| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-16页 |
| 1 引言 | 第7页 |
| 2 猪疝气的研究进展 | 第7-9页 |
| ·猪疝气的流行病学 | 第7-8页 |
| ·疝气形成的分子病理机制 | 第8页 |
| ·家畜疝气的 QTL 定位及易感基因研究 | 第8-9页 |
| 3 CNV 简介 | 第9-13页 |
| ·CNV 的概念 | 第9页 |
| ·CNV 形成的机制及分类 | 第9-10页 |
| ·CNV 的检测方法 | 第10-12页 |
| ·CNV 对基因表达及表型的影响 | 第12-13页 |
| 4 基于 CNV 的全基因组关联分析 | 第13-15页 |
| ·CNV 全基因组关联分析流程 | 第13页 |
| ·全基因组 CNV 关联分析在疾病性状研究中的作用 | 第13-15页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第15-16页 |
| 第二章 研究正文 | 第16-36页 |
| 1 前言 | 第16页 |
| 2 实验材料与方法 | 第16-22页 |
| ·实验技术路线 | 第16页 |
| ·病例诊断及样品收集 | 第16-18页 |
| ·基因组 DNA 提取和基因分型 | 第18页 |
| ·SNP 芯片信号文件数据处理 | 第18页 |
| ·全基因组 CNV 推断及质量控制 | 第18-19页 |
| ·CNV 区域（CNV Region，CNVR） | 第19页 |
| ·全基因组 CNV 关联分析 | 第19-20页 |
| ·相对定量 PCR 验证 | 第20-22页 |
| 3 结果 | 第22-32页 |
| ·商业猪种全基因组 CNV 推断及质控结果 | 第22页 |
| ·CNVR 图谱构建结果 | 第22-24页 |
| ·全基因组 CNV 关联分析结果 | 第24-26页 |
| ·相对定量 PCR 验证结果 | 第26-32页 |
| 4 讨论 | 第32-34页 |
| ·CNV 的全基因组检测 | 第32-33页 |
| ·全基因组 CNV 关联分析 | 第33页 |
| ·CNV 验证 | 第33页 |
| ·候选基因 | 第33-34页 |
| ·本研究的局限与不足 | 第34页 |
| 5 小结 | 第34-36页 |
| 参考文献 | 第36-41页 |
| 附表 | 第41-59页 |
| 致谢 | 第59页 |