朊蛋白和去甲酰化酶结构与性质的X射线谱学研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-16页 |
| ·研究背景 | 第12-13页 |
| ·研究方法 | 第13-14页 |
| ·内容安排 | 第14-16页 |
| 第二章 X射线吸收谱理论及实验 | 第16-50页 |
| ·X射线吸收谱简介 | 第16-20页 |
| ·X射线吸收谱理论 | 第20-31页 |
| ·EXAFS唯像理论 | 第20-23页 |
| ·多重散射理论 | 第23-31页 |
| ·XAS实验方法 | 第31-36页 |
| ·透射法 | 第32-34页 |
| ·荧光法 | 第34-36页 |
| ·同步辐射装置 | 第36-39页 |
| ·北京同步辐射装置吸收谱站 | 第36-38页 |
| ·上海同步辐射装置吸收谱站 | 第38-39页 |
| ·数据处理与常用软件 | 第39-48页 |
| ·EXAFS数据处理和常用软件 | 第39-42页 |
| ·XANES数据处理 | 第42-43页 |
| ·MXAN简介 | 第43-48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 第三章 金属蛋白简介 | 第50-80页 |
| ·蛋白质 | 第50-52页 |
| ·金属蛋白 | 第52-65页 |
| ·金属离子和金属离子配体 | 第52-55页 |
| ·几种典型的金属蛋白 | 第55-65页 |
| ·含铜的金属蛋白 | 第65-73页 |
| ·铜在生物体中的作用 | 第65-66页 |
| ·含铜的金属蛋白举例 | 第66-73页 |
| ·蛋白结构的研究方法 | 第73-75页 |
| ·物理方法 | 第73-74页 |
| ·XAS的背景和优势 | 第74-75页 |
| ·BioXAS的形成和发展 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-80页 |
| 第四章 兔朊蛋白铜离子结合位点结构研究 | 第80-108页 |
| ·朊蛋白背景介绍 | 第80-85页 |
| ·朊蛋白简介 | 第80-83页 |
| ·朊蛋白的铜结合位点 | 第83-85页 |
| ·蛋白制备和实验 | 第85-91页 |
| ·蛋白制备 | 第85-87页 |
| ·等温滴定量热法实验 | 第87-90页 |
| ·XAS实验 | 第90-91页 |
| ·XAS数据分析与拟合 | 第91-104页 |
| ·EXAFS定性分析 | 第91-92页 |
| ·初始结构模型获取 | 第92-95页 |
| ·非结构参数优化 | 第95-99页 |
| ·结构参数拟合 | 第99-103页 |
| ·EXAFS拟合验证 | 第103-104页 |
| ·结果与讨论 | 第104-105页 |
| ·总结 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-108页 |
| 第五章 人朊蛋白与兔朊蛋白铜结合位点比较 | 第108-130页 |
| ·人朊蛋白研究背景 | 第108-111页 |
| ·蛋白制备和实验 | 第111-117页 |
| ·人朊蛋白与兔朊蛋白的序列比对 | 第111-112页 |
| ·人朊蛋白制备 | 第112-113页 |
| ·动态光散射实验 | 第113-115页 |
| ·等温滴定量热实验 | 第115-116页 |
| ·XAS实验 | 第116-117页 |
| ·MXAN拟合 | 第117-125页 |
| ·初始结构模型构建 | 第117-120页 |
| ·cluster大小的选择 | 第120-121页 |
| ·MXAN拟合 | 第121-125页 |
| ·人与兔朊蛋白C端铜结合位点结构对比 | 第125-127页 |
| ·总结 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-130页 |
| 第六章 去甲酰化酶结构与活性的关系 | 第130-155页 |
| ·去甲酰化酶背景介绍 | 第130-135页 |
| ·去甲酰化酶简介 | 第130-133页 |
| ·去甲酰化酶pH和金属离子依赖性 | 第133-135页 |
| ·蛋白制备和X射线吸收谱实验 | 第135-138页 |
| ·蛋白制备 | 第135-136页 |
| ·XAS实验 | 第136-138页 |
| ·XAS数据分析与拟合 | 第138-151页 |
| ·XAFS定性分析 | 第138-141页 |
| ·初始结构模型获取 | 第141-147页 |
| ·非结构参数优化 | 第147-148页 |
| ·结构参数拟合 | 第148-151页 |
| ·结果与讨论 | 第151-152页 |
| ·总结 | 第152-153页 |
| 参考文献 | 第153-155页 |
| 第七章 总结 | 第155-156页 |
| 致谢 | 第156-158页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其它研究成果 | 第158页 |
