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Fe-SOD酶结构特征与耐热性的关系研究

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 绪论第7-15页
   ·蛋白质耐热性的研究第7-11页
     ·嗜热酶的特性和优势第7页
     ·蛋白质热稳定性机制第7-9页
     ·蛋白质热稳定性的研究方法第9-11页
   ·Fe-SOD酶第11-13页
     ·Fe-SOD 酶概述第11页
     ·Fe-SOD 的作用第11-12页
     ·Fe-SOD 的研究进展第12-13页
   ·本文主要研究内容第13-15页
第二章 Fe-SOD 酶数据集的构建第15-25页
   ·构建Fe-SOD酶数据集所需数据库第15-17页
     ·蛋白质序列数据库 Swiss-Prot第15-16页
     ·蛋白质结构数据库 PDB第16-17页
   ·Fe-SOD酶数据集的构建第17-22页
     ·多序列比对算法第17-19页
     ·从 PDB 数据库构建 Fe-SOD 结构数据库第19-21页
     ·从 Swiss-Prot 数据库构建 Fe-SOD 序列数据集第21-22页
   ·Motif分析第22-24页
     ·Motif 分析算法第22-24页
     ·Fe-SOD 数据集的 Motif 分析第24页
   ·本章小结第24-25页
第三章 Fe-SOD 热稳定的影响因素第25-36页
   ·概述第25页
   ·Fe-SOD酶序列和结构参数分析第25-35页
     ·温度因子第25-27页
     ·空腔个数和包装密度第27-31页
     ·氢键分析第31-32页
     ·盐桥分析第32-34页
     ·溶剂接触表面积第34-35页
   ·本章小结第35-36页
第四章 Fe-SOD 酶耐热性的主成分分析法第36-46页
   ·主成分分析法第36-39页
   ·用主成分分析法找出影响 Fe-SOD 耐热性的关键因素第39-44页
     ·二级结构长度和含量第39-41页
     ·氢键和盐桥第41-43页
     ·溶剂接触表面积第43-44页
   ·本章小结第44-46页
第五章 水-蛋白相互作用与 Fe-SOD 耐热性的关系第46-56页
   ·概述第46-47页
   ·结合水数目与 Fe-SOD 耐热性的关系第47-53页
     ·基于探针球的水壳第47-48页
     ·基于距离的水化层第48-50页
     ·基于 Voronoi 算法的水的分布第50-53页
   ·氢键和氢键网络第53-55页
   ·本章小结第55-56页
第六章 主要结果与展望第56-58页
   ·主要结论第56-57页
   ·展望第57-58页
致谢第58-59页
参考文献第59-64页
附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文第64页

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