中文摘要 | 第1-11页 |
英文摘要 | 第11-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-29页 |
1 MHC基因的简介 | 第13-14页 |
·MHC基因的概念 | 第13页 |
·MHC的结构组成 | 第13-14页 |
2 猪SLA基因的结构和研究进展 | 第14-24页 |
·SLAⅡ类基因的研究进展 | 第14-16页 |
·SLAⅡ类基因的多态性研究 | 第16-20页 |
·β链基因 | 第17-19页 |
·α链基因 | 第19-20页 |
·SLAⅡ类基因的分型方法 | 第20-24页 |
·血清学分型 | 第20页 |
·细胞学分型 | 第20页 |
·DNA分型 | 第20-24页 |
3 SLAⅡ类基因的命名 | 第24-28页 |
·SLAⅡ类座位的命名 | 第24-25页 |
·SLAⅡ类等位基因的命名 | 第25-27页 |
·SLAⅡ类等位基因组的命名 | 第25-26页 |
·SLAⅡ类等位基因的命名 | 第26页 |
·命名SLAⅡ类新等位基因的序列要求 | 第26-27页 |
·临时等位基因的命名 | 第27页 |
·SLA单倍型的命名 | 第27页 |
·SLA碱基和密码子的命名 | 第27-28页 |
4 实验目的和意义 | 第28-29页 |
·研究目的和意义 | 第28页 |
·研究内容 | 第28-29页 |
第二章 SLA-DQe基因第二外显子的群体遗传结构分析 | 第29-58页 |
1 试验材料和仪器 | 第29页 |
·试验材料 | 第29页 |
·载体和菌株 | 第29页 |
·主要试剂和酶 | 第29页 |
·主要仪器设备 | 第29页 |
2 试验方法 | 第29-34页 |
·DNA提取 | 第29-30页 |
·SLA-DQB基因第二外显子扩增 | 第30-31页 |
·引物设计及分析 | 第30页 |
·PCR体系优化 | 第30-31页 |
·SLA-DQB基因第二外显子的PCR-RFLP分型 | 第31-32页 |
·酶切 | 第31页 |
·PAGE电泳检验酶切结果 | 第31-32页 |
·克隆测序 | 第32-34页 |
·PCR产物的回收纯化 | 第32页 |
·克隆 | 第32-34页 |
·检测 | 第34页 |
·DNA抽提效果检测 | 第34页 |
·PCR产物检测 | 第34页 |
·酶切产物检测 | 第34页 |
3 数据处理 | 第34-36页 |
·基本处理 | 第34页 |
·遗传参数分析 | 第34-35页 |
·遗传多态性分析 | 第35-36页 |
4 结果与分析 | 第36-52页 |
·SLA-DQB基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析 | 第36-46页 |
·PCR扩增结果 | 第36页 |
·SLA-DQB基因的RsaI和HinfI酶切多态性分析 | 第36-37页 |
·基因及基因型频率的分布 | 第37-46页 |
·SLA-DQB基因部分序列的测序结果 | 第46-52页 |
·六品种小型猪SLA-DQB基因外显子2序列的碱基组成 | 第46页 |
·六品种小型猪SLA-DQB基因外显子2序列的多态位点变异 | 第46-47页 |
·SLA-DQB基因的基因多样性分析 | 第47-49页 |
·氨基酸序列变异的分析 | 第49-51页 |
·SLA-DQB基因的分子系统发育分析 | 第51-52页 |
5 讨论 | 第52-57页 |
·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子RsaI-RFLP多态性 | 第52-53页 |
·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子HinfI-RFLP多态性 | 第53-54页 |
·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子双酶切多态性 | 第54-55页 |
·SLA-DQB基因RFLP遗传多态分析 | 第55-56页 |
·六品种小型猪SLA-DQB外显子序列分析 | 第56页 |
·SLA-DQB基因的单倍型多样度分析 | 第56-57页 |
6 结论 | 第57-58页 |
第三章 SLA-DRB基因第二外显子的群体遗传结构分析 | 第58-75页 |
1 试验材料和仪器 | 第58页 |
·试验材料 | 第58页 |
·载体和菌株 | 第58页 |
·主要试剂和酶 | 第58页 |
·主要仪器设备 | 第58页 |
2 实验方法 | 第58-59页 |
·DNA的提取 | 第58页 |
·SLA-DRB基因第二外显子扩增 | 第58页 |
·引物设计及分析 | 第58页 |
·PCR体系优化 | 第58页 |
·SLA-DRB基因第二外显子的PCR-RFLP分型 | 第58-59页 |
·酶切 | 第59页 |
·PAGE电泳检验酶切结果 | 第59页 |
3 数据处理 | 第59页 |
4 实验结果与分析 | 第59-62页 |
·猪基因组DNA | 第59页 |
·PCR扩增结果 | 第59页 |
·SLA-DRB基因RsaI及MspI酶切多态性分析 | 第59-60页 |
·基因及基因型频率的分布 | 第60-62页 |
·各品种内基因型频率与基因频率的分布 | 第60-61页 |
·各品种内双酶切基因型频率的分布 | 第61页 |
·各品种内不同基因型分布的Hardy—Weinberg平衡检验 | 第61-62页 |
·各品种小型猪SLA-DRB基因的遗传特性分析 | 第62页 |
5 SLA-DRB基因部分序列的测序结果 | 第62-71页 |
·三品种小型猪SLA-DRB基因外显子2序列的碱基组成 | 第62-66页 |
·三品种小型猪SLA-DRB基因外显子2序列的多态位点变异 | 第66-67页 |
·序列多态位点信息表现 | 第66-67页 |
·核苷酸变异类型 | 第67页 |
·SLA-DRB基因外显子2的基因多样性分析 | 第67-68页 |
·氨基酸序列变异的分析 | 第68-70页 |
·氨基酸的组成含量分析 | 第68-69页 |
·氨基酸位点的变异分析 | 第69页 |
·SLA-DRB基因外显子2密码子使用偏倚性(Bias) | 第69-70页 |
·SLA-DRB基因的分子系统发育分析 | 第70-71页 |
6 讨论 | 第71-73页 |
·三品种小型猪SLA-DRB基因的第二外显子PCR-RFLP多态性 | 第71页 |
·三品种小型猪SLA-DRB基因的第二外显子双酶切多态性 | 第71-72页 |
·三品种小型猪的遗传特性分析 | 第72页 |
·SLA-DQB和SLA-DRB基因第二外显子的多态性比较 | 第72-73页 |
·SLA-DQB基因和SLA-DRB基因的序列比较 | 第73页 |
7 结论 | 第73-75页 |
参考文献 | 第75-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
简历 | 第81页 |