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甜樱桃果实花青苷形成的生理生化与转录组分析

中文摘要第1-11页
Abstract第11-14页
1 前言第14-32页
   ·花青苷的结构和基本性质第14-15页
   ·花青苷在植物体中的作用及其生物活性第15-16页
     ·花青苷在植物体中的作用第15-16页
     ·花青苷的生物活性第16页
   ·花青苷的提取、纯化和定性、定量分析第16-19页
     ·花青苷的提、纯化第16-17页
     ·花青苷的定性定量分析第17-19页
   ·花青苷的生物合成及其调控机制第19-28页
     ·花青苷生物合成途径及其关键酶第19-20页
     ·关键结构基因的表达调控第20-22页
     ·花青苷生物合成的转录调控第22-24页
     ·园艺植物花青苷合成的转录调控第24-26页
     ·花青苷生物合成的其它影响因素第26-28页
   ·转录组测序(RNA-Seq)技术及其在果树生物学研究中的应用第28-31页
     ·转录组及RNA-Seq概述第28-29页
     ·RNA-Seq在果树上的应用第29-31页
   ·本研究的目的意义第31-32页
2 材料与方法第32-45页
   ·试验材料第32-33页
     ·植物材料及样品采集第32页
     ·菌株和载体第32页
     ·主要药品、试剂盒和仪器第32-33页
     ·PCR引物第33页
   ·试验方法第33-45页
     ·叶绿素与类胡萝素含量的测定第33-34页
     ·PAL和CHI酶活性测定第34页
     ·DFR和UFGT酶活性测定第34-35页
     ·果皮中花青苷的提取、纯化、含量和组分测定第35-36页
     ·可溶性糖和有机酸的HPLC分析第36页
     ·总RNA的提取和检测第36-37页
     ·甜樱桃果实转录组文库构建及高通量测序第37-38页
     ·转录组的生物信息学分析第38-40页
     ·数字基因表达谱分析第40-41页
     ·qRT-PCR分析第41-42页
     ·目的基因克隆第42-44页
     ·序列分析和同源性比较第44-45页
3 结果与分析第45-77页
   ·不同色泽甜樱桃果实发育期间叶绿素、花青苷及相关酶活性变化第45-48页
     ·叶绿素与类胡萝卜素含量变化第45页
     ·花青苷含量变化第45-46页
     ·PAL、CHI、DFR和UFGT酶活性变化第46-48页
   ·不同色泽甜樱桃果实发育期间花青苷、可溶性糖、有机酸组分和含量变化第48-59页
     ·甜樱桃花青苷类物质UPLC/MS/MS定性定量检测方法的建立第48-53页
     ·不同色泽甜樱桃果实发育期间花青苷组分及含量测定第53-55页
     ·不同色泽甜樱桃果实发育期间可溶性糖组份及含量测定第55-56页
     ·不同色泽甜樱桃果实发育期间有机酸组分及含量的测定第56-59页
   ·甜樱桃果实转录组测序及生物信息学分析第59-65页
     ·RNA提取及质量评价第59页
     ·转录组测序及De novo组装第59-61页
     ·Unigene的功能注释和分类第61-65页
       ·注释汇总及在 Nr 中的数据分析第61-62页
       ·GO功能分类第62-63页
       ·KOG分类第63-64页
       ·KEGG代谢通路分析第64-65页
   ·数字基因表达谱分析及花青苷生物合成途径相关基因筛选第65-71页
     ·数字基因表达谱测序及注释第65-66页
     ·差异基因表达分析第66-67页
     ·与花青苷生物合成相关的差异表达基因筛选第67-69页
     ·差异表达基因的qRT-PCR验证第69-71页
   ·花青苷合成转录因子基因的克隆和表达分析第71-77页
     ·花青苷合成相关MYB、bHLH和WD40转录因子基因的克隆和序列分析第71-72页
     ·氨基酸序列的同源性和系统进化分析第72-75页
     ·花青苷合成相关转录因子基因在不同组织中的表达分析第75-77页
4 讨论第77-83页
   ·甜樱桃果实发育期间花青苷积累与PAL、CHI、DFR和UFGT酶活性之间的关系第77-78页
   ·甜樱桃果实发育期间花青苷组分、可溶性糖和有机酸代谢及其之间的关系第78-79页
   ·甜樱桃果实转录组和表达谱测序及花青苷合成相关结构基因的筛选第79-81页
   ·甜樱桃花青苷合成相关转录因子的筛选、克隆及表达第81-83页
5 结论第83-84页
参考文献第84-103页
附录第103-111页
致谢第111-112页
攻读学位期间发表的论文第112页

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