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放线菌新抗生素生物合成基因的发掘

摘要第1-8页
Abstract第8-9页
缩略语表第9-10页
1. 前言第10-21页
   ·放线菌概述第10页
   ·放线菌基因组研究概况第10-12页
     ·天蓝链霉菌[Streptomyces coelicolor A3(2)]基因组第11页
     ·除虫链霉菌(Streptomyces avermitilis)第11-12页
   ·放线菌次生代谢的遗传特征第12-15页
     ·聚酮类次生代谢的生物合成第12-13页
     ·非核糖体多肽类的生物合成(NRPS合成途径)第13-15页
   ·新抗生素发现的策略第15-20页
     ·稀有放线菌的分离第15-17页
     ·抗菌活性筛选第17页
     ·生物技术途径对新抗生素的发掘第17-19页
     ·组合生物合成第19-20页
   ·研究目的与意义第20-21页
2. 材料与方法第21-33页
   ·试验材料与土样采集地点第21-25页
     ·菌株第21-22页
     ·质粒第22页
     ·引物第22页
     ·培养基第22-24页
     ·抗生素第24页
     ·酶和生化试剂第24页
     ·试验仪器第24-25页
   ·试验方法第25-33页
     ·土壤放线菌的分离和筛选方法第25-26页
       ·土样的采集第25页
       ·土样的预处理第25页
       ·稀有放线菌的分离第25页
       ·放线菌的纯化和保藏第25-26页
       ·活性测定第26页
     ·大肠杆菌(Escherichia coli)质粒的提取(Sambrook and Russell,2001)第26-27页
     ·大肠杆菌的转化第27-28页
       ·E.coli的Ca2+法感受态的制备及转化(Sambrook and Russell,2001)第27页
       ·E.coli电击感受态的制备(Sambrook and Russell,2001)第27-28页
       ·大肠杆菌于放线菌间的结合转移操作流程(Flett et al.,1997)第28页
     ·放线菌孢子悬液的制备第28-29页
     ·放线菌基因组DNA的小量提取(Kieser et al.,2000)第29页
     ·PCR扩增反应第29页
     ·琼脂糖凝胶电泳第29-30页
     ·DNA的体外操作第30-31页
       ·DNA的体外连接反应第30-31页
       ·基因组DNA酶切及回收第31页
     ·测序及序列分析第31页
     ·系统发育树分析第31-32页
     ·分离放线菌代谢物质的光谱谱析方法第32页
     ·扫描电镜样品的制备第32-33页
3. 结果与分析第33-60页
   ·土壤放线菌的分离及拮抗筛选第33-41页
     ·土壤放线菌的分离第33-35页
     ·土壤放线菌活性筛选结果第35-40页
     ·小结第40-41页
   ·放线菌菌株甲醇提取物的光谱谱析与基因组信息普查第41-55页
     ·放线菌菌株甲醇提取物的光谱谱析第41-43页
     ·分离放线菌基因组信息普查第43-55页
       ·放线菌基因组DNA的提取第43-44页
       ·放线菌基因组DNA的PCR检测第44-48页
       ·扩增出的PKSⅡ聚酮合成酶基因片段的序列分析第48-51页
       ·扩增出得NRPS基因片段序列分析第51-52页
       ·部分菌株的初步鉴定第52-54页
       ·小结第54-55页
   ·Ⅱ型聚酮合成基因簇的克隆第55-60页
     ·基因簇体内重组克隆策略第55-56页
     ·重组克隆基因簇的选择第56页
     ·重组质粒pWX1的构建第56-58页
     ·重组质粒pWX1接合转移导入Streptomyces sp.44第58页
     ·Streptomyces sp.44Ⅱ型聚酮合成基因簇的克隆第58-59页
     ·小结第59-60页
4. 讨论第60-61页
参考文献第61-68页
附表1.Ⅱ型PKS序列第68-69页
附表2.紫外扫描部分图谱第69-76页
致谢第76页

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