| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 主要符号说明 | 第10-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-33页 |
| 1 前言 | 第15页 |
| 2 禽类胚胎期肌肉组织发育特点 | 第15-16页 |
| 3 禽类胚胎期主要器官发育特点 | 第16-19页 |
| ·脾脏 | 第16-17页 |
| ·法氏囊 | 第17-18页 |
| ·胸腺 | 第18页 |
| ·肝脏 | 第18-19页 |
| 4 禽类胚胎期能量代谢特点 | 第19-23页 |
| ·胚胎蛋白质代谢 | 第19-20页 |
| ·胚胎脂质代谢 | 第20-21页 |
| ·胚胎糖代谢 | 第21-23页 |
| 5 影响动物胚胎发育的外源因素 | 第23-30页 |
| ·营养 | 第23页 |
| ·运动 | 第23-24页 |
| ·孵化温度 | 第24-30页 |
| ·孵化温度与胚胎发育 | 第24-26页 |
| ·孵化温度与机体代谢 | 第26-28页 |
| ·孵化温度与胚胎免疫 | 第28-30页 |
| 6 转录组测序技术在动物发育机制研究中的应用 | 第30-31页 |
| ·转录组测序概况 | 第30页 |
| ·RNA-sEQ在动物发育机制研究中的应用 | 第30-31页 |
| 7 研究的目的意义、内容及研究思路 | 第31-33页 |
| ·研究目的意义 | 第31页 |
| ·研究内容 | 第31-32页 |
| ·研究思路 | 第32-33页 |
| 第二章 孵化温度对鸭胚胎组织器官发育的影响 | 第33-42页 |
| 1 前言 | 第33页 |
| 2 材料和方法 | 第33-34页 |
| ·孵化种蛋分组 | 第33页 |
| ·孵化温度处理 | 第33-34页 |
| ·样品采集 | 第34页 |
| ·数据统计 | 第34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-39页 |
| ·孵化效果统计 | 第34-35页 |
| ·孵化温度改变对胚重和出生后体重的影响 | 第35页 |
| ·孵化温度改变对鸭肌肉发育的影响 | 第35-37页 |
| ·孵化温度改变对心脏和肝脏发育的影响 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| ·提高孵化温度降低了鸭孵化率 | 第39-40页 |
| ·提高孵化温度抑制了鸭胚组织器官发育 | 第40页 |
| ·孵化温度对鸭胚组织器官发育的影响存在差异性 | 第40-41页 |
| ·鸭胚胎期组织器官发育状态影响了胚后早期生长发育效果 | 第41页 |
| 5 小结 | 第41-42页 |
| 第三章 孵化温度对鸭血液脂质代谢指标影响 | 第42-50页 |
| 1 前言 | 第42页 |
| 2 材料和方法 | 第42-43页 |
| ·鸭种蛋分组孵化 | 第42页 |
| ·孵化温度处理 | 第42-43页 |
| ·血样采集 | 第43页 |
| ·指标测定 | 第43页 |
| ·数据统计 | 第43页 |
| 3 结果与分析 | 第43-47页 |
| ·血糖水平变化 | 第43-44页 |
| ·甘油三脂和胆固醇水平变化 | 第44页 |
| ·载脂蛋白水平变化 | 第44-45页 |
| ·鸭胚胎期血浆参数和出壳后血浆参数的相关性分析 | 第45-47页 |
| 4 讨论 | 第47-49页 |
| ·孵化温度影响鸭胚脂质代谢和血糖水平 | 第47-48页 |
| ·禽类胚胎期脂质代谢状态对出壳后脂质代谢影响 | 第48-49页 |
| 5 小结 | 第49-50页 |
| 第四章 孵化温度对鸭免疫器官发育影响 | 第50-58页 |
| 1 前言 | 第50页 |
| 2 材料和方法 | 第50-52页 |
| ·实验设备及试剂 | 第50-51页 |
| ·种蛋分组孵化 | 第51页 |
| ·孵化温度处理 | 第51页 |
| ·血液样品的采集 | 第51页 |
| ·免疫器官重测定和免疫器官指数计算 | 第51页 |
| ·血液干扰素浓度的测定 | 第51-52页 |
| ·球蛋白浓度测定 | 第52页 |
| ·数据统计与处理 | 第52页 |
| 3 结果与分析 | 第52-54页 |
| ·免疫器官指数的变化 | 第52-53页 |
| ·血液干扰素水平变化 | 第53-54页 |
| ·血液免疫球蛋白/总蛋白比值变化 | 第54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| ·孵化期提高孵化温度抑制鸭免疫器官发育 | 第54-55页 |
| ·孵化期升高孵化温度降低鸭血液免疫因子水平 | 第55-57页 |
| 5 小结 | 第57-58页 |
| 第五章 孵化温度对鸭胚胎肌肉发育影响及其分子机制 | 第58-80页 |
| 1 前言 | 第58页 |
| 2 材料和方法 | 第58-63页 |
| ·实验材料 | 第58-59页 |
| ·实验仪器 | 第59页 |
| ·主要生物信息学工具 | 第59-60页 |
| ·实验方法 | 第60-61页 |
| ·肌肉组织石蜡切片制作和肌纤维形态分析 | 第60页 |
| ·组织总RNA的提取 | 第60页 |
| ·送样测序 | 第60-61页 |
| ·标准信息分析流程 | 第61-63页 |
| ·原始序列数据 | 第61-62页 |
| ·去除杂质数据 | 第62页 |
| ·测序质量评估 | 第62-63页 |
| ·基因表达定量及差异表达基因分析 | 第63页 |
| ·基因表达模式聚类分析 | 第63页 |
| 3 结果分析 | 第63-76页 |
| ·孵化温度改变对鸭出壳后期及出生早期肌肉组织形态和肌纤维参数的影响 | 第63-65页 |
| ·测序评估 | 第65-66页 |
| ·数据比对统计 | 第66-67页 |
| ·测序饱和度分析 | 第67页 |
| ·测序随机性分析 | 第67-68页 |
| ·基因表达量统计 | 第68页 |
| ·差异表达基因分析 | 第68-69页 |
| ·基因表达模式聚类分析 | 第69-70页 |
| ·GENE ONTOLOGY功能显著性富集分析 | 第70-72页 |
| ·KEGG PATHWAY显著性富集分析 | 第72-76页 |
| 4 讨论 | 第76-79页 |
| ·提高孵化温度促进鸭胚出壳前后肌纤维肥大和增生 | 第76页 |
| ·孵化温度改变降低了基因表达水平 | 第76-77页 |
| ·孵化温度改变了肌肉细胞参与的生物过程 | 第77-78页 |
| ·孵化温度改变引起核糖体代谢和MAPK通路的变化 | 第78-79页 |
| 5 小结 | 第79-80页 |
| 第六章 总结 | 第80-81页 |
| 1 本研究的主要结论 | 第80页 |
| 2 本研究创新之处 | 第80页 |
| 3 本研究后续工作 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 附录：差异表达基因分析表 | 第89-94页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第94页 |