| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-58页 |
| ·引言 | 第15页 |
| ·细菌遗传多样性研究进展 | 第15-24页 |
| ·传统的微生物培养法 | 第16-17页 |
| ·PLFA 分析法 | 第17页 |
| ·DNA 中mol % G+C 丰度的分析 | 第17-18页 |
| ·核酸探针检测技术 | 第18-19页 |
| ·DNA 复性动力学研究 | 第19页 |
| ·基于PCR 技术的分子标记技术 | 第19-24页 |
| ·烟草根际和叶际微生物多样性研究 | 第24-25页 |
| ·微生物铁载体研究进展 | 第25-45页 |
| ·微生物铁载体的种类与结构 | 第25-28页 |
| ·铁载体的提取和纯化 | 第28-29页 |
| ·铁载体检测方法 | 第29-31页 |
| ·微生物铁载体的合成及相关基因 | 第31-43页 |
| ·PGPR 与铁载体 | 第43-45页 |
| ·铁吸收调控蛋白-Fur | 第45-50页 |
| ·E. coli 中fur 基因的调节 | 第46-49页 |
| ·其它细菌中的Fur | 第49-50页 |
| ·转座子诱变法基因克隆策略研究进展 | 第50-55页 |
| ·细菌转座子的插入机制和随机诱变作用 | 第50-51页 |
| ·转座子标签技术 | 第51-55页 |
| ·本研究的立题依据、研究内容和技术路线 | 第55-58页 |
| ·立题依据 | 第55页 |
| ·研究内容 | 第55-57页 |
| ·技术路线 | 第57-58页 |
| 第二章 烟草根际铁载体产生菌ARDRA 分析 | 第58-76页 |
| ·材料与方法 | 第59-65页 |
| ·土样 | 第59页 |
| ·培养基、试剂与仪器 | 第59-60页 |
| ·细菌的分离 | 第60页 |
| ·铁载体产生菌的筛选 | 第60-62页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第62页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第62-63页 |
| ·PCR 扩增体系和条件 | 第63页 |
| ·参考菌株的模拟酶切 | 第63-64页 |
| ·铁载体产生菌的ARDRA 分析 | 第64页 |
| ·16S rRNA 基因测序和序列分析 | 第64-65页 |
| ·结果与分析 | 第65-74页 |
| ·细菌的分离 | 第65页 |
| ·铁载体产生菌的筛选 | 第65页 |
| ·参考菌株的ARDRA 分析 | 第65-66页 |
| ·铁载体产生菌的ARDRA 和16S rRNA 基因序列分析 | 第66-73页 |
| ·铁载体产生菌分布分析 | 第73-74页 |
| ·讨论 | 第74-76页 |
| 第三章 Pseudomonas mediterranea G-229-21T 筛选、鉴定及其铁载体拮抗活性研究 | 第76-88页 |
| ·材料与方法 | 第77-81页 |
| ·菌种 | 第77页 |
| ·培养基 | 第77页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第77-78页 |
| ·菌株的分离和筛选 | 第78页 |
| ·铁载体的定性检测和定量分析 | 第78页 |
| ·菌株的鉴定 | 第78-79页 |
| ·铁载体的制备 | 第79-80页 |
| ·铁载体类型的检测 | 第80页 |
| ·铁载体对烟草疫霉的抑制作用 | 第80-81页 |
| ·结果与分析 | 第81-86页 |
| ·菌株的筛选 | 第81页 |
| ·铁载体的定性检测和定量分析 | 第81-82页 |
| ·菌株的鉴定 | 第82-85页 |
| ·铁载体的制备和类型的检测 | 第85页 |
| ·铁载体对烟草疫霉的拮抗作用 | 第85-86页 |
| ·讨论 | 第86-88页 |
| 第四章 P.mediterranea G-229-21T铁吸收调控蛋白基因克隆与Fur结构模拟 | 第88-97页 |
| ·材料与方法 | 第89-91页 |
| ·菌株和载体 | 第89页 |
| ·培养基及主要试剂 | 第89页 |
| ·细菌基因组DNA 提取 | 第89页 |
| ·fur 保守区域的克隆和序列测定 | 第89-90页 |
| ·fur 完整基因的克隆 | 第90页 |
| ·fur 序列分析和系统发育分析 | 第90-91页 |
| ·Fur 序列分析及结构模拟 | 第91页 |
| ·结果与分析 | 第91-96页 |
| ·fur 保守区域的克隆 | 第91-92页 |
| ·完整 fur 基因的克隆 | 第92-93页 |
| ·P. mediterranea 的 fur 基因的核苷酸序列 | 第93-94页 |
| ·P. mediterranea 的 fur 基因编码的 Fur 序列分析 | 第94-96页 |
| ·Fur 结构模拟 | 第96页 |
| ·讨论 | 第96-97页 |
| 第五章 P.mediterranea G-229-21T 铁载体缺失突变株筛选 | 第97-108页 |
| ·材料与方法 | 第98-104页 |
| ·菌株和质粒 | 第98页 |
| ·培养基及抗生素 | 第98-99页 |
| ·试剂及仪器 | 第99页 |
| ·抗药性试验 | 第99-100页 |
| ·铁载体检测 | 第100页 |
| ·转座子诱变 | 第100页 |
| ·铁载体合成能力变化突变株的复筛 | 第100-101页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第101页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第101页 |
| ·DNA 凝胶回收 | 第101-102页 |
| ·DNA 浓度的确定 | 第102页 |
| ·DH5α感受态制备 | 第102页 |
| ·特异性引物扩增验证 | 第102-103页 |
| ·luxA 扩增和测序验证 | 第103-104页 |
| ·结果 | 第104-106页 |
| ·铁载体合成缺失突变株的筛选 | 第104页 |
| ·突变株总基因组提取 | 第104-105页 |
| ·特异性引物扩增验证 | 第105页 |
| ·luxA PCR 扩增和测序验证 | 第105-106页 |
| ·讨论 | 第106-108页 |
| 第六章 结论和建议 | 第108-110页 |
| ·结论 | 第108-109页 |
| ·建议 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第132页 |
