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立枯丝核菌AG1-lA胁迫下玉米miRNA的克隆、鉴定及功能分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-14页
第一部分 文献综述第14-34页
 1 玉米纹枯病第14-19页
   ·纹枯病对玉米生产的危害第14页
   ·玉米纹枯病的病源学特征和危害症状第14-15页
     ·玉米纹枯病的病源学特征第14-15页
     ·玉米纹枯病的危害症状第15页
   ·玉米纹枯病病源菌的致病机理第15-16页
   ·植物抗病研究第16-19页
     ·植物的抗病性第16-17页
     ·植物抗病的分子机理第17-18页
     ·纹枯病的抗性机制研究第18-19页
     ·玉米纹枯病抗病遗传研究第19页
 2 miRNA简介第19-32页
   ·miRNA的发现和发展第20-21页
   ·miRNA的结构特征及其基因组成形式第21-22页
   ·植物中的miRNA第22-25页
     ·植物中miRNA成熟过程第23-24页
     ·植物miRNA的作用机制第24-25页
       ·miRNA指导切割mRNA靶位点第24页
       ·miRNA的翻译抑制作用第24-25页
   ·逆境胁迫下的miRNA表达第25-26页
   ·植物miRNA的研究方法第26-32页
     ·miRNA的鉴定第26-27页
     ·miRNA的判定标准第27-28页
     ·miRNA的表达检测第28-30页
     ·miRNA功能分析方法第30-32页
       ·miRNA靶基因的预测第30-31页
       ·miRNA的抑制和过表达第31页
       ·miRNA的报告基因系统第31-32页
 3 本研究的目的意义第32页
 4 试验技术路第32-34页
第二部分 材料与方法第34-58页
 1 实验材料第34-38页
   ·玉米供试材料第34页
   ·玉米纹枯病病菌第34页
   ·克隆载体及宿主菌第34页
   ·培养基第34-35页
   ·主要酶和试剂第35页
     ·试剂盒第35页
     ·酶类及相关试剂第35页
   ·主要试剂配方第35-37页
   ·PCR引物第37-38页
     ·小分子RNA文库构建引物第37-38页
     ·荧光定量PCR引物第38页
   ·实验主要仪器设备第38页
 2 实验方法第38-58页
   ·纹枯病AG1-IA的培养和玉米纹枯病的接种第38页
   ·玉米材料总RNA的提取第38-39页
   ·低分子量RNA(≤200 nt)提取第39-40页
   ·小分子RNA文库构建第40-48页
     ·小分子RNA(18-26 nt)的分离第40-41页
     ·小分子RNA的克隆第41-48页
       ·小分子RNA的BAP处理第42页
       ·小分子RNA 3'Adaptor的连接第42-43页
       ·小分子RNA 3'MAGNOTEX-SA的吸附第43页
       ·小分子RNA 5'末端磷酸化第43-44页
       ·小分子RNA的反转录第44-45页
       ·PCR扩增第45-46页
       ·PCR片段的切胶回收及纯化第46页
       ·PCR片段的连接第46-47页
       ·CaCl_2法制备大肠杆菌DH5α感受态第47页
       ·热激转化和阳性克隆扩大培养第47-48页
   ·文库测序第48-49页
     ·菌液PCR第48-49页
       ·PCR反应体系第48-49页
       ·循环条件第49页
       ·琼脂糖电泳检测第49页
     ·送样测序第49页
   ·生物信息学分析第49-50页
     ·测序比对第49页
     ·候选miRNA二级结构预测第49-50页
     ·miRNA的靶基因预测第50页
   ·候选小分子RNA的表达分析第50-58页
     ·小分子RNA(≤200 nt)的加尾第51页
     ·逆转录反应第51-52页
     ·标准样品制备(标准质粒)第52-55页
       ·定量靶标模板和参比基因第52页
       ·引物设计第52页
       ·构建定量靶标模板和内参基因的克隆第52-55页
     ·标准曲线的绘制第55页
     ·SYBR Green I荧光定量检测第55-56页
       ·荧光定量PCR反应体系第56页
       ·荧光定量PCR反应条件第56页
     ·数据分析方法第56-58页
第三部分 结果与分析第58-81页
 1. 病菌胁迫下玉米小分子RNA文库构建第58-62页
   ·玉米纹枯病病菌的培养第58页
   ·总RNA的提取和≤200 nt的低分子量RNA的提取及检测第58-59页
   ·小分子RNA文库的构建第59-60页
     ·18-26 nt的小RNA回收第59页
     ·小RNA接头连接、RT-PCR扩增结果及产物的回收纯化第59-60页
   ·小RNA的cDNA文库组成分析第60-62页
 2. miRNA的鉴定第62-67页
   ·文库中已知的玉米miRNA第62-63页
   ·新发现的玉米miRNA第63-66页
   ·新发现的miRNA的保守性鉴定第66-67页
 3. 玉米miRNA靶基因预测第67-69页
 4. miRNA的表达分析第69-81页
   ·miRNA的真实性鉴定第69-70页
   ·候选miRNA的荧光定量PCR相对表达分析第70-81页
     ·5s rRNA和miRNA加尾产物扩增熔解曲线第70-71页
     ·荧光定量的标准曲线第71-72页
     ·miRNA的相对定量表达第72-81页
       ·zea-miR168a的相对表达量第73页
       ·miR-2的相对表达量第73-74页
       ·miR-3的相对表达量第74-75页
       ·miR-4的相对表达量第75页
       ·miR-5的相对表达量第75-76页
       ·miR-6的相对表达量第76-77页
       ·miR-7的相对表达量第77-78页
       ·miR-8的相对表达量第78-79页
       ·miR-9的相对表达量第79-81页
第四部分 讨论第81-92页
 1 材料体系分析第81-82页
 2 miRNAs的生物信息学鉴定与克隆鉴定第82页
 3 小分子RNA克隆方法和文库构建第82-83页
 4 病菌胁迫下鉴定的miRNAS第83-84页
 5 miRNA的靶基因第84-85页
 6 玉米纹枯病胁迫下miRNA介导的植物抗病信号传导途径第85-86页
 7 玉米纹枯病胁迫下miRNA介导的保护机制第86-89页
   ·活性氧调控机制与玉米的抗病性第86-87页
   ·泛素在纹枯病诱导的抗性机制中的作用第87-88页
   ·miRNA介导的植物抗病物质代谢第88-89页
 8 玉米纹枯病胁迫下miRNA介导的转录调控第89-90页
 9 玉米纹枯病的抗性机制探讨第90-92页
 10 miRNA介导的植物抗性机制探讨第92页
展望第92-93页
小结第93-94页
参考文献第94-103页
致谢第103-104页

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