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嗜热真菌糖苷酶的基因克隆、表达与分子改造

中文摘要第1-14页
Abstract第14-16页
第一章 文献综述第16-59页
 1. 糖苷酶的研究进展第16-35页
   ·β-葡萄糖苷酶的研究进展第16-26页
     ·产β-葡萄糖苷酶的微生物第17页
     ·β-葡萄糖苷酶的分类第17-18页
     ·β-葡萄糖苷酶的性质第18页
     ·β-葡萄糖苷酶的结构与功能研究第18-19页
     ·β-葡萄糖苷酶的催化机理第19-20页
     ·β-葡萄糖苷酶的分离纯化第20-21页
     ·β-葡萄糖苷酶基因的克隆和表达第21-25页
     ·β-葡萄糖苷酶的应用第25-26页
   ·糖化酶的研究进展第26-35页
     ·糖化酶的性质第27-28页
     ·糖化酶的分离纯化第28-29页
     ·糖化酶的结构第29-31页
     ·糖化酶的作用机制第31-32页
     ·糖化酶的克隆与表达第32-35页
     ·糖化酶的应用第35页
 2. 酶的分子改造第35-50页
   ·酶分子改造的研究方法第36-41页
     ·酶的化学修饰第36页
     ·酶的定点突变第36-38页
     ·酶的定向进化第38-41页
   ·分子改造的筛选策略第41-44页
     ·突变体分离第41-43页
     ·酶检测第43页
     ·信号探测第43-44页
   ·分子改造技术的应用第44-46页
     ·提高酶的催化活性第44页
     ·提高稳定性第44页
     ·提高底物特异性第44-45页
     ·改变对映异构体特异性第45-46页
   ·酶的定向进化的展望第46-47页
   ·纤维素酶的分子改造第47-50页
     ·纤维素酶的定点突变第47-49页
     ·纤维素酶的定向进化第49-50页
 3. 糖苷合成酶的研究进展第50-55页
   ·糖苷合成酶的研究背景第50-51页
   ·糖苷合成酶及其作用机制第51-53页
   ·糖苷合成酶的发展情况第53-55页
 4. 选题的目的意义、研究内容、技术路线第55-59页
   ·选题的目的意义第55-56页
   ·研究内容第56-57页
   ·技术路线第57-59页
第二章 嗜热真菌糖苷酶基因的克隆及在毕赤酵母中的表达第59-124页
 第一节 嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶基因的克隆及在毕赤酵母中的表达第59-104页
  1 材料与方法第60-79页
   ·实验材料第60-62页
     ·供试菌株第60页
     ·菌株与质粒第60页
     ·酶和生化试剂第60页
     ·主要仪器第60页
     ·培养基及有关溶剂的配制第60-62页
   ·嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶基因的克隆及序列分析第62-71页
     ·引物设计第62-64页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第64-65页
     ·紫外检测RNA 产率和纯度第65页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第65页
     ·目的基因cDNA 中间片段的分离第65-66页
     ·重组质粒的筛选与鉴定第66页
     ·序列测定第66-67页
     ·目的基因5’末端的分离(5’-RACE)第67-70页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第70页
     ·嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶基因组DNA 的克隆第70-71页
     ·全长序列的生物信息学分析第71页
   ·嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶在毕赤酵母中的高效表达第71-79页
     ·β-葡萄糖苷酶BGL 成熟肽基因序列的分离第71-72页
     ·酵母表达载体的构建第72页
     ·线性化质粒DNA 制备第72-73页
     ·酵母转化第73-74页
     ·酵母转化子的鉴定和筛选第74-76页
     ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第76页
     ·酵母工程菌的培养和β-葡萄糖苷酶的诱导分泌表达第76-77页
     ·表达产物的生物学活性检测及表达产物的SDS-PAGE 分析第77页
     ·β-葡萄糖苷酶工程菌表达产物的纯化及酶学性质第77-79页
     ·表达β-葡萄糖苷酶的活性染色和糖染色第79页
  2 结果与分析第79-101页
   ·C.thermophilum CT2 β-葡萄糖苷酶bgl 基因的克隆及序列分析第79-83页
     ·C.thermophilum CT2 总RNA 的提取第79-80页
     ·β-葡萄糖苷酶bgl 中间片段的分离第80-81页
     ·C.thermophilum CT2 β-葡萄糖苷酶基因cDNA 5’-末端的分离第81页
     ·C.thermophilum CT2 bgl 全长cDNA 的分离及扩增片段的序列拼接第81-82页
     ·C.thermophilum CT2 β-葡萄糖苷酶基因组DNA 的扩增第82-83页
   ·β-葡萄糖苷酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第83-92页
     ·β-葡萄糖苷酶基因bgl 的核苷酸序列分析第86-87页
     ·β-葡萄糖苷酶的氨基酸序列分析第87-91页
     ·β-葡萄糖苷酶的氨基酸组成第91-92页
   ·嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶在毕赤酵母中的高效表达第92-101页
     ·β-葡萄糖苷酶成熟肽基因序列的分离第92-93页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第93-94页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/bgl 转化P.pastoris G5115 及酵母转化子的筛选第94-96页
     ·嗜热毛壳菌bgl 基因在P.pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第96-98页
     ·表达β-葡萄糖苷酶的酶学性质研究第98-100页
     ·表达β-葡萄糖苷酶的活性染色和糖染色第100-101页
  3 讨论第101-104页
 第二节 疏绵状嗜热丝孢菌糖化酶基因的克隆及在毕赤酵母中的表达第104-124页
  1. 材料和方法第104-109页
   ·材料第104-105页
   ·疏绵状嗜热丝孢菌糖化酶基因的克隆及序列分析第105页
     ·引物设计第105页
     ·总RNA 的提取(Trizol 法)第105页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第105页
     ·疏绵状嗜热丝孢菌糖化酶基因全长cDNA 的分离第105页
     ·全长序列的生物信息学分析第105页
   ·疏绵状嗜热丝孢菌糖化酶在毕赤酵母中的高效表达第105-109页
     ·糖化酶GLA 成熟肽基因序列的分离第105-106页
     ·酵母表达载体的构建第106页
     ·线性化质粒DNA 制备第106-107页
     ·酵母转化第107页
     ·酵母转化子的鉴定和筛选第107-108页
     ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第108页
     ·酵母工程菌的培养和糖化酶的诱导分泌表达第108页
     ·表达产物的生物学活性检测及表达产物的SDS-PAGE 分析第108页
     ·糖化酶工程菌表达产物的纯化及酶学性质第108-109页
  2 结果与分析第109-123页
   ·T.lanuginosus 糖化酶gla 基因的克隆及序列分析第109-115页
     ·T.lanuginosus 总RNA 的提取第109-110页
     ·T.lanuginosus 糖化酶基因cDNA 的分离第110-111页
     ·T.lanuginosus 糖化酶基因gla 的核苷酸和氨基酸序列分析第111-115页
   ·疏绵状嗜热丝孢菌糖化酶在毕赤酵母中的高效表达第115-123页
     ·糖化酶gla 基因成熟肽的克隆第115页
     ·糖化酶基因gla 在毕赤酵母中的表达第115-117页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/gla 转化G5115 及酵母转化子的筛选第117-120页
     ·表达糖化酶的纯化及酶学性质研究第120-123页
  3 讨论第123-124页
第三章 嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶的分子改造第124-156页
 第一节 嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶非保守氨基酸的定点突变第124-134页
  1 材料和方法第124-126页
   ·材料第124-125页
   ·试验方法第125-126页
     ·PCR 引物设计第125页
     ·PCR 扩增第125-126页
     ·酵母表达载体的构建第126页
     ·突变基因在毕赤酵母中的表达第126页
  2 结果与分析第126-132页
   ·C.thermophilum β-葡萄糖苷酶基因突变子的扩增第126-127页
   ·突变子表达载体的构建第127-128页
   ·重组突变子表达质粒转化P.pastoris G5115 及酵母转化子的筛选第128-129页
   ·C.thermophilum bgl 基因突变子在P.pastoris 中的高效表达及表达产物的纯化第129页
   ·突变子工程菌株β-葡萄糖苷酶BGL 的纯化第129-130页
   ·突变工程菌株β-葡萄糖苷酶的酶学性质研究第130-132页
     ·突变酶的最适反应温度第130-131页
     ·突变酶的最适pH 值第131-132页
     ·突变酶的热稳定性第132页
  3 讨论第132-134页
 第二节 嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶保守氨基酸的定点突变和糖苷合成酶的初步研究第134-140页
  1 材料和方法第135页
   ·材料第135页
   ·试验方法第135页
     ·突变PCR 产物的扩增第135页
     ·突变β-葡萄糖苷酶工程菌的活性检测第135页
  2 结果与讨论第135-138页
   ·糖苷合成酶点突变碱基的选择第135-136页
   ·突变基因的PCR 扩增第136页
   ·突变子表达载体的构建第136-137页
   ·重组突变子表达质粒转化G5115 及酵母转化子的筛选第137页
   ·突变β-葡萄糖苷酶表达产物的纯化第137-138页
   ·表达产物的活性检测第138页
     ·突变酶的糖苷水解酶活性测定第138页
     ·突变酶的糖苷合成酶活性测定第138页
  3 讨论第138-140页
 第三节 嗜热毛壳菌β-葡萄糖苷酶的定向进化第140-156页
  1 材料和方法第140-143页
   ·材料第140-141页
   ·试验方法第141-143页
     ·突变基因的克隆第141-142页
     ·突变体库的构建和酵母转化第142页
     ·突变体库的筛选第142页
     ·突变β-葡萄糖苷酶工程菌表达产物的纯化及酶学性质第142页
     ·突变基因序列测定第142-143页
  2 结果与分析第143-153页
   ·易错PCR 突变库的建立和筛选结果第143-144页
   ·正向突变基因的筛选第144-145页
     ·平板荧光初筛第144页
     ·小量三角瓶发酵法复筛第144页
     ·酶活力测定第144-145页
     ·突变子酵母工程菌产酶分析第145页
   ·突变子蛋白的纯化第145-146页
   ·表达突变β-葡萄糖苷酶的一般性质第146-148页
     ·表达突变β-葡萄糖苷酶的最适温度第146-147页
     ·表达突变β-葡萄糖苷酶的最适pH第147页
     ·表达突变β-葡萄糖苷酶的热稳定性第147-148页
   ·突变菌株BE58 和BE857 的序列测定第148-153页
  3 讨论第153-156页
第四章 结论与建议第156-159页
 1. 结论第156-158页
 2. 建议第158-159页
参考文献第159-182页
致谢第182-183页
攻读学位期间发表论文情况第183页

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