物种分类分析 | 第28页 |
| 2.3.3.5 稀释曲线 | 第28页 |
| 2.3.3.6 多样性指数 | 第28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-74页 |
| 3.1 基于稀释平板法的土壤真菌多样性 | 第28-62页 |
| 3.1.1 土壤真菌数量 | 第28-29页 |
| 3.1.2 真菌的形态鉴定 | 第29页 |
| 3.1.3 真菌的系统发育分析 | 第29-56页 |
| 3.1.4 不同土壤类型的土壤真菌种水平分布情况 | 第56-57页 |
| 3.1.5 各个种在土壤类型及土壤深度因子上的生态位宽度及重叠 | 第57-61页 |
| 3.1.6 土壤真菌种水平多样性指数 | 第61-62页 |
| 3.2 基于高通量测序的土壤真菌多样性 | 第62-74页 |
| 3.2.1 测序数据质量分析 | 第62-63页 |
| 3.2.2 OTU分析 | 第63-64页 |
| 3.2.3 Rank-Abundance曲线 | 第64页 |
| 3.2.4 物种分类分析 | 第64-67页 |
| 3.2.5 物种生态位分析 | 第67-70页 |
| 3.2.6 稀释曲线 | 第70页 |
| 3.2.7 PCoA分析 | 第70-74页 |
| 4 结论与讨论 | 第74-78页 |
| 4.1 稀释平板法 | 第74-75页 |
| 4.1.1 土壤真菌数量 | 第74页 |
| 4.1.2 土壤真菌种类与多样性 | 第74-75页 |
| 4.2 高通量测序 | 第75-76页 |
| 4.2.1 高通量测序数据质量 | 第75页 |
| 4.2.2 各样点的OTU比较 | 第75页 |
| 4.2.3 物种分类分析 | 第75-76页 |
| 4.3 不同样点之间的差异性分析 | 第76-77页 |
| 4.4 传统方法与高通量测序的结果比较 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
