摘 要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-8页 |
1 生物信息学与基因组序列可视化研究现状 | 第8-16页 |
·生物信息学与基因组序列信息数据 | 第8-10页 |
·基因组序列信息可视化研究现状 | 第10-13页 |
·开发具有良好操作性以及可重用性的基因组可视化软件 | 第13-14页 |
·小结 | 第14-16页 |
2 FeatureVista的需求分析 | 第16-22页 |
·基因组序列信息的可视化 | 第16-20页 |
·易操作、可重用的基因组序列信息可视化软件的需求 | 第20-21页 |
·小结 | 第21-22页 |
3 FeatureVista的可重用性与MVC架构 | 第22-32页 |
·软件的可重用性 | 第22-25页 |
·MVC架构设计模式 | 第25-29页 |
·针对易操作性、可重用性以及可扩展性的解决方案 | 第29-31页 |
·小结 | 第31-32页 |
4 FeatureVista的开发与实现 | 第32-41页 |
·JAVA语言实现MVC架构 | 第32页 |
·基于Biojava包进行软件设计与开发 | 第32-33页 |
·XML技术实现特征信息表以及用户界面配置 | 第33-36页 |
·视图的开发与实现 | 第36-37页 |
·属性监听技术实现各视图同步更新 | 第37-38页 |
·程序组织与总体构成 | 第38-40页 |
·小结 | 第40-41页 |
5 FeatureVista的应用与扩展 | 第41-48页 |
·良好的可操作性 | 第41-44页 |
·定制新的视图类,添加新的视图 | 第44-45页 |
·将FeatureVista扩展为蛋白质序列信息可视化工具 | 第45-46页 |
·工作流软件KDE的BioScience模块中集成FeatureVista | 第46-47页 |
·小结 | 第47-48页 |
6 总 结 | 第48-49页 |
致 谢 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-53页 |
附录1 攻读学位期间发表的论文目录 | 第53-54页 |
附录2 主要程序目录 | 第54-55页 |
附录3 序列文件格式 | 第55页 |