摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-14页 |
第1章 绪论 | 第14-31页 |
·课题背景及意义 | 第14-16页 |
·研究背景 | 第14-15页 |
·研究意义 | 第15-16页 |
·单核苷酸多态性相关知识介绍 | 第16-20页 |
·国内外研究现状 | 第20-27页 |
·SNP 位点挖掘 | 第20-22页 |
·标签SNP 获取 | 第22-24页 |
·人群结构推断 | 第24-26页 |
·疾病人群分类 | 第26-27页 |
·本文主要工作 | 第27-31页 |
·研究内容 | 第27-28页 |
·研究成果 | 第28-31页 |
第2章 基于参数过滤与集成学习的SNP 位点挖掘方法 | 第31-51页 |
·引言 | 第31-32页 |
·基于参数过滤的SNP 候选位点获取算法 | 第32-36页 |
·SNP 位点挖掘方法 | 第36-43页 |
·SNP 位点特征分析 | 第37-39页 |
·基于集成学习的SNP 位点挖掘算法 | 第39-43页 |
·实验与分析 | 第43-50页 |
·实验数据及评估准则 | 第43-44页 |
·候选SNP 位点获取中参数的影响 | 第44-48页 |
·实验结果及分析 | 第48-50页 |
·本章小结 | 第50-51页 |
第3章 基于聚类与图模型的标签SNP 位点获取方法 | 第51-73页 |
·引言 | 第51-53页 |
·基于图模型的标签SNP 位点获取算法 | 第53-63页 |
·TagSNP 位点获取问题描述 | 第53-55页 |
·遗传差异集 | 第55-56页 |
·SNP 位点图构建 | 第56-58页 |
·TagSNP 位点获取 | 第58-63页 |
·数据预处理算法 | 第63-66页 |
·基于KNN 的数据预处理算法 | 第64-65页 |
·时间空间复杂性分析 | 第65-66页 |
·实验与分析 | 第66-72页 |
·实验数据及评估方法 | 第66-67页 |
·预处理算法中参数的影响 | 第67-70页 |
·实验结果分析 | 第70-72页 |
·本章小结 | 第72-73页 |
第4章 基于特征与层次聚类的人群结构推断方法 | 第73-96页 |
·引言 | 第73-75页 |
·基于特征和层次聚类的人群结构推断方法 | 第75-85页 |
·人群结构推断中序列特征的选择 | 第75-76页 |
·人群基因型序列距离矩阵 | 第76-80页 |
·基于层次聚类的人群结构推断算法 | 第80-85页 |
·实验和讨论 | 第85-95页 |
·实验数据及软件简介 | 第85-87页 |
·在模拟数据集上结果及分析 | 第87-89页 |
·在人类真实数据集上结果及分析 | 第89-95页 |
·本章小结 | 第95-96页 |
第5章 基于线粒体DNA 序列分析的疾病人群分类方法 | 第96-121页 |
·引言 | 第96-98页 |
·线粒体DNA 特性分析及其比对算法 | 第98-104页 |
·线粒体DNA 特性分析 | 第98-102页 |
·基于关键字树的mtDNA 比对算法 | 第102-104页 |
·基于线粒体DNA 序列分析的疾病人群分类方法 | 第104-116页 |
·基于mtDNA 序列特性的mtSNP 获取算法 | 第104-106页 |
·基于统计显著性的疾病关联mtSNP 定位算法 | 第106-112页 |
·基于疾病关联mtSNP 分析的疾病人群分类算法 | 第112-116页 |
·实验及讨论 | 第116-119页 |
·实验数据及评估方法 | 第116-117页 |
·帕金森症人群分类实验及讨论 | 第117-119页 |
·本章小结 | 第119-121页 |
结论 | 第121-123页 |
参考文献 | 第123-133页 |
攻读博士学位期间发表的论文及其它成果 | 第133-135页 |
致谢 | 第135-136页 |
个人简历 | 第136页 |