| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 缩略词 | 第14-15页 |
| 目录 | 第15-18页 |
| 1 文献综述 | 第18-54页 |
| ·耐辐射球菌电离辐射抗性研究进展 | 第18-44页 |
| ·耐辐射球菌的发现 | 第18-19页 |
| ·耐辐射球菌的形态和结构 | 第19-20页 |
| ·耐辐射球菌的系统进化 | 第20-21页 |
| ·耐辐射球菌的电离辐射抗性与干旱抗性的关系 | 第21-22页 |
| ·耐辐射球菌的基因组、转录组和蛋白质组分析 | 第22-26页 |
| ·耐辐射球菌的抗性机制 | 第26-43页 |
| ·小节 | 第43-44页 |
| ·SbcCD及其同源蛋白与基因组稳定性的关系 | 第44-53页 |
| ·真细菌来源的SbcC和SbcD蛋白 | 第44页 |
| ·真核细胞和古细菌来源的Rad50和Mre11蛋白 | 第44-53页 |
| ·小节 | 第53页 |
| ·本课题的研究意义 | 第53-54页 |
| 2 耐辐射球菌sbcC和sbcD基因的生物信息学分析 | 第54-71页 |
| ·引言 | 第54页 |
| ·材料和方法 | 第54-55页 |
| ·数据库 | 第54-55页 |
| ·方法 | 第55页 |
| ·结果与分析 | 第55-66页 |
| ·DR1921和DR1922基因的序列分析 | 第55-56页 |
| ·密码子偏好性分析 | 第56-58页 |
| ·启动子预测 | 第58-59页 |
| ·蛋白结构域分析 | 第59-63页 |
| ·多序列同源比对和活性位点分析 | 第63-65页 |
| ·耐辐射球菌的SbcC和SbcD蛋白同源物的进化树分析 | 第65-66页 |
| ·讨论 | 第66-69页 |
| ·小节 | 第69-71页 |
| 3 耐辐射球菌sbcD基因突变株的构建及体内遗传学功能的分析 | 第71-94页 |
| ·引言 | 第71-73页 |
| ·材料和方法 | 第73-79页 |
| ·菌株,质粒和培养条件 | 第73-74页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第74-75页 |
| ·耐辐射球菌基因组DNA的提取 | 第75页 |
| ·DR1921突变株的构建 | 第75-76页 |
| ·耐辐射球菌转化 | 第76页 |
| ·~(60)Co电离辐射处理后生存率的测定 | 第76页 |
| ·紫外线处理后生存率的测定 | 第76页 |
| ·过氧化氢处理后生存率的测定 | 第76-77页 |
| ·丝裂霉素C处理后生存率的测定 | 第77页 |
| ·耐辐射球菌R1和突变体D的生长动力学曲线 | 第77页 |
| ·脉冲场凝胶电泳 | 第77-78页 |
| ·抗氧化活性分析 | 第78页 |
| ·过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性染色分析 | 第78-79页 |
| ·实验结果与分析 | 第79-91页 |
| ·sbcD突变株的构建和鉴定 | 第79-81页 |
| ·sbcD基因突变株对DNA损伤试剂敏感性显著增加 | 第81-85页 |
| ·sbcD突变株的抗氧化胁迫分析 | 第85-87页 |
| ·sbcD基因突变株D的生长动力学分析 | 第87-89页 |
| ·辐照胁迫下sbcD基因突变株的完整基因组恢复明显的延迟 | 第89-91页 |
| ·讨论 | 第91-93页 |
| ·小节 | 第93-94页 |
| 4 耐辐射球菌SbcCD复合体的体外酶学活性研究 | 第94-121页 |
| ·引言 | 第94-95页 |
| ·材料和方法 | 第95-101页 |
| ·菌株、质粒和培养条件 | 第95-96页 |
| ·实验材料和仪器 | 第96-97页 |
| ·耐辐射球菌sbcC和sbcD基因的克隆 | 第97页 |
| ·耐辐射球菌SbcC和SbcD蛋白的表达质粒的构建 | 第97-98页 |
| ·耐辐射球菌SbcC和SbcD蛋白的表达 | 第98页 |
| ·耐辐射球菌SbcC和SbcD蛋白的纯化 | 第98-99页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD蛋白复合体的重建 | 第99页 |
| ·寡核苷酸底物的合成与制备 | 第99-101页 |
| ·质粒底物 | 第101页 |
| ·核酸酶反应 | 第101页 |
| ·实验结果与分析 | 第101-117页 |
| ·耐辐射球菌的SbcC和SbcD的表达质粒构建 | 第101-103页 |
| ·耐辐射球菌的SbcC和sbcD蛋白的诱导表达 | 第103-105页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD蛋白复合体的体外重建和纯化 | 第105-106页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体具有ATP非依赖性的3'→5'核酸外切酶的活性 | 第106-108页 |
| ·不同二价金属离子对耐辐射球菌SbcCD复合体核酸外切酶的影响 | 第108-109页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体核酸内切酶的活性分析 | 第109-112页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体具有3'flap核酸酶活性 | 第112-113页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体具有识别特殊DNA结构的核酸酶活性 | 第113-114页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体具有发夹或茎环结构核酸酶活性 | 第114-115页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体具有蛋白封闭DNA末端的3'→5'核酸酶外切酶活性 | 第115-117页 |
| ·讨论 | 第117-120页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的构成 | 第117-118页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的核酸外切酶活性 | 第118-119页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的核酸内切酶活性 | 第119页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的3'flap核酸酶活性 | 第119-120页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的DNA二级结构核酸酶活性 | 第120页 |
| ·耐辐射球菌SbcCD复合体的蛋白封闭末端DNA的核酸外切酶活性 | 第120页 |
| ·小节 | 第120-121页 |
| 5 耐辐射球菌sbcD突变体基因表达谱差异分析 | 第121-146页 |
| ·引言 | 第121-122页 |
| ·材料和方法 | 第122-125页 |
| ·耐辐射球菌基因芯片的制备 | 第122页 |
| ·耐辐射球菌的处理 | 第122-123页 |
| ·耐辐射球菌的总RNA的分离 | 第123页 |
| ·芯片探针的制备 | 第123-124页 |
| ·芯片预杂交和杂交 | 第124-125页 |
| ·芯片扫描及数据分析 | 第125页 |
| ·实时定量PCR | 第125页 |
| ·结果与分析 | 第125-143页 |
| ·sbcD突变株转录谱分析 | 第125-130页 |
| ·电离辐射胁迫下sbcD突变株转录谱分析 | 第130-139页 |
| ·电离辐射胁迫下sbcD突变株与野生株R1的转录组的比较 | 第139-143页 |
| ·讨论 | 第143-145页 |
| ·小节 | 第145-146页 |
| 6 总结与展望 | 第146-149页 |
| 参考文献 | 第149-166页 |
| 博士期间发表的文章 | 第166页 |
