Fe-SOD酶氨基酸网络特征与耐热性关系的研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-16页 |
| ·课题研究背景 | 第9-11页 |
| ·蛋白质耐热性研究进展 | 第9-10页 |
| ·氨基酸网络研究进展 | 第10-11页 |
| ·研究方法 | 第11-14页 |
| ·复杂网络 | 第11页 |
| ·网络属性 | 第11-12页 |
| ·网络 Hub 节点 | 第12页 |
| ·网络社团结构 | 第12-13页 |
| ·网络比对 | 第13页 |
| ·网络鲁棒性 | 第13-14页 |
| ·研究目标及意义 | 第14-16页 |
| ·铁超氧化歧化酶及其耐热性 | 第14-15页 |
| ·研究内容 | 第15-16页 |
| 第二章 Fe-SOD 氨基酸网络的构建与拓扑分析 | 第16-37页 |
| ·引言 | 第16页 |
| ·材料和方法 | 第16-22页 |
| ·Fe-SOD 数据集 | 第16-18页 |
| ·构造氨基酸网络 | 第18-19页 |
| ·确定截断半径 | 第19页 |
| ·网络参数计算方法 | 第19-21页 |
| ·氨基酸分子相互作用范围研究 | 第21页 |
| ·识别 Hub 节点 | 第21页 |
| ·Hubs 与 Fe-SOD 耐热性 | 第21-22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-35页 |
| ·确定截断半径 | 第22-24页 |
| ·网络参数 | 第24-28页 |
| ·氨基酸分子间相互作用的范围研究 | 第28-30页 |
| ·Fe-SOD 氨基酸网络的度分布 | 第30-31页 |
| ·Fe-SOD 氨基酸网络的富人俱乐部 | 第31页 |
| ·Fe-SOD 氨基酸网络中的 Hubs | 第31-33页 |
| ·Hub 残基的突变 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-37页 |
| 第三章 Fe-SOD 氨基酸网络模块化分析 | 第37-42页 |
| ·引言 | 第37页 |
| ·Fe-SOD 氨基酸网络的社团结构 | 第37-38页 |
| ·社团检测方法 | 第37页 |
| ·社团结构与二级结构 | 第37-38页 |
| ·社团结构与 Fe-SOD 热稳定性 | 第38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-41页 |
| ·模块度 | 第38-39页 |
| ·社团与二级结构 | 第39页 |
| ·二级结构检测率 | 第39-40页 |
| ·Fe-SOD 热稳定性 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 第四章 Fe-SOD 氨基酸网络的比对研究 | 第42-49页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·氨基酸网络比对 | 第42-44页 |
| ·GRAAL | 第42-43页 |
| ·MI-GRAAL | 第43页 |
| ·网络比对与 Fe-SOD 热稳定性 | 第43-44页 |
| ·结果与讨论 | 第44-48页 |
| ·GRAAL 算法比对 | 第44-45页 |
| ·MI-GRRAL 算法比对 | 第45-46页 |
| ·功能相关的子结构 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第五章 Fe-SOD 氨基酸网络的鲁棒性分析 | 第49-55页 |
| ·引言 | 第49页 |
| ·方法 | 第49-50页 |
| ·氨基酸网络鲁棒性研究 | 第49页 |
| ·识别 Fe-SOD 结构的关键残基 | 第49-50页 |
| ·鲁棒性与耐热性 | 第50页 |
| ·结果与讨论 | 第50-54页 |
| ·氨基酸网络的鲁棒性 | 第50-51页 |
| ·鲁棒性与 Fe-SOD 热稳定性 | 第51-52页 |
| ·氨基酸网络关键残基 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
| ·论文总结 | 第55-56页 |
| ·工作展望 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 附录一：氨基酸中英文对照及英文缩写 | 第63-64页 |
| 附录二：作者在研究生期间发表的论文 | 第64页 |
