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甘蔗种质资源的SSR遗传多样性分析及指纹数据库构建

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一节 前言第11-16页
 1 甘蔗的种质资源第11页
 2 甘蔗种质资源遗传多样性研究的意义第11-12页
 3 甘蔗种质资源指纹图谱构建的意义第12页
 4 分子标记分类及其应用现状第12-14页
   ·分子标记的分类第12-13页
   ·SSR标记与其他分子标记的比较第13页
   ·SSR分子标记在遗传多样性上的应用第13-14页
   ·SSR分子标记在指纹图谱构建上的应用第14页
 5 本研究的目的意义和技术路线第14-16页
   ·本研究的目的意义第14-15页
   ·本研究的技术路线第15-16页
第二节 材料与方法第16-24页
 1 试验材料第16-19页
 2 主要仪器设备和试剂第19-20页
   ·主要仪器设备第19-20页
   ·主要试剂与来源第20页
 3 试验引物第20-21页
 4 试验方法第21-24页
   ·基因组DNA提取与检测第21页
   ·PCR反应体系和程序第21页
   ·SSR核心引物筛选与确定第21-22页
   ·SSR-PCR扩增和毛细管电泳检测第22页
   ·数据收集和统计分析第22-24页
     ·遗传多样性参数计算方法第22-23页
     ·聚类分析方法第23页
     ·主成分分析方法第23-24页
第三节 结果与分析第24-55页
 1 DNA质量检测第24页
 2 SSR-PCR扩增体系及毛细管电泳结果稳定性分析第24-28页
 3 SSR扩增产物及条带分析第28-29页
 4 甘蔗种质资源的遗传多样性分析第29-49页
   ·181份甘蔗种质的遗传多样性分析第29-40页
     ·181份甘蔗种质的遗传参数分析第29-31页
       ·181份甘蔗种质在物种和群体水平的遗传多样性第30-31页
       ·181份甘蔗样品群体间的遗传变异分析第31页
     ·181份甘蔗样品遗传相似系数和遗传距离值分析第31-32页
     ·181份甘蔗样品聚类分析第32-37页
     ·181份甘蔗样品主成分分析第37-40页
   ·63个组合亲本遗传多样性分析第40-45页
     ·63个组合亲本遗传相似系数和遗传距离值分析第40-41页
     ·63个组合亲本聚类分析第41-42页
     ·63个组合亲本主成分分析第42-45页
   ·26个甘蔗区域试验品种遗传多样性分析第45-49页
     ·26个甘蔗区域试验品种遗传相似系数和遗传距离值分析第45页
     ·26个甘蔗区域试验品种聚类分析第45-46页
     ·26个甘蔗区域试验品种主成分分析第46-49页
 5 甘蔗种质资源的指纹图谱构建第49-55页
   ·甘蔗DNA指纹数据库的核心引物的筛选确定第49-50页
   ·甘蔗DNA指纹数据库数据统计及建库规范第50-51页
     ·毛细管电泳结果的原始数据统计记录方式第50页
     ·毛细管电泳结果的原始数据导入数据库的方式第50-51页
   ·甘蔗DNA指纹数据库管理系统的建立第51-55页
     ·品种查询比较功能第51页
     ·甘蔗DNA指纹数据库操作界面第51-55页
       ·甘蔗DNA指纹数据库的登录界面第51页
       ·甘蔗DNA指纹数据库的数据导入与管理第51-53页
       ·甘蔗DNA指纹数据库的品种鉴别第53-55页
第四节 讨论与结论第55-61页
 1 关于利用SSR荧光标记进行甘蔗遗传多样性分析第55-58页
   ·关于利用SSR毛细管电泳技术研究甘蔗遗传多样性的讨论第55页
   ·关于181份14个系列甘蔗样品遗传多样性参数分析的讨论第55-56页
   ·关于甘蔗种质遗传相似系数和遗传距离值的讨论第56-57页
   ·关于甘蔗种质聚类结果的讨论第57-58页
 2 关于甘蔗种质资源指纹图谱构建的讨论第58-59页
   ·关于核心引物的筛选确定及扩展引物的开发利用问题第58页
   ·不同来源指纹数据的有效整合问题第58-59页
   ·指纹数据信息表的整理第59页
   ·关于甘蔗DNA指纹数据库的材料和技术条件局限性第59页
 3 结论第59-61页
参考文献第61-66页
附录Ⅰ第66-67页
附录Ⅱ第67-68页
附录Ⅲ第68-76页
致谢第76页

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