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毛竹PIF类转座子的克隆与结构分析以及MLE转座子对毛竹基因组多态性的影响

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
文献综述第10-18页
   ·转座子的分类第10-11页
   ·PIF 类转座子第11-13页
     ·PIF 转座子的结构和特点第11-12页
     ·PIF 转座子分布与进化第12-13页
   ·Mariner-like 转座子第13-15页
     ·MLE 转座子的结构和特点第13-14页
     ·MLE 转座子的分布以及进化第14-15页
   ·转座子活性对植物表型的影响第15页
   ·研究的目的和意义第15-18页
第一章 毛竹 PIF 类转座子的克隆与结构分析第18-33页
 1 材料第18-20页
   ·实验材料第18页
   ·菌株与载体第18页
   ·实验用酶第18页
   ·实验所用试剂盒第18页
   ·仪器与设备第18-19页
   ·试剂配置第19-20页
   ·引物与接头第20页
 2 实验方法第20-26页
   ·毛竹基因组步行文库的构建第20-22页
     ·毛竹 DNA 提取第20-21页
     ·基因组 DNA 酶切第21页
     ·纯化酶切产物第21-22页
     ·酶切产物加接头第22页
   ·通过基于磁珠富集的染色体步移法延伸所扩增片段 PhPIFa第22-26页
     ·第一次 PCR第22-23页
     ·第一次 PCR 产物回收第23页
     ·第二次 PCR第23-24页
     ·第二次 PCR 产物纯化及克隆第24-25页
     ·测序分析第25页
     ·扩增片段的拼接、全长 PIF 类转座子的结构分析第25-26页
 3 结果与分析第26-33页
   ·步行文库构建第26页
   ·PhPIFa 的延伸第26-27页
   ·测序结果与序列分析第27-33页
     ·全长 PIF 类转座子的序列与结构分析第27-28页
     ·PhPIF-1 与玉米、水稻和拟南芥 PIF 类转座子的 ORF 比对第28-31页
     ·PhPIF-1 进化分析第31-33页
第二章 MLE 转座子对毛竹基因组多态性的影响第33-50页
 1 材料第33-35页
   ·实验材料第33页
   ·菌株与载体第33页
   ·各种酶类第33-34页
   ·试剂盒第34页
   ·主要仪器与设备第34页
   ·主要试剂第34页
   ·接头与引物第34-35页
     ·接头序列第34页
     ·接头引物和转座子特异引物第34-35页
 2 实验方法第35-40页
   ·毛竹及其变种 DNA 的提取第35页
   ·酶切基因组 DNA第35-36页
   ·酶切产物纯化第36页
   ·接头制备第36页
   ·连接反应第36-37页
   ·连接产物纯化第37页
   ·预扩增第37页
   ·选择性扩增第37-38页
   ·扩增产物的检测第38-40页
     ·水平电泳检测第38页
     ·聚丙烯酰胺凝胶检测第38-40页
   ·多态性条带回收测序第40页
 3 结果与分析第40-50页
   ·实验材料 DNA 提取第40-41页
   ·基因组酶切第41-42页
   ·预扩增反应第42页
   ·不同引物组合对 PCR 扩增的影响第42-43页
   ·多态性位点检测第43-45页
   ·数据统计与分析第45-48页
   ·差异片段的克隆和序列分析第48-50页
结论与讨论第50-52页
 利用磁珠富集技术做基因组步移,可有效获扩增长片段序列第50页
 垂直失活可能是 PhPIF-1 转座子转座酶变异原因之一第50页
 MLE 转座子插入多态性与毛竹形态变异的关系第50-52页
参考文献第52-55页
个人简介第55页
在校期间发表论文情况第55-56页
致谢第56页

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