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两种新型多功能纤溶酶的鉴定及其分子生物学特性研究

CHAPTER ONE: INTRODUCTION AND LITERATURE REVIEWED第1-64页
 PARTⅠ: Usage and research of thrombolytic therapy第17-19页
     ·Current of thrombolytic therapy第17-18页
     ·Future Directions of Thrombolytic Therapy第18-19页
 PART Ⅱ: Main fibrinolytic enzymes第19-28页
     ·Coagulation and fibrinolytic system第19-21页
       ·Coagulation system第19页
       ·Fibrinolytic system第19-21页
     ·Main fibrinolytic agents第21-28页
       ·Streptokinase (SK)第21-22页
       ·Urokinase (UK)第22页
       ·Tissue-type plasminogen activator (t-PA)第22-23页
       ·Staphylokinase (SAK)第23页
       ·Nattokinase (NK)第23-28页
 PART Ⅲ: Targeted thrombolysis; third-generation thrombolytic drugs第28-45页
     ·Antibody-targeting technique第29-37页
       ·Antibody targeted thrombolytic agents第29-32页
       ·Phage display antibody libraries第32-37页
     ·Application of recombinant adenovirus in vascular diseases management第37-43页
       ·Gene therapy and applications第37-38页
       ·Adenovirus vectors第38-40页
       ·A New adenovirus vector system, AdEasy system第40页
       ·Adenovirus vectors usage in cardiovascular gene therapy第40-43页
     ·New report gene, gfp第43-45页
 PART Ⅳ: Vascular endothelial cells and oxidative injury第45-55页
     ·Free radical and its toxicities第45-46页
     ·Effects of anti-oxidants on the vascular diseases第46-47页
     ·The action of hemoproteins in vascular diseases第47-48页
     ·Endothelial cell injury by oxidation stress第48-52页
     ·Endothelial cell apoptosis第52-55页
 PART Ⅴ: Bacteria plasminogen activator and infection第55-63页
     ·Plasminogen and plasmin第55-56页
     ·The relationship between bacterial PAs and its infection第56-60页
     ·E. coli periplasmic proteases DegS is associated with infection第60-63页
 PART Ⅵ: Purpose of this research (中文)第63-64页
CHAPTER TWO: GENERAL MOLECULAR TECHNIQUES第64-88页
   ·Procedures for extraction of plasmid DNA第64-66页
     ·Alkaline method (small scale extraction)第64-65页
     ·Alkaline method (large scale extraction)第65-66页
   ·Digestion, recovering and ligation of DNAs第66-67页
     ·Digestion of plasmid DNAs第66页
     ·Recover of DNA fragments第66-67页
     ·Ligation of interesting gene (insert) to vector DNA第67页
   ·E. coli competent cells第67-68页
   ·Preparation of growth media第68-69页
     ·Luria-Bertani (LB) liquid medium第68页
     ·Mammalian cells culture media第68-69页
   ·SDS-PAGE第69-73页
   ·General buffers, solutions, and other reagents第73-75页
     ·General buffers第73-74页
     ·Organic reagents第74-75页
   ·The Phage display library第75-83页
     ·Growth of the library第75-77页
     ·Growth of secondary library第77页
     ·Selection on immunotubes第77-79页
     ·Further rounds of selection第79-80页
     ·Screening phage particles by ELISA第80-82页
     ·Production of soluble antibody fragments第82-83页
   ·A Practical guide for using the AdEasy system第83-88页
     ·General considerations第83-84页
     ·Generation of recombinants in bacterial cells第84页
     ·Viral production in 293 or 911 Cells第84-86页
     ·Preparation of high titer viral stocks第86-88页
CHAPTER THREE: IDENTIFICATION OF TWO NOVEL FIBRINOLYTIC ENZYMES FROM BACILLUS SUBTILIS QK02第88-113页
   ·Brief introduction第88-89页
   ·Materials and methods第89-94页
     ·Bacteriological technique第89页
     ·Chromatography第89-90页
     ·Enzyme assay第90-91页
     ·HPLC and SDS-PAGE第91页
     ·pH and temperature conditions第91页
     ·Inhibitors第91-92页
     ·Degradation products of fibrin第92页
     ·N-terminal amino acid sequence第92页
     ·PCR, cloning and sequencing第92-93页
     ·The protein structure homology modeling第93页
     ·Constructs and the gene expression第93-94页
   ·Results第94-110页
     ·Isolation and classification of the bacteria with the fibrinolytic activity第94-95页
     ·Purification of two fibrinolytic enzymes from B. subtilis QK02第95-97页
     ·Fibrinolytic activity of enzymes in vitro第97-100页
     ·Enzymatic characterization第100-102页
     ·Cloning and sequences of gene encoded QK-2第102-105页
     ·The putative three-dimensional (3D) model for subtilisin QK第105-109页
     ·Expression of qk gene encoded subtilisin QK第109-110页
   ·Discussion第110-113页
CHAPTER FOUR: SUBTILISIN QK INHIBITS THE EXOGENOUS NITRITE AND HYDROGEN PEROXIDE INDUCED PROTEIN NITRATION, IN VITRO AND IN VIVO第113-129页
   ·Brief introduction第113-114页
   ·Meterial and methods第114-119页
     ·Materials第114-115页
     ·Detection of nitrotyrosine formation in BSA第115页
     ·Detection of structural changes of BSA in Hb/NO_2~-/H_2O_2 system第115-116页
     ·Determination of met-hemoglobin formation第116-117页
     ·Comparison of subtilisin QK with other proteins in the ability of inhibiting met-hemoglobin formation第117页
     ·Detection of protein nitration in some tissues第117-118页
     ·Cellular assay第118-119页
     ·Statistical analysis第119页
   ·Results第119-126页
     ·Subtilisin QK inhibits tyrosine nitration in BSA第119-120页
     ·Fluorescence emission spectra of tyrosine and tryptophan residues in BSA第120-121页
     ·Subtilisin QK prevent the met-hemoglobin formation第121-123页
     ·Effect of subtilisin QK on the protein nitration in some tissues of mouse, in vivo第123-124页
     ·The effect of subtilisin QK on the human umbilical vein endothelial cell injury by NaNO_2 and H_2O_2第124-126页
   ·Discussion第126-129页
CHAPTER FIVE: THE PLASMINOGEN ACTIVATION FUNCTION OF DegS LACKING ITS N-TERMINAL TRNSMEMBRANE DOMAIN; A NOVEL FUNCTION OF E. coli ESSENTIAL degS GENE*第129-143页
   ·Brief introduction第129-131页
   ·Meterial and methods第131-133页
     ·Strains, plasmids and cloning第131-132页
     ·Purification of recombinant protein and enzyme assay第132-133页
     ·Statistical analysis第133页
   ·Results第133-140页
     ·Amplification and sequencing of degS gene第133-137页
     ·The recombinant protein, ΔTM-DegS, acts as plasminogen activator第137-140页
   ·Discussion第140-143页
CHAPTER SIX: IDENTIFICATION OF ANTI-FIBRIN MONOCLONIC ANTIBODY AND CONSTRUCTION OF RECOMNANT ADENOVIRUSES WITH qk AND ΔdegS GENE第143-162页
   ·Brief introduction第143-144页
   ·Meterial and methods第144-150页
     ·Library, bacteria strains, and other reagents第144-145页
     ·Preparation of human fibrin clots第145页
     ·Panning assay第145-146页
     ·Preparation of scFv-phage for monoclonal ELISA第146页
     ·Monoclonal scFv-phage ELISA第146-147页
     ·DNA sequencing assay第147页
     ·ScFv expression and Western-blot assay第147-148页
     ·ScFv production and purification第148页
     ·Purified scFv ELISA第148-149页
     ·Preparation of Competent Cells and Plasmid DNAs第149页
     ·Generation of Recombinant Adenoviral Plasmids by Homologous Recombination in E. coli第149-150页
   ·Results第150-159页
     ·Selection of fibrin specific binding clones from phage display library第150-151页
     ·Analysis of DNA sequences of the positive clones第151-153页
     ·Analysis the expression of soluble ScFv by SDS-PAGE and Western blot第153页
     ·Purification of soluble scFv by His-bond Ni affinity chromatography第153-154页
     ·Analysis of the binding activity of Purified scFv to fibrinogen and fibrin第154页
     ·Construction of eukaryotic recombinant vector pIRES-egfp-qk and pIRES-egfp-deg第154-156页
     ·Construction of the recombinant shuttle vectors for qk and degS genes第156-158页
     ·Homologous recombination in E. coli BJ5183 cells第158-159页
   ·Discussion第159-162页
CONCLUSIONS (中文)第162-164页
FINDING AND CREATIVITY (中文)第164-165页
REFERENCES第165-189页
PUBLICATIONS WITHIN STUDING AS PHD CANDIDATE第189-190页
ACKNOWLEDGEMENT (中文)第190-192页

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