基于信号处理技术的生物序列相似性分析与基因识别
| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-10页 |
| 1 绪论 | 第10-20页 |
| ·生物信息学 | 第10-13页 |
| ·分子生物学中心法则 | 第13-16页 |
| ·生物信息学的主要研究问题 | 第16-18页 |
| ·本文研究内容及创新之处 | 第18-20页 |
| 2 生物信息学的分子生物技术与分析方法 | 第20-28页 |
| ·分子生物技术 | 第20-21页 |
| ·生物信息学中的分析方法 | 第21-27页 |
| ·数学统计方法 | 第22页 |
| ·智能优化算法 | 第22-23页 |
| ·信号处理方法 | 第23-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 3 生物序列的表示方法 | 第28-56页 |
| ·DNA 序列的表示方法 | 第28-40页 |
| ·数值表示方法 | 第29-30页 |
| ·图形表示方法 | 第30-37页 |
| ·基于迭代函数系统的方法 | 第37-40页 |
| ·RNA 二级结构序列的表示方法 | 第40-47页 |
| ·图形表示方法 | 第41-45页 |
| ·RNA-Z 曲线 | 第45-46页 |
| ·树表示法 | 第46-47页 |
| ·蛋白质序列的表示方法 | 第47-54页 |
| ·蛋白质序列的二维图形表示 | 第47-51页 |
| ·蛋白质序列的三维图形表示 | 第51-52页 |
| ·蛋白质序列的高维数学表示 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 4 生物序列的相似性分析 | 第56-88页 |
| ·生物序列比较 | 第56-58页 |
| ·序列比对方法 | 第57-58页 |
| ·非序列比对方法 | 第58页 |
| ·基于矩阵不变量的相似性分析 | 第58-61页 |
| ·特征矩阵 | 第59-60页 |
| ·不变量 | 第60-61页 |
| ·基于矩阵不变量的相似性分析 | 第61页 |
| ·系统发育树 | 第61-65页 |
| ·系统发育树的构建 | 第62-64页 |
| ·相关软件 | 第64页 |
| ·可靠性检测 | 第64-65页 |
| ·基于碱基对变换的RNA 二级结构序列相似性分析 | 第65-74页 |
| ·碱基对变换及其应用 | 第65-71页 |
| ·实例分析 | 第71-74页 |
| ·基于双边相似性函数的生物序列相似性分析 | 第74-86页 |
| ·双边相似性函数 | 第74-77页 |
| ·实例分析 | 第77-86页 |
| ·本章小结 | 第86-88页 |
| 5 符号动力学原理及其应用 | 第88-120页 |
| ·混沌 | 第88-91页 |
| ·混沌的定义 | 第88-90页 |
| ·混沌的主要特征 | 第90-91页 |
| ·符号动力学原理 | 第91-94页 |
| ·动力学系统 | 第92页 |
| ·基本思想 | 第92-94页 |
| ·基于符号动力学的DNA 序列相似性分析 | 第94-110页 |
| ·基于符号动力学的DNA 序列表示方法 | 第94-98页 |
| ·实例分析 | 第98-110页 |
| ·基于符号动力学的RNA 二级结构序列相似性分析 | 第110-118页 |
| ·基于符号动力学的RNA 二级结构序列表示方法 | 第110-113页 |
| ·截取长度的影响 | 第113-114页 |
| ·实例分析 | 第114-118页 |
| ·本章小结 | 第118-120页 |
| 6 基因识别 | 第120-140页 |
| ·研究现状 | 第120-122页 |
| ·方法分类 | 第120-122页 |
| ·评价指标 | 第122页 |
| ·自适应滤波器 | 第122-132页 |
| ·自适应滤波器的分类及其应用 | 第123-128页 |
| ·卡尔曼滤波器的理论基础 | 第128-132页 |
| ·基于扩展卡尔曼滤波器的基因识别 | 第132-138页 |
| ·基因识别模型 | 第132-133页 |
| ·扩展卡尔曼滤波器 | 第133-134页 |
| ·实例分析 | 第134-138页 |
| ·本章小结 | 第138-140页 |
| 7 总结与展望 | 第140-144页 |
| ·论文总结 | 第140-141页 |
| ·存在的问题和今后工作的展望 | 第141-144页 |
| 致谢 | 第144-146页 |
| 参考文献 | 第146-154页 |
| 附录 | 第154-155页 |
| A 作者在攻读博士学位期间参与的科研项目 | 第154页 |
| B 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第154-155页 |
