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栉孔扇贝、海湾扇贝热休克蛋白22基因的克隆和表达及其与栉孔扇贝抗热性状相关SNP位点的筛查

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
第一前言第13-28页
 第一节 我国扇贝养殖现状及大规模死亡的原因第13-16页
  1. 我国扇贝养殖现状第13页
  2. 影响扇贝大规模死亡的因素第13-16页
   ·环境污染第14页
   ·病原微生物第14-15页
   ·扇贝生物本身的抗逆能力第15-16页
 第二节 热休克蛋白22第16-24页
  1. 热休克蛋白的发现及分类第17-18页
  2.H SP22 的结构特征和组织分布第18页
  3.H SP22 基因结构和表达调控第18-19页
  4.H SP22 的生物学功能第19-22页
   ·分子伴侣作用第20页
   ·调节细胞凋亡第20页
   ·HSP22 与衰老第20-21页
   ·HSP22 与生物耐热第21页
   ·抗氧化作用第21-22页
  5 HSP22的研究现状第22-24页
   ·HSP22 与肿瘤第22页
   ·HSP22 与腓骨肌萎缩症第22-23页
   ·HSP22 与心肌缺血再灌注损伤第23页
   ·HSP22 在海洋生物学方面的研究第23-24页
 第三节 单核苷酸多态性第24-27页
  1. 单核苷酸多态性的概念第24页
  2. 单核苷酸多态性的检测方法第24-26页
  3. 单核苷酸多态性的应用第26-27页
 第四节 本研究的目的和意义第27-28页
  1. 本研究的目的第27页
  2. 本研究的意义第27-28页
第二章 材料与方法第28-42页
 第一节 材料第28-31页
  1. 主要化学试剂与仪器设备第28页
   ·主要化学试剂第28页
   ·主要仪器设备第28页
  2. 试剂和培养基的配置第28-31页
   ·DNA 提取试剂及其配置方法第29页
   ·培养基及抗生素配置方法第29-30页
   ·其它主要试剂配置方法第30-31页
 第二节 方法第31-42页
  1. 应激实验样品及样品处理第31-32页
   ·重金属和细菌应激实验第31页
   ·高温刺激实验第31-32页
  2. 扇贝基因组 DNA 提取第32页
  3. 扇贝总 RNA 提取第32-33页
   ·实验用品的预处理第32页
   ·扇贝总 RNA 的提取第32-33页
   ·DNase I 消化第33页
  4.c DNA 文库的构建及序列分析第33-34页
   ·cDNA 文库的构建第33-34页
   ·序列分析与目的基因片段的获得第34页
  5.全长cDNA序列的获得第34-36页
   ·扇贝cDNA 模板第一链的合成第34页
   ·PCR 反应体系与反应条件第34-35页
   ·3' RACE 扩增第35页
   ·5' RACE 扩增第35-36页
  6. 琼脂糖凝胶纯化 PCR 产物第36-37页
  7. 感受态细胞的制备、连接及转化第37-38页
   ·感受态细胞的制备第37页
   ·连接反应第37页
   ·转化第37-38页
  8. 目的基因的生物信息学分析第38页
  9. 荧光实时定量 PCR 检测目的基因的表达第38-42页
   ·荧光实时定量 PCR 的原理第38-40页
   ·荧光实时定量 PCR 的引物设计第40-41页
   ·荧光实时定量 PCR 检测目的基因的表达第41-42页
第三章 结果与讨论第42-76页
 第一节 海湾扇贝热休克蛋白22 基因的克隆与表达分析第42-51页
  1. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因cDNA 全长的克隆第42-43页
   ·海湾扇贝热休克蛋白22 基因3’末端的克隆第42页
   ·海湾扇贝热休克蛋白22 基因5’末端的克隆第42-43页
  2. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因的序列分析第43-45页
  3. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因的同源性分析第45-47页
  4. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因的进化分析第47页
  5. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因在扇贝组织中的分布第47-49页
  6. 海湾扇贝热休克蛋白22 基因在重金属刺激下的表达规律研究第49-51页
 第二节 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因的克隆与表达分析第51-60页
  1. 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因cDNA 全长的克隆第51-52页
   ·栉孔扇贝热休克蛋白22 基因3’末端的克隆第51页
   ·栉孔扇贝热休克蛋白 22 基因 5’末端的克隆第51-52页
  2. 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因的序列分析第52-54页
  3. 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因的同源性分析第54-56页
  4. 栉孔扇贝热休克蛋白 22 的进化分析第56-57页
  5. 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因在扇贝组织中的分布第57-59页
  6. 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因在鳗弧菌刺激下的表达规律研究第59-60页
 第三节 栉孔扇贝 HSP22 基因的多态性分析第60-64页
  1. 栉孔扇贝 HSP22 基因潜在 SNP 位点的电子筛查第60-61页
  2. 栉孔扇贝 HSP22 基因有潜在 SNP 位点的序列的克隆第61-62页
  3. 序列比较与多态性分析第62-64页
 第四节 栉孔扇贝热休克蛋白22 基因的 SNP 位点+94 C/ A 与扇贝抗热性的关系第64-69页
  1. 热敏感群体和抗热群体的划分及取样第64-65页
  2. 采用 Bi-PASA PCR 技术对热休克蛋白22 基因+94 位点多态性进行检测第65-67页
   ·引物设计第65页
   ·PCR 扩增及电泳第65-66页
   ·栉孔扇贝热休克蛋白22 基因+94 位点多态性的检测结果第66-67页
  3.C fHSP22 基因+94 位点多态性与扇贝抗热性状的关系分析第67-68页
   ·统计基因位点的基因频率及基因型频率第67-68页
   ·对多态性位点的 Hardy-Weinberg 平衡性及与栉孔扇贝抗热性性状的关联性进行分析第68页
   ·CfHSP22 基因+94 位点多态性与扇贝抗热性状的关系分析结果第68页
  4. +94 位点不同基因型扇贝的死亡率比较第68-69页
 第五节 讨论第69-76页
  1. 海湾扇贝 HSP22 基因的克隆及其在重金属刺激下的表达研究第70-72页
  2. 栉孔扇贝 HSP22 基因的克隆及其在鳗弧菌刺激下的表达研究第72-74页
  3. 栉孔扇贝 HSP22 基因与抗热性状相关的 SNP 位点的筛查与验证第74-76页
第四章 结论第76-78页
参考文献第78-87页
个人简历第87页
发表的学术论文第87-88页
致谢第88页

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