| 图表索引 | 第1-6页 |
| 英语缩略词表 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一部分 永生化上皮细胞拷贝数变异和表达数据的研究 | 第10-36页 |
| 前言 | 第10-14页 |
| 1. 肺癌及其癌前病变 | 第10页 |
| 2. 肿瘤与细胞永生化 | 第10-11页 |
| 3. 肺癌及癌前组织的基因组变化 | 第11-12页 |
| 4. 研究目的及研究策略 | 第12-14页 |
| 材料和方法 | 第14-24页 |
| 1. 细胞培养 | 第14-15页 |
| 2. 主要试剂或试剂盒 | 第15-18页 |
| 3. 细胞收集及生物大分子的提取 | 第18-19页 |
| 4. array-CGH实验流程 | 第19-21页 |
| 5. mRNA表达谱芯片实验流程 | 第21-24页 |
| 6. 数据分析 | 第24页 |
| 结果 | 第24-32页 |
| 1. DNA及RNA样本的各项质量控制 | 第24-26页 |
| 2. array-CGH检测的细胞拷贝数变异 | 第26-29页 |
| 1) 永生化上皮细胞Y-BE的拷贝数变异 | 第26-27页 |
| 2) 肺鳞癌NCI-H2170细胞的拷贝数变异 | 第27-28页 |
| 3) 三组细胞拷贝数变异的对比观察 | 第28-29页 |
| 3. 表达谱芯片检测的不同细胞系间基因表达情况 | 第29-32页 |
| 1) 表达谱差异的整体情况及GO富集结果 | 第29-31页 |
| 2) 表达谱与array-CGH结果的整合情况 | 第31-32页 |
| 讨论 | 第32-35页 |
| 1. array-CGH芯片拷贝数变异分析 | 第32-33页 |
| 1) 永生化上皮细胞Y-BE的拷贝数变异情况 | 第32-33页 |
| 2) 肺鳞癌细胞NCI-H2170的拷贝数变异情况 | 第33页 |
| 3) 拷贝数变异在三组细胞间的整体情况 | 第33页 |
| 2. 表达谱芯片结果分析 | 第33-35页 |
| 1) 永生化上皮细胞早晚代间的表达差异 | 第33-34页 |
| 2) 肿瘤细胞相对于永生化上皮细胞的表达差异 | 第34页 |
| 3) 表达谱芯片与array-CGH结果的整合情况 | 第34-35页 |
| 小结 | 第35-36页 |
| 第二部分 基因组表达谱数据与神经胶质瘤的预后分析 | 第36-56页 |
| 前言 | 第36-39页 |
| 1. 神经胶质瘤及其通用分级 | 第36页 |
| 2. 神经胶质瘤的分子特征与预后的关系 | 第36-38页 |
| 3. 研究目的及研究策略 | 第38-39页 |
| 材料和方法 | 第39-45页 |
| 1. 临床样本的收集及患者随访 | 第39-40页 |
| 2. 主要试剂或试剂盒 | 第40-41页 |
| 3. RNA的提取及保存 | 第41页 |
| 4. 利用Agilent(?)2100平台对样本RNA质量进行检测 | 第41-42页 |
| 5. 表达谱芯片实验 | 第42-44页 |
| 6. 生物信息学分析 | 第44-45页 |
| 结果 | 第45-52页 |
| 1. RNA样本的质量检验 | 第45-46页 |
| 2. 用2512个基因对样本进行聚类及主成分分析分析 | 第46-47页 |
| 3. 分子网络的获得与分析 | 第47-50页 |
| 4. 分子网络的表达特点及关键基因 | 第50-51页 |
| 5. 利用筛选基因对样本的预后重新分析 | 第51-52页 |
| 讨论 | 第52-55页 |
| 1. WHO分级对神经胶质瘤预后的作用及影响 | 第52-53页 |
| 2. 分子网络与神经胶质瘤的关系 | 第53-54页 |
| 3. 神经胶质瘤的分子分型：问题与展望 | 第54-55页 |
| 小结 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 文献综述 | 第61-68页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 致谢 | 第68-70页 |
| 个人简历 | 第70页 |
