摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-10页 |
文献综述 | 第10-18页 |
·转座子的分类 | 第10-11页 |
·PIF 类转座子 | 第11-13页 |
·PIF 转座子的结构和特点 | 第11-12页 |
·PIF 转座子分布与进化 | 第12-13页 |
·Mariner-like 转座子 | 第13-15页 |
·MLE 转座子的结构和特点 | 第13-14页 |
·MLE 转座子的分布以及进化 | 第14-15页 |
·转座子活性对植物表型的影响 | 第15页 |
·研究的目的和意义 | 第15-18页 |
第一章 毛竹 PIF 类转座子的克隆与结构分析 | 第18-33页 |
1 材料 | 第18-20页 |
·实验材料 | 第18页 |
·菌株与载体 | 第18页 |
·实验用酶 | 第18页 |
·实验所用试剂盒 | 第18页 |
·仪器与设备 | 第18-19页 |
·试剂配置 | 第19-20页 |
·引物与接头 | 第20页 |
2 实验方法 | 第20-26页 |
·毛竹基因组步行文库的构建 | 第20-22页 |
·毛竹 DNA 提取 | 第20-21页 |
·基因组 DNA 酶切 | 第21页 |
·纯化酶切产物 | 第21-22页 |
·酶切产物加接头 | 第22页 |
·通过基于磁珠富集的染色体步移法延伸所扩增片段 PhPIFa | 第22-26页 |
·第一次 PCR | 第22-23页 |
·第一次 PCR 产物回收 | 第23页 |
·第二次 PCR | 第23-24页 |
·第二次 PCR 产物纯化及克隆 | 第24-25页 |
·测序分析 | 第25页 |
·扩增片段的拼接、全长 PIF 类转座子的结构分析 | 第25-26页 |
3 结果与分析 | 第26-33页 |
·步行文库构建 | 第26页 |
·PhPIFa 的延伸 | 第26-27页 |
·测序结果与序列分析 | 第27-33页 |
·全长 PIF 类转座子的序列与结构分析 | 第27-28页 |
·PhPIF-1 与玉米、水稻和拟南芥 PIF 类转座子的 ORF 比对 | 第28-31页 |
·PhPIF-1 进化分析 | 第31-33页 |
第二章 MLE 转座子对毛竹基因组多态性的影响 | 第33-50页 |
1 材料 | 第33-35页 |
·实验材料 | 第33页 |
·菌株与载体 | 第33页 |
·各种酶类 | 第33-34页 |
·试剂盒 | 第34页 |
·主要仪器与设备 | 第34页 |
·主要试剂 | 第34页 |
·接头与引物 | 第34-35页 |
·接头序列 | 第34页 |
·接头引物和转座子特异引物 | 第34-35页 |
2 实验方法 | 第35-40页 |
·毛竹及其变种 DNA 的提取 | 第35页 |
·酶切基因组 DNA | 第35-36页 |
·酶切产物纯化 | 第36页 |
·接头制备 | 第36页 |
·连接反应 | 第36-37页 |
·连接产物纯化 | 第37页 |
·预扩增 | 第37页 |
·选择性扩增 | 第37-38页 |
·扩增产物的检测 | 第38-40页 |
·水平电泳检测 | 第38页 |
·聚丙烯酰胺凝胶检测 | 第38-40页 |
·多态性条带回收测序 | 第40页 |
3 结果与分析 | 第40-50页 |
·实验材料 DNA 提取 | 第40-41页 |
·基因组酶切 | 第41-42页 |
·预扩增反应 | 第42页 |
·不同引物组合对 PCR 扩增的影响 | 第42-43页 |
·多态性位点检测 | 第43-45页 |
·数据统计与分析 | 第45-48页 |
·差异片段的克隆和序列分析 | 第48-50页 |
结论与讨论 | 第50-52页 |
利用磁珠富集技术做基因组步移,可有效获扩增长片段序列 | 第50页 |
垂直失活可能是 PhPIF-1 转座子转座酶变异原因之一 | 第50页 |
MLE 转座子插入多态性与毛竹形态变异的关系 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-55页 |
个人简介 | 第55页 |
在校期间发表论文情况 | 第55-56页 |
致谢 | 第56页 |