| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-20页 |
| ·论文的研究背景 | 第11-14页 |
| ·基于基因表达谱的疾病网络构建 | 第12-13页 |
| ·基于网络扰动动力学的靶标辨识 | 第13页 |
| ·基于药物-靶标网络的已知药物重定位 | 第13-14页 |
| ·论文的组织结构 | 第14-16页 |
| 参考文献 | 第16-20页 |
| 第二章 疾病网络的构建与靶标分析 | 第20-39页 |
| ·数据集 | 第21页 |
| ·辐射损伤的表达谱 | 第21页 |
| ·辐射差异基因数据 | 第21页 |
| ·EV71 感染表达谱 | 第21页 |
| ·人蛋白相互作用网络数据 | 第21页 |
| ·基于表达谱的关键网络构建 | 第21-25页 |
| ·基因网络表达差异性的衡量指标 | 第22-23页 |
| ·基因网络表达相关性的衡量指标 | 第23-24页 |
| ·基于基因表达差异性和相关性的关键网络构建 | 第24-25页 |
| ·疾病网络的构建与靶标分析 | 第25-34页 |
| ·辐射损伤网络的构建与靶标分析 | 第26-31页 |
| ·EV71 感染网络的构建与靶标分析 | 第31-34页 |
| ·讨论 | 第34-36页 |
| 参考文献 | 第36-39页 |
| 第三章 基于网络扰动动力学的靶标分析 | 第39-63页 |
| ·数据集 | 第40页 |
| ·蛋白质定量数据 | 第40页 |
| ·人类蛋白质相互作用数据 | 第40页 |
| ·药物靶标数据库数据 | 第40页 |
| ·基于网络扰动动力学模型的软件平台PerturbationAnalyzer | 第40-49页 |
| ·扰动动力学模型 | 第41-42页 |
| ·扰动动力学分析平台的建立 | 第42-45页 |
| ·扰动动力学分析工具的应用示例 | 第45-49页 |
| ·髓母细胞瘤的靶标分析 | 第49-59页 |
| ·定量髓母瘤蛋白相互作用网络的构建 | 第50-51页 |
| ·髓母细胞瘤网络扰动分析 | 第51-56页 |
| ·药物靶标关联分析 | 第56-59页 |
| ·讨论 | 第59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 第四章 基于病毒-宿主网络的已知药物抗病毒策略分析 | 第63-91页 |
| ·数据集 | 第64-65页 |
| ·病毒宿主相互作用数据 | 第64页 |
| ·药物靶标数据 | 第64-65页 |
| ·人的关键宿主因子 | 第65页 |
| ·疾病基因关联数据 | 第65页 |
| ·人类蛋白质相互作用数据 | 第65页 |
| ·病毒宿主网络构建与分析 | 第65-71页 |
| ·药物靶标网络构建与分析 | 第71-75页 |
| ·已知药物的抗病毒策略分析 | 第75-85页 |
| ·药物靶标对病毒靶标的覆盖 | 第75-77页 |
| ·药物病毒相互作用网络构建 | 第77-79页 |
| ·疾病基因、关键宿主因子、病毒靶标与药物靶标之间的关系 | 第79-80页 |
| ·靶标的拓扑性质分析 | 第80-85页 |
| ·讨论 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-91页 |
| 第五章 结束语 | 第91-95页 |
| ·全文总结 | 第91-92页 |
| ·研究课题展望 | 第92-95页 |
| 综述 | 第95-102页 |
| 参考文献 | 第99-102页 |
| 个人简历 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103页 |
