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六品种小型猪SLA-DQB、DRB基因外显子2的群体分子遗传结构分析

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-13页
第一章 文献综述第13-29页
 1 MHC基因的简介第13-14页
   ·MHC基因的概念第13页
   ·MHC的结构组成第13-14页
 2 猪SLA基因的结构和研究进展第14-24页
   ·SLAⅡ类基因的研究进展第14-16页
   ·SLAⅡ类基因的多态性研究第16-20页
     ·β链基因第17-19页
     ·α链基因第19-20页
   ·SLAⅡ类基因的分型方法第20-24页
     ·血清学分型第20页
     ·细胞学分型第20页
     ·DNA分型第20-24页
 3 SLAⅡ类基因的命名第24-28页
   ·SLAⅡ类座位的命名第24-25页
   ·SLAⅡ类等位基因的命名第25-27页
     ·SLAⅡ类等位基因组的命名第25-26页
     ·SLAⅡ类等位基因的命名第26页
     ·命名SLAⅡ类新等位基因的序列要求第26-27页
     ·临时等位基因的命名第27页
   ·SLA单倍型的命名第27页
   ·SLA碱基和密码子的命名第27-28页
 4 实验目的和意义第28-29页
   ·研究目的和意义第28页
   ·研究内容第28-29页
第二章 SLA-DQe基因第二外显子的群体遗传结构分析第29-58页
 1 试验材料和仪器第29页
   ·试验材料第29页
   ·载体和菌株第29页
   ·主要试剂和酶第29页
   ·主要仪器设备第29页
 2 试验方法第29-34页
   ·DNA提取第29-30页
   ·SLA-DQB基因第二外显子扩增第30-31页
     ·引物设计及分析第30页
     ·PCR体系优化第30-31页
   ·SLA-DQB基因第二外显子的PCR-RFLP分型第31-32页
     ·酶切第31页
     ·PAGE电泳检验酶切结果第31-32页
   ·克隆测序第32-34页
     ·PCR产物的回收纯化第32页
     ·克隆第32-34页
   ·检测第34页
     ·DNA抽提效果检测第34页
     ·PCR产物检测第34页
     ·酶切产物检测第34页
 3 数据处理第34-36页
   ·基本处理第34页
   ·遗传参数分析第34-35页
   ·遗传多态性分析第35-36页
 4 结果与分析第36-52页
   ·SLA-DQB基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析第36-46页
     ·PCR扩增结果第36页
     ·SLA-DQB基因的RsaI和HinfI酶切多态性分析第36-37页
     ·基因及基因型频率的分布第37-46页
   ·SLA-DQB基因部分序列的测序结果第46-52页
     ·六品种小型猪SLA-DQB基因外显子2序列的碱基组成第46页
     ·六品种小型猪SLA-DQB基因外显子2序列的多态位点变异第46-47页
     ·SLA-DQB基因的基因多样性分析第47-49页
     ·氨基酸序列变异的分析第49-51页
     ·SLA-DQB基因的分子系统发育分析第51-52页
 5 讨论第52-57页
   ·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子RsaI-RFLP多态性第52-53页
   ·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子HinfI-RFLP多态性第53-54页
   ·六品种小型猪SLA-DQB基因的第二外显子双酶切多态性第54-55页
   ·SLA-DQB基因RFLP遗传多态分析第55-56页
   ·六品种小型猪SLA-DQB外显子序列分析第56页
   ·SLA-DQB基因的单倍型多样度分析第56-57页
 6 结论第57-58页
第三章 SLA-DRB基因第二外显子的群体遗传结构分析第58-75页
 1 试验材料和仪器第58页
   ·试验材料第58页
   ·载体和菌株第58页
   ·主要试剂和酶第58页
   ·主要仪器设备第58页
 2 实验方法第58-59页
   ·DNA的提取第58页
   ·SLA-DRB基因第二外显子扩增第58页
     ·引物设计及分析第58页
     ·PCR体系优化第58页
   ·SLA-DRB基因第二外显子的PCR-RFLP分型第58-59页
     ·酶切第59页
     ·PAGE电泳检验酶切结果第59页
 3 数据处理第59页
 4 实验结果与分析第59-62页
   ·猪基因组DNA第59页
   ·PCR扩增结果第59页
   ·SLA-DRB基因RsaI及MspI酶切多态性分析第59-60页
   ·基因及基因型频率的分布第60-62页
     ·各品种内基因型频率与基因频率的分布第60-61页
     ·各品种内双酶切基因型频率的分布第61页
     ·各品种内不同基因型分布的Hardy—Weinberg平衡检验第61-62页
     ·各品种小型猪SLA-DRB基因的遗传特性分析第62页
 5 SLA-DRB基因部分序列的测序结果第62-71页
   ·三品种小型猪SLA-DRB基因外显子2序列的碱基组成第62-66页
   ·三品种小型猪SLA-DRB基因外显子2序列的多态位点变异第66-67页
     ·序列多态位点信息表现第66-67页
     ·核苷酸变异类型第67页
   ·SLA-DRB基因外显子2的基因多样性分析第67-68页
   ·氨基酸序列变异的分析第68-70页
     ·氨基酸的组成含量分析第68-69页
     ·氨基酸位点的变异分析第69页
     ·SLA-DRB基因外显子2密码子使用偏倚性(Bias)第69-70页
   ·SLA-DRB基因的分子系统发育分析第70-71页
 6 讨论第71-73页
   ·三品种小型猪SLA-DRB基因的第二外显子PCR-RFLP多态性第71页
   ·三品种小型猪SLA-DRB基因的第二外显子双酶切多态性第71-72页
   ·三品种小型猪的遗传特性分析第72页
   ·SLA-DQB和SLA-DRB基因第二外显子的多态性比较第72-73页
   ·SLA-DQB基因和SLA-DRB基因的序列比较第73页
 7 结论第73-75页
参考文献第75-80页
致谢第80-81页
简历第81页

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