摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第一章 绪论 | 第7-15页 |
·蛋白质耐热性的研究 | 第7-11页 |
·嗜热酶的特性和优势 | 第7页 |
·蛋白质热稳定性机制 | 第7-9页 |
·蛋白质热稳定性的研究方法 | 第9-11页 |
·Fe-SOD酶 | 第11-13页 |
·Fe-SOD 酶概述 | 第11页 |
·Fe-SOD 的作用 | 第11-12页 |
·Fe-SOD 的研究进展 | 第12-13页 |
·本文主要研究内容 | 第13-15页 |
第二章 Fe-SOD 酶数据集的构建 | 第15-25页 |
·构建Fe-SOD酶数据集所需数据库 | 第15-17页 |
·蛋白质序列数据库 Swiss-Prot | 第15-16页 |
·蛋白质结构数据库 PDB | 第16-17页 |
·Fe-SOD酶数据集的构建 | 第17-22页 |
·多序列比对算法 | 第17-19页 |
·从 PDB 数据库构建 Fe-SOD 结构数据库 | 第19-21页 |
·从 Swiss-Prot 数据库构建 Fe-SOD 序列数据集 | 第21-22页 |
·Motif分析 | 第22-24页 |
·Motif 分析算法 | 第22-24页 |
·Fe-SOD 数据集的 Motif 分析 | 第24页 |
·本章小结 | 第24-25页 |
第三章 Fe-SOD 热稳定的影响因素 | 第25-36页 |
·概述 | 第25页 |
·Fe-SOD酶序列和结构参数分析 | 第25-35页 |
·温度因子 | 第25-27页 |
·空腔个数和包装密度 | 第27-31页 |
·氢键分析 | 第31-32页 |
·盐桥分析 | 第32-34页 |
·溶剂接触表面积 | 第34-35页 |
·本章小结 | 第35-36页 |
第四章 Fe-SOD 酶耐热性的主成分分析法 | 第36-46页 |
·主成分分析法 | 第36-39页 |
·用主成分分析法找出影响 Fe-SOD 耐热性的关键因素 | 第39-44页 |
·二级结构长度和含量 | 第39-41页 |
·氢键和盐桥 | 第41-43页 |
·溶剂接触表面积 | 第43-44页 |
·本章小结 | 第44-46页 |
第五章 水-蛋白相互作用与 Fe-SOD 耐热性的关系 | 第46-56页 |
·概述 | 第46-47页 |
·结合水数目与 Fe-SOD 耐热性的关系 | 第47-53页 |
·基于探针球的水壳 | 第47-48页 |
·基于距离的水化层 | 第48-50页 |
·基于 Voronoi 算法的水的分布 | 第50-53页 |
·氢键和氢键网络 | 第53-55页 |
·本章小结 | 第55-56页 |
第六章 主要结果与展望 | 第56-58页 |
·主要结论 | 第56-57页 |
·展望 | 第57-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
参考文献 | 第59-64页 |
附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第64页 |